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Gerstung, Moritz; Jolly, Clemency; Leshchiner, Ignaty; Dentro, Stefan C.; Gonzalez, Santiago; Rosebrock, Daniel; Mitchell, Thomas J.; Rubanova, Yulia; Anur, Pavana; Yu, Kaixian; Tarabichi, Maxime; Deshwar, Amit; Wintersinger, Jeff; Kleinheinz, Kortine; Vázquez-García, Ignacio; Haase, Kerstin; Jerman, Lara; Sengupta, Subhajit; Macintyre, Geoff; Malikic, Salem; Donmez, Nilgun; Livitz, Dimitri G.; Cmero, Marek; Demeulemeester, Jonas; [...]Author Correction: The evolutionary history of 2,658 cancersOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature
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Zapatka, Marc; Borozan, Ivan; Brewer, Daniel S.; Iskar, Murat; Grundhoff, Adam; Alawi, Malik; Desai, Nikita; Sültmann, Holger; Moch, Holger; Alawi, Malik; Borozan, Ivan; Brewer, Daniel S.; Cooper, Colin S.; Desai, Nikita; Eils, Roland; Ferretti, Vincent; Grundhoff, Adam; Iskar, Murat; Kleinheinz, Kortine; Lichter, Peter; Nakagawa, Hidewaki; Ojesina, Akinyemi I.; Pedamallu, Chandra Sekhar; Schlesner, Matthias; [...]Author Correction: The landscape of viral associations in human cancersOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Genetics
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Alexandrov, Ludmil B.; Kim, Jaegil; Haradhvala, Nicholas J.; Huang, Mi Ni; Tian Ng, Alvin Wei; Wu, Yang; Boot, Arnoud; Covington, Kyle R.; Gordenin, Dmitry A.; Bergstrom, Erik N.; Islam, S. M. Ashiqul; Lopez-Bigas, Nuria; Klimczak, Leszek J.; McPherson, John R.; Morganella, Sandro; Sabarinathan, Radhakrishnan; Wheeler, David A.; Mustonen, Ville; Alexandrov, Ludmil B.; Bergstrom, Erik N.; Boot, Arnoud; Boutros, Paul; Chan, Kin; Covington, Kyle R.; [...]Author Correction: The repertoire of mutational signatures in human cancerOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature
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Jiao, Wei; Atwal, Gurnit; Polak, Paz; Karlic, Rosa; Cuppen, Edwin; Al-Shahrour, Fatima; Atwal, Gurnit; Bailey, Peter J.; Biankin, Andrew V.; Boutros, Paul C.; Campbell, Peter J.; Chang, David K.; Cooke, Susanna L.; Deshpande, Vikram; Faltas, Bishoy M.; Faquin, William C.; Garraway, Levi; Getz, Gad; Grimmond, Sean M.; Haider, Syed; Hoadley, Katherine A.; Jiao, Wei; Kaiser, Vera B.; Karlic, Rosa; [...]Author Correction: A deep learning system accurately classifies primary and metastatic cancers using passenger mutation patternsOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Bhandari, Vinayak; Li, Constance H.; Bristow, Robert G.; Boutros, Paul C.; Aaltonen, Lauri A.; Abascal, Federico; Abeshouse, Adam; Aburatani, Hiroyuki; Adams, David J.; Agrawal, Nishant; Ahn, Keun Soo; Ahn, Sung-Min; Aikata, Hiroshi; Akbani, Rehan; Akdemir, Kadir C.; Al-Ahmadie, Hikmat; Al-Sedairy, Sultan T.; Al-Shahrour, Fatima; Alawi, Malik; Albert, Monique; Aldape, Kenneth; Alexandrov, Ludmil B.; Ally, Adrian; Alsop, Kathryn; [...]Author Correction: Divergent mutational processes distinguish hypoxic and normoxic tumoursOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Sieverling, Lina; Hong, Chen; Koser, Sandra D.; Ginsbach, Philip; Kleinheinz, Kortine; Hutter, Barbara; Braun, Delia M.; Cortés-Ciriano, Isidro; Xi, Ruibin; Kabbe, Rolf; Park, Peter J.; Eils, Roland; Schlesner, Matthias; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; [...]Author Correction: Genomic footprints of activated telomere maintenance mechanisms in cancerOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Zhang, Yiqun; Chen, Fengju; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Fujita, Masashi; Nakagawa, Hidewaki; Zhang, Zemin; Brazma, Alvis; Amin, Samirkumar B.; Awadalla, Philip; Bailey, Peter J.; Brazma, Alvis; Brooks, Angela N.; Calabrese, Claudia; Chateigner, Aurélien; Cortés-Ciriano, Isidro; Craft, Brian; Craft, David; Creighton, Chad J.; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Erkek, Serap; Fonseca, Nuno A.; Frenkel-Morgenstern, Milana; [...]Author Correction: High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterationsOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Cmero, Marek; Yuan, Ke; Ong, Cheng Soon; Schröder, Jan; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Campbell, Peter J.; Cao, Shaolong; Christie, Elizabeth L.; Cun, Yupeng; Dawson, Kevin J.; Demeulemeester, Jonas; Dentro, Stefan C.; Deshwar, Amit G.; Donmez, Nilgun; Drews, Ruben M.; Eils, Roland; Fan, Yu; Fittall, Matthew W.; Garsed, Dale W.; Gerstung, Moritz; [...]Author Correction: Inferring structural variant cancer cell fractionOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Rubanova, Yulia; Shi, Ruian; Harrigan, Caitlin F.; Li, Roujia; Wintersinger, Jeff; Sahin, Nil; Deshwar, Amit G.; Dentro, Stefan C.; Leshchiner, Ignaty; Gerstung, Moritz; Jolly, Clemency; Haase, Kerstin; Tarabichi, Maxime; Wintersinger, Jeff; Deshwar, Amit G.; Yu, Kaixian; Gonzalez, Santiago; Rubanova, Yulia; Macintyre, Geoff; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D.; [...]Author Correction: Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSigOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Bailey, Matthew H.; Meyerson, William U.; Dursi, Lewis Jonathan; Wang, Liang-Bo; Dong, Guanlan; Liang, Wen-Wei; Weerasinghe, Amila; Li, Shantao; Li, Yize; Kelso, Sean; Akbani, Rehan; Anur, Pavana; Bailey, Matthew H.; Buchanan, Alex; Chiotti, Kami; Covington, Kyle; Creason, Allison; Ding, Li; Ellrott, Kyle; Fan, Yu; Foltz, Steven; Getz, Gad; Hale, Walker; Haussler, David; [...]Author Correction: Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samplesOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Cortés-Ciriano, Isidro; Lee, Jake June-Koo; Xi, Ruibin; Jain, Dhawal; Jung, Youngsook L.; Yang, Lixing; Gordenin, Dmitry; Klimczak, Leszek J.; Zhang, Cheng-Zhong; Pellman, David S.; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; Cortés-Ciriano, Isidro; Dueso-Barroso, Ana; Dunford, Andrew J.; [...]Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencingOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Genetics
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Yuan, Yuan; Ju, Young Seok; Kim, Youngwook; Li, Jun; Wang, Yumeng; Yoon, Christopher J.; Yang, Yang; Martincorena, Inigo; Creighton, Chad J.; Weinstein, John N.; Xu, Yanxun; Han, Leng; Kim, Hyung-Lae; Nakagawa, Hidewaki; Park, Keunchil; Campbell, Peter J.; Liang, Han; Aaltonen, Lauri A.; Abascal, Federico; Abeshouse, Adam; Aburatani, Hiroyuki; Adams, David J.; Agrawal, Nishant; Ahn, Keun Soo; [...]Comprehensive molecular characterization of mitochondrial genomes in human cancersOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Genetics
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Jiao, Wei; Atwal, Gurnit; Polak, Paz; Karlic, Rosa; Cuppen, Edwin; Al-Shahrour, Fatima; Atwal, Gurnit; Bailey, Peter J.; Biankin, Andrew V.; Boutros, Paul C.; Campbell, Peter J.; Chang, David K.; Cooke, Susanna L.; Deshpande, Vikram; Faltas, Bishoy M.; Faquin, William C.; Garraway, Levi; Getz, Gad; Grimmond, Sean M.; Haider, Syed; Hoadley, Katherine A.; Jiao, Wei; Kaiser, Vera B.; Karlic, Rosa; [...]A deep learning system accurately classifies primary and metastatic cancers using passenger mutation patternsOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Akdemir, Kadir C.; Le, Victoria T.; Chandran, Sahaana; Li, Yilong; Verhaak, Roel G.; Beroukhim, Rameen; Campbell, Peter J.; Chin, Lynda; Dixon, Jesse R.; Futreal, P. Andrew; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; Cortés-Ciriano, Isidro; Dueso-Barroso, Ana; Dunford, Andrew J.; Edwards, Paul A.; [...]Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancerOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Genetics
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Bhandari, Vinayak; Li, Constance H.; Bristow, Robert G.; Boutros, Paul C.; Aaltonen, Lauri A.; Abascal, Federico; Abeshouse, Adam; Aburatani, Hiroyuki; Adams, David J.; Agrawal, Nishant; Ahn, Keun Soo; Ahn, Sung-Min; Aikata, Hiroshi; Akbani, Rehan; Akdemir, Kadir C.; Al-Ahmadie, Hikmat; Al-Sedairy, Sultan T.; Al-Shahrour, Fatima; Alawi, Malik; Albert, Monique; Aldape, Kenneth; Alexandrov, Ludmil B.; Ally, Adrian; Alsop, Kathryn; [...]Divergent mutational processes distinguish hypoxic and normoxic tumoursOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature
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Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Greger, Liliana; Li, Siliang; [...]Genomic basis for RNA alterations in cancerOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Zhang, Yiqun; Chen, Fengju; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Fujita, Masashi; Nakagawa, Hidewaki; Zhang, Zemin; Brazma, Alvis; Amin, Samirkumar B.; Awadalla, Philip; Bailey, Peter J.; Brazma, Alvis; Brooks, Angela N.; Calabrese, Claudia; Chateigner, Aurélien; Cortés-Ciriano, Isidro; Craft, Brian; Craft, David; Creighton, Chad J.; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Erkek, Serap; Fonseca, Nuno A.; Frenkel-Morgenstern, Milana; [...]High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterationsOnline ansehenSchließen
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Cmero, Marek; Yuan, Ke; Ong, Cheng Soon; Schröder, Jan; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Campbell, Peter J.; Cao, Shaolong; Christie, Elizabeth L.; Cun, Yupeng; Dawson, Kevin J.; Demeulemeester, Jonas; Dentro, Stefan C.; Deshwar, Amit G.; Donmez, Nilgun; Drews, Ruben M.; Eils, Roland; Fan, Yu; Fittall, Matthew W.; Garsed, Dale W.; Gerstung, Moritz; [...]Inferring structural variant cancer cell fractionOnline ansehenSchließen
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