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  1. van Kalsbeek, Rebecca J.; Hudson, Melissa M.; Mulder, Renée L.; Ehrhardt, Matthew; Green, Daniel M.; Mulrooney, Daniel A.; Hakkert, Jessica; den Hartogh, Jaap; Nijenhuis, Anouk; van Santen, Hanneke M.; Schouten-van Meeteren, Antoinette Y. N.; van Tinteren, Harm; Verbruggen, Lisanne C.; Conklin, Heather M.; Jacola, Lisa M.; Webster, Rachel Tillery; Partanen, Marita; Kollen, Wouter J. W.; Grootenhuis, Martha A.; Pieters, Rob; Kremer, Leontien C. M.; van Kalsbeek, Rebecca J.; den Hartogh, Jaap; van Santen, Hanneke M.; [...]

    Author Correction: A joint international consensus statement for measuring quality of survival for patients with childhood cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2024

    Erschienen in: Nature Medicine

  2. van Kalsbeek, Rebecca J.; Hudson, Melissa M.; Mulder, Renée L.; Ehrhardt, Matthew; Green, Daniel M.; Mulrooney, Daniel A.; Hakkert, Jessica; den Hartogh, Jaap; Nijenhuis, Anouk; van Santen, Hanneke M.; Schouten-van Meeteren, Antoinette Y. N.; van Tinteren, Harm; Verbruggen, Lisanne C.; Conklin, Heather M.; Jacola, Lisa M.; Webster, Rachel Tillery; Partanen, Marita; Kollen, Wouter J. W.; Grootenhuis, Martha A.; Pieters, Rob; Kremer, Leontien C. M.; van Kalsbeek, Rebecca J.; den Hartogh, Jaap; van Santen, Hanneke M.; [...]

    A joint international consensus statement for measuring quality of survival for patients with childhood cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature Medicine

  3. Raphael, Benjamin J.; Hruban, Ralph H.; Aguirre, Andrew J.; Moffitt, Richard A.; Yeh, Jen Jen; Stewart, Chip; Robertson, A. Gordon; Cherniack, Andrew D.; Gupta, Manaswi; Getz, Gad; Gabriel, Stacey B.; Meyerson, Matthew; Cibulskis, Carrie; Fei, Suzanne S.; Hinoue, Toshinori; Shen, Hui; Laird, Peter W.; Ling, Shiyun; Lu, Yiling; Mills, Gordon B.; Akbani, Rehan; Loher, Phillipe; Londin, Eric R.; Rigoutsos, Isidore; [...]

    Integrated Genomic Characterization of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma

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    Elsevier BV, 2017

    Erschienen in: Cancer Cell

  4. Abeshouse, Adam; Adebamowo, Clement; Adebamowo, Sally N.; Akbani, Rehan; Akeredolu, Teniola; Ally, Adrian; Anderson, Matthew L.; Anur, Pavana; Appelbaum, Elizabeth L.; Armenia, Joshua; Auman, J. Todd; Bailey, Matthew H.; Baker, Laurence; Balasundaram, Miruna; Balu, Saianand; Barthel, Floris P.; Bartlett, John; Baylin, Stephen B.; Behera, Madhusmita; Belyaev, Dmitry; Bennett, Joesph; Benz, Christopher; Beroukhim, Rameen; Birrer, Michael; [...]

    Comprehensive and Integrated Genomic Characterization of Adult Soft Tissue Sarcomas

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    Elsevier BV, 2017

    Erschienen in: Cell

  5. Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Toussaint, Nora C.; Hüser, Matthias; Stark, Stefan G.; Sachsenberg, Timo; Stegle, Oliver; Kohlbacher, Oliver; Sander, Chris; Rätsch, Gunnar; Caesar-Johnson, Samantha J.; Demchok, John A.; Felau, Ina; Kasapi, Melpomeni; Ferguson, Martin L.; Hutter, Carolyn M.; Sofia, Heidi J.; Tarnuzzer, Roy; Wang, Zhining; Yang, Liming; Zenklusen, Jean C.; Zhang, Jiashan (Julia); Chudamani, Sudha; Liu, Jia; [...]

    Comprehensive Analysis of Alternative Splicing Across Tumors from 8,705 Patients

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cancer Cell

  6. Way, Gregory P.; Sanchez-Vega, Francisco; La, Konnor; Armenia, Joshua; Chatila, Walid K.; Luna, Augustin; Sander, Chris; Cherniack, Andrew D.; Mina, Marco; Ciriello, Giovanni; Schultz, Nikolaus; Sanchez, Yolanda; Greene, Casey S.; Caesar-Johnson, Samantha J.; Demchok, John A.; Felau, Ina; Kasapi, Melpomeni; Ferguson, Martin L.; Hutter, Carolyn M.; Sofia, Heidi J.; Tarnuzzer, Roy; Wang, Zhining; Yang, Liming; Zenklusen, Jean C.; [...]

    Machine Learning Detects Pan-cancer Ras Pathway Activation in The Cancer Genome Atlas

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell Reports

  7. Sanchez-Vega, Francisco; Mina, Marco; Armenia, Joshua; Chatila, Walid K.; Luna, Augustin; La, Konnor C.; Dimitriadoy, Sofia; Liu, David L.; Kantheti, Havish S.; Saghafinia, Sadegh; Chakravarty, Debyani; Daian, Foysal; Gao, Qingsong; Bailey, Matthew H.; Liang, Wen-Wei; Foltz, Steven M.; Shmulevich, Ilya; Ding, Li; Heins, Zachary; Ochoa, Angelica; Gross, Benjamin; Gao, Jianjiong; Zhang, Hongxin; Kundra, Ritika; [...]

    Oncogenic Signaling Pathways in The Cancer Genome Atlas

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell

  8. Ricketts, Christopher J.; De Cubas, Aguirre A.; Fan, Huihui; Smith, Christof C.; Lang, Martin; Reznik, Ed; Bowlby, Reanne; Gibb, Ewan A.; Akbani, Rehan; Beroukhim, Rameen; Bottaro, Donald P.; Choueiri, Toni K.; Gibbs, Richard A.; Godwin, Andrew K.; Haake, Scott; Hakimi, A. Ari; Henske, Elizabeth P.; Hsieh, James J.; Ho, Thai H.; Kanchi, Rupa S.; Krishnan, Bhavani; Kwiatkowski, David J.; Liu, Wenbin; Merino, Maria J.; [...]

    The Cancer Genome Atlas Comprehensive Molecular Characterization of Renal Cell Carcinoma

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell Reports

  9. Ricketts, Christopher J.; De Cubas, Aguirre A.; Fan, Huihui; Smith, Christof C.; Lang, Martin; Reznik, Ed; Bowlby, Reanne; Gibb, Ewan A.; Akbani, Rehan; Beroukhim, Rameen; Bottaro, Donald P.; Choueiri, Toni K.; Gibbs, Richard A.; Godwin, Andrew K.; Haake, Scott; Hakimi, A. Ari; Henske, Elizabeth P.; Hsieh, James J.; Ho, Thai H.; Kanchi, Rupa S.; Krishnan, Bhavani; Kwiatkowski, David J.; Liu, Wenbin; Merino, Maria J.; [...]

    The Cancer Genome Atlas Comprehensive Molecular Characterization of Renal Cell Carcinoma

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell Reports

  10. Huang, Kuan-lin; Mashl, R. Jay; Wu, Yige; Ritter, Deborah I.; Wang, Jiayin; Oh, Clara; Paczkowska, Marta; Reynolds, Sheila; Wyczalkowski, Matthew A.; Oak, Ninad; Scott, Adam D.; Krassowski, Michal; Cherniack, Andrew D.; Houlahan, Kathleen E.; Jayasinghe, Reyka; Wang, Liang-Bo; Zhou, Daniel Cui; Liu, Di; Cao, Song; Kim, Young Won; Koire, Amanda; McMichael, Joshua F.; Hucthagowder, Vishwanathan; Kim, Tae-Beom; [...]

    Pathogenic Germline Variants in 10,389 Adult Cancers

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell

  11. Thorsson, Vésteinn; Gibbs, David L.; Brown, Scott D.; Wolf, Denise; Bortone, Dante S.; Ou Yang, Tai-Hsien; Porta-Pardo, Eduard; Gao, Galen F.; Plaisier, Christopher L.; Eddy, James A.; Ziv, Elad; Culhane, Aedin C.; Paull, Evan O.; Sivakumar, I.K. Ashok; Gentles, Andrew J.; Malhotra, Raunaq; Farshidfar, Farshad; Colaprico, Antonio; Parker, Joel S.; Mose, Lisle E.; Vo, Nam Sy; Liu, Jianfang; Liu, Yuexin; Rader, Janet; [...]

    The Immune Landscape of Cancer

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    Elsevier BV, 2019

    Erschienen in: Immunity

  12. Hoadley, Katherine A.; Yau, Christina; Hinoue, Toshinori; Wolf, Denise M.; Lazar, Alexander J.; Drill, Esther; Shen, Ronglai; Taylor, Alison M.; Cherniack, Andrew D.; Thorsson, Vésteinn; Akbani, Rehan; Bowlby, Reanne; Wong, Christopher K.; Wiznerowicz, Maciej; Sanchez-Vega, Francisco; Robertson, A. Gordon; Schneider, Barbara G.; Lawrence, Michael S.; Noushmehr, Houtan; Malta, Tathiane M.; Stuart, Joshua M.; Benz, Christopher C.; Laird, Peter W.; Caesar-Johnson, Samantha J.; [...]

    Cell-of-Origin Patterns Dominate the Molecular Classification of 10,000 Tumors from 33 Types of Cancer

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell

  13. Liu, Yang; Sethi, Nilay S.; Hinoue, Toshinori; Schneider, Barbara G.; Cherniack, Andrew D.; Sanchez-Vega, Francisco; Seoane, Jose A.; Farshidfar, Farshad; Bowlby, Reanne; Islam, Mirazul; Kim, Jaegil; Chatila, Walid; Akbani, Rehan; Kanchi, Rupa S.; Rabkin, Charles S.; Willis, Joseph E.; Wang, Kenneth K.; McCall, Shannon J.; Mishra, Lopa; Ojesina, Akinyemi I.; Bullman, Susan; Pedamallu, Chandra Sekhar; Lazar, Alexander J.; Sakai, Ryo; [...]

    Comparative Molecular Analysis of Gastrointestinal Adenocarcinomas

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cancer Cell

  14. Bailey, Matthew H.; Tokheim, Collin; Porta-Pardo, Eduard; Sengupta, Sohini; Bertrand, Denis; Weerasinghe, Amila; Colaprico, Antonio; Wendl, Michael C.; Kim, Jaegil; Reardon, Brendan; Ng, Patrick Kwok-Shing; Jeong, Kang Jin; Cao, Song; Wang, Zixing; Gao, Jianjiong; Gao, Qingsong; Wang, Fang; Liu, Eric Minwei; Mularoni, Loris; Rubio-Perez, Carlota; Nagarajan, Niranjan; Cortés-Ciriano, Isidro; Zhou, Daniel Cui; Liang, Wen-Wei; [...]

    Comprehensive Characterization of Cancer Driver Genes and Mutations

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell

  15. Bailey, Matthew H.; Tokheim, Collin; Porta-Pardo, Eduard; Sengupta, Sohini; Bertrand, Denis; Weerasinghe, Amila; Colaprico, Antonio; Wendl, Michael C.; Kim, Jaegil; Reardon, Brendan; Kwok-Shing Ng, Patrick; Jeong, Kang Jin; Cao, Song; Wang, Zixing; Gao, Jianjiong; Gao, Qingsong; Wang, Fang; Liu, Eric Minwei; Mularoni, Loris; Rubio-Perez, Carlota; Nagarajan, Niranjan; Cortés-Ciriano, Isidro; Zhou, Daniel Cui; Liang, Wen-Wei; [...]

    Comprehensive Characterization of Cancer Driver Genes and Mutations

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell

  16. Wang, Yumeng; Xu, Xiaoyan; Maglic, Dejan; Dill, Michael T.; Mojumdar, Kamalika; Ng, Patrick Kwok-Shing; Jeong, Kang Jin; Tsang, Yiu Huen; Moreno, Daniela; Bhavana, Venkata Hemanjani; Peng, Xinxin; Ge, Zhongqi; Chen, Hu; Li, Jun; Chen, Zhongyuan; Zhang, Huiwen; Han, Leng; Du, Di; Creighton, Chad J.; Mills, Gordon B.; Camargo, Fernando; Liang, Han; Caesar-Johnson, Samantha J.; Demchok, John A.; [...]

    Comprehensive Molecular Characterization of the Hippo Signaling Pathway in Cancer

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell Reports

  17. Berger, Ashton C.; Korkut, Anil; Kanchi, Rupa S.; Hegde, Apurva M.; Lenoir, Walter; Liu, Wenbin; Liu, Yuexin; Fan, Huihui; Shen, Hui; Ravikumar, Visweswaran; Rao, Arvind; Schultz, Andre; Li, Xubin; Sumazin, Pavel; Williams, Cecilia; Mestdagh, Pieter; Gunaratne, Preethi H.; Yau, Christina; Bowlby, Reanne; Robertson, A. Gordon; Tiezzi, Daniel G.; Wang, Chen; Cherniack, Andrew D.; Godwin, Andrew K.; [...]

    A Comprehensive Pan-Cancer Molecular Study of Gynecologic and Breast Cancers

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cancer Cell

  18. Gao, Qingsong; Liang, Wen-Wei; Foltz, Steven M.; Mutharasu, Gnanavel; Jayasinghe, Reyka G.; Cao, Song; Liao, Wen-Wei; Reynolds, Sheila M.; Wyczalkowski, Matthew A.; Yao, Lijun; Yu, Lihua; Sun, Sam Q.; Chen, Ken; Lazar, Alexander J.; Fields, Ryan C.; Wendl, Michael C.; Van Tine, Brian A.; Vij, Ravi; Chen, Feng; Nykter, Matti; Shmulevich, Ilya; Ding, Li; Caesar-Johnson, Samantha J.; Demchok, John A.; [...]

    Driver Fusions and Their Implications in the Development and Treatment of Human Cancers

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell Reports

  19. Taylor, Alison M.; Shih, Juliann; Ha, Gavin; Gao, Galen F.; Zhang, Xiaoyang; Berger, Ashton C.; Schumacher, Steven E.; Wang, Chen; Hu, Hai; Liu, Jianfang; Lazar, Alexander J.; Cherniack, Andrew D.; Beroukhim, Rameen; Meyerson, Matthew; Caesar-Johnson, Samantha J.; Demchok, John A.; Felau, Ina; Kasapi, Melpomeni; Ferguson, Martin L.; Hutter, Carolyn M.; Sofia, Heidi J.; Tarnuzzer, Roy; Wang, Zhining; Yang, Liming; [...]

    Genomic and Functional Approaches to Understanding Cancer Aneuploidy

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cancer Cell

  20. Knijnenburg, Theo A.; Wang, Linghua; Zimmermann, Michael T.; Chambwe, Nyasha; Gao, Galen F.; Cherniack, Andrew D.; Fan, Huihui; Shen, Hui; Way, Gregory P.; Greene, Casey S.; Liu, Yuexin; Akbani, Rehan; Feng, Bin; Donehower, Lawrence A.; Miller, Chase; Shen, Yang; Karimi, Mostafa; Chen, Haoran; Kim, Pora; Jia, Peilin; Shinbrot, Eve; Zhang, Shaojun; Liu, Jianfang; Hu, Hai; [...]

    Genomic and Molecular Landscape of DNA Damage Repair Deficiency across The Cancer Genome Atlas

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell Reports