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  1. Schmitz-Esser, Stephan; Tischler, Patrick; Arnold, Roland; Montanaro, Jacqueline; Wagner, Michael; Rattei, Thomas; Horn, Matthias

    The Genome of the Amoeba Symbiont “CandidatusAmoebophilus asiaticus” Reveals Common Mechanisms for Host Cell Interaction among Amoeba-Associated Bacteria

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    American Society for Microbiology, 2010

    Erschienen in: Journal of Bacteriology, 192 (2010) 4, Seite 1045-1057

  2. Rattei, Thomas; Walter, Mathias; Arnold, Roland; Anderson, David P.; Mewes, Werner

    Lecture Notes in Computer Science: Using Public Resource Computing and Systematic Pre-calculation for Large Scale Sequence Analysis

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    Springer Berlin Heidelberg, 2007

    Erschienen in: Lecture Notes in Computer Science (2007), Seite 11-18

  3. Lehner, Angelika; Grimm, Maya; Rattei, Thomas; Ruepp, Andreas; Frishman, Dmitrij; Manzardo, Giuseppe G.G.; Stephan, Roger

    Cloning and characterization ofEnterobacter sakazakiipigment genes andin situspectroscopic analysis of the pigment

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    Oxford University Press (OUP), 2006

    Erschienen in: FEMS Microbiology Letters, 265 (2006) 2, Seite 244-248

  4. Arnold, Roland; Rattei, Thomas; Tischler, Patrick; Truong, Minh-Duc; Stümpflen, Volker; Mewes, Werner

    SIMAP—The similarity matrix of proteins

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    Oxford University Press (OUP), 2005

    Erschienen in: Bioinformatics, 21 (2005) suppl_2, Seite ii42-ii46

  5. Herrera, Paul; Schuster, Lisa; Zojer, Markus; Na, Hyunsoo; Schwarz, Jasmin; Wascher, Florian; Kempinger, Thomas; Regner, Andreas; Rattei, Thomas; Horn, Matthias

    Genome Dynamics and Temperature Adaptation During Experimental Evolution of Obligate Intracellular Bacteria

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    Oxford University Press (OUP), 2023

    Erschienen in: Genome Biology and Evolution, 15 (2023) 8

  6. Weinmaier, Thomas; Probst, Alexander J.; La Duc, Myron T.; Ciobanu, Doina; Cheng, Jan-Fang; Ivanova, Natalia; Rattei, Thomas; Vaishampayan, Parag

    A viability-linked metagenomic analysis of cleanroom environments: eukarya, prokaryotes, and viruses

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    Springer Science and Business Media LLC, 2015

    Erschienen in: Microbiome, 3 (2015) 1

  7. Pascelli, Cecília; Laffy, Patrick W.; Botté, Emmanuelle; Kupresanin, Marija; Rattei, Thomas; Lurgi, Miguel; Ravasi, Timothy; Webster, Nicole S.

    Viral ecogenomics across the Porifera

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Microbiome, 8 (2020) 1

  8. Lucaciu, Rares; Pelikan, Claus; Gerner, Samuel M.; Zioutis, Christos; Köstlbacher, Stephan; Marx, Harald; Herbold, Craig W.; Schmidt, Hannes; Rattei, Thomas

    A Bioinformatics Guide to Plant Microbiome Analysis

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    Frontiers Media SA, 2019

    Erschienen in: Frontiers in Plant Science, 10 (2019)

  9. Mahnert, Alexander; Moissl-Eichinger, Christine; Zojer, Markus; Bogumil, David; Mizrahi, Itzhak; Rattei, Thomas; Martinez, José Luis; Berg, Gabriele

    Man-made microbial resistances in built environments

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    Springer Science and Business Media LLC, 2019

    Erschienen in: Nature Communications, 10 (2019) 1

  10. Laffy, Patrick W.; Botté, Emmanuelle S.; Wood‐Charlson, Elisha M.; Weynberg, Karen D.; Rattei, Thomas; Webster, Nicole S.

    Thermal stress modifies the marine sponge virome

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    Wiley, 2019

    Erschienen in: Environmental Microbiology Reports, 11 (2019) 5, Seite 690-698