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  1. Gustav, Marco [Verfasser:in]; Reitsam, Nic Gabriel [Verfasser:in]; Carrero, Zunamys I. [Verfasser:in]; Loeffler, Chiara M. L. [Verfasser:in]; van Treeck, Marko [Verfasser:in]; Yuan, Tanwei [Verfasser:in]; West, Nicholas P. [Verfasser:in]; Quirke, Philip [Verfasser:in]; Brinker, Titus Josef [Verfasser:in]; Brenner, Hermann [Verfasser:in]; Favre, Loëtitia [Verfasser:in]; Märkl, Bruno [Verfasser:in]; Stenzinger, Albrecht [Verfasser:in]; Brobeil, Alexander [Verfasser:in]; Hoffmeister, Michael [Verfasser:in]; Calderaro, Julien [Verfasser:in]; Pujals, Anaïs [Verfasser:in]; Kather, Jakob Nikolas [Verfasser:in]

    Deep learning for dual detection of microsatellite instability and POLE mutations in colorectal cancer histopathology

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    23 May 2024

    Erschienen in: npj precision oncology ; 8(2024), Seite 1-11

  2. El Nahhas, Omar S. M. [Verfasser:in]; Loeffler, Chiara M. L. [Verfasser:in]; Carrero, Zunamys I. [Verfasser:in]; van Treeck, Marko [Verfasser:in]; Kolbinger, Fiona R. [Verfasser:in]; Hewitt, Katherine J. [Verfasser:in]; Muti, Hannah S. [Verfasser:in]; Graziani, Mara [Verfasser:in]; Zeng, Qinghe [Verfasser:in]; Calderaro, Julien [Verfasser:in]; Ortiz-Brüchle, Nadina [Verfasser:in]; Yuan, Tanwei [Verfasser:in]; Hoffmeister, Michael [Verfasser:in]; Brenner, Hermann [Verfasser:in]; Brobeil, Alexander [Verfasser:in]; Reis-Filho, Jorge S. [Verfasser:in]; Kather, Jakob Nikolas [Verfasser:in]

    Regression-based Deep-Learning predicts molecular biomarkers from pathology slides

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    10 February 2024

    Erschienen in: Nature Communications ; 15(2024), 1, Artikel-ID 1253, Seite 1-13

  3. Wurm, Alexander Arthur [Verfasser:in]; Brilloff, Silke [Verfasser:in]; Kolovich, Sofia [Verfasser:in]; Schäfer, Silvia [Verfasser:in]; Rahimian, Elahe [Verfasser:in]; Kufrin, Vida [Verfasser:in]; Bill, Marius [Verfasser:in]; Carrero, Zunamys I. [Verfasser:in]; Drukewitz, Stephan [Verfasser:in]; Krüger, Alexander [Verfasser:in]; Hüther, Melanie [Verfasser:in]; Uhrig, Sebastian [Verfasser:in]; Oster, Sandra [Verfasser:in]; Westphal, Dana [Verfasser:in]; Meier, Friedegund [Verfasser:in]; Pfütze, Katrin [Verfasser:in]; Hübschmann, Daniel [Verfasser:in]; Horak, Peter [Verfasser:in]; Kreutzfeldt, Simon [Verfasser:in]; Richter, Daniela [Verfasser:in]; Schröck, Evelin [Verfasser:in]; Baretton, Gustavo Bruno [Verfasser:in]; Heining, Christoph [Verfasser:in]; Möhrmann, Lino [Verfasser:in]; [...]

    Signaling-induced systematic repression of miRNAs uncovers cancer vulnerabilities and targeted therapy sensitivity

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    17 October 2023

    Erschienen in: Cell reports. Medicine ; 4(2023), 10, Artikel-ID 101200, Seite 1-24

  5. Carrero, Zunamys I.; Kollareddy, Madhusudhan; Chauhan, Krishna M.; Ramakrishnan, Gopalakrishnan; Martinez, Luis A.

    Abstract 1212: Mutant p53 stabilizes and protects the transcription factor ETS2 from proteasomal degradation by the ubiquitin ligase COP1/DET1

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    American Association for Cancer Research (AACR), 2015

    Erschienen in: Cancer Research, 75 (2015) 15_Supplement, Seite 1212-1212

  10. Mavrommati, Iaonna; Faedda, Roberta; Galasso, Giovanni; Fisher, Roman; Kessler, Benedikt M.; Carrero, Zunamys I.; Guardavaccaro, Daniele; Pagano, Michele; DDAngiolella, Vincenzo

    -TrCP and Casein Kinase III Mediated Degradation of Cyclin F Controls Timely Mitotic Entry

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: SSRN Electronic Journal (2018)

  11. Magliozzi, Roberto; Carrero, Zunamys I.; Low, Teck Yew; Yuniati, Laurensia; Valdes-Quezada, Christian; Kruiswijk, Flore; van Wijk, Koen; Heck, Albert J.R.; Jackson, Catherine L.; Guardavaccaro, Daniele

    Inheritance of the Golgi Apparatus and Cytokinesis Are Controlled by Degradation of GBF1

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell Reports, 23 (2018) 11, Seite 3381-3391.e4

  12. Mavrommati, Ioanna; Faedda, Roberta; Galasso, Giovanni; Li, Jie; Burdova, Kamila; Fischer, Roman; Kessler, Benedikt M.; Carrero, Zunamys I.; Guardavaccaro, Daniele; Pagano, Michele; D’Angiolella, Vincenzo

    β-TrCP- and Casein Kinase II-Mediated Degradation of Cyclin F Controls Timely Mitotic Progression

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Cell Reports, 24 (2018) 13, Seite 3404-3412

  13. Gilder, Andrew S.; Do, Phi M.; Carrero, Zunamys I; Cosman, Angela M.; Broome, Hanna J.; Velma, Venkatramreddy; Martinez, Luis A.; Hebert, Michael D.

    Coilin participates in the suppression of RNA polymerase I in response to cisplatin-induced DNA damage

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    American Society for Cell Biology (ASCB), 2011

    Erschienen in: Molecular Biology of the Cell, 22 (2011) 7, Seite 1070-1079

  14. Clusmann, Jan; Kolbinger, Fiona R.; Muti, Hannah Sophie; Carrero, Zunamys I.; Eckardt, Jan-Niklas; Laleh, Narmin Ghaffari; Lavinia Loffler, Chiara Maria; Schwarzkopf, Sophie-Caroline; Unger, Michaela; Veldhuizen, Gregory P.; Wagner, Sophia J.; Kather, Jakob Nikolas

    Die kommende Entwicklung großer Sprachmodelle in der Medizin

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    S. Karger AG, 2024

    Erschienen in: Kompass Onkologie, 11 (2024) 1, Seite 3-10

  15. Wiest, Isabella Catharina; Ferber, Dyke; Zhu, Jiefu; van Treeck, Marko; Meyer, Sonja K.; Juglan, Radhika; Carrero, Zunamys I.; Paech, Daniel; Kleesiek, Jens; Ebert, Matthias P.; Truhn, Daniel; Kather, Jakob Nikolas

    Privacy-preserving large language models for structured medical information retrieval

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    Springer Science and Business Media LLC, 2024

    Erschienen in: npj Digital Medicine, 7 (2024) 1

  16. Clusmann, Jan; Kolbinger, Fiona R.; Muti, Hannah Sophie; Carrero, Zunamys I.; Eckardt, Jan-Niklas; Laleh, Narmin Ghaffari; Löffler, Chiara Maria Lavinia; Schwarzkopf, Sophie-Caroline; Unger, Michaela; Veldhuizen, Gregory P.; Wagner, Sophia J.; Kather, Jakob Nikolas

    The future landscape of large language models in medicine

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Communications Medicine, 3 (2023) 1

  17. Kollareddy, Madhusudhan; Dimitrova, Elizabeth; Vallabhaneni, Krishna C.; Chan, Adriano; Le, Thuc; Chauhan, Krishna M.; Carrero, Zunamys I.; Ramakrishnan, Gopalakrishnan; Watabe, Kounosuke; Haupt, Ygal; Haupt, Sue; Pochampally, Radhika; Boss, Gerard R.; Romero, Damian G.; Radu, Caius G.; Martinez, Luis A.

    Regulation of nucleotide metabolism by mutant p53 contributes to its gain-of-function activities

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    Springer Science and Business Media LLC, 2015

    Erschienen in: Nature Communications, 6 (2015) 1

  18. Hilgers, Lars; Ghaffari Laleh, Narmin; West, Nicholas P; Westwood, Alice; Hewitt, Katherine J; Quirke, Philip; Grabsch, Heike I; Carrero, Zunamys I; Matthaei, Emylou; Loeffler, Chiara M L; Brinker, Titus J; Yuan, Tanwei; Brenner, Hermann; Brobeil, Alexander; Hoffmeister, Michael; Kather, Jakob Nikolas

    Automated curation of large‐scale cancer histopathology image datasets using deep learning

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    Wiley, 2024

    Erschienen in: Histopathology, 84 (2024) 7, Seite 1139-1153

  19. Gustav, Marco; van Treeck, Marko; Carrero, Zunamys I.; Loeffler, Chiara M.; Reitsam, Nic G.; Märkl, Bruno; Meneghetti, Asier Rabasco; Boardman, Lisa A.; French, Amy J.; Goode, Ellen L.; Gsur, Andrea; Brezina, Stefanie; Gunter, Marc J.; Murphy, Neil; Limburg, Paul; Thibodeau, Stephen; Foersch, Sebastian; Steinfelder, Robert; Harrison, Tabitha; Peters, Ulrike; Phipps, Amanda; Kather, Jakob N.

    Abstract 4924: Assessing microsatellite instability dominance in colorectal cancer phenotype: A multi-study initiative using multi-target transformers for genomic biomarker prediction

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    American Association for Cancer Research (AACR), 2024

    Erschienen in: Cancer Research, 84 (2024) 6_Supplement, Seite 4924-4924

  20. El Nahhas, Omar S. M.; Loeffler, Chiara M. L.; Carrero, Zunamys I.; van Treeck, Marko; Kolbinger, Fiona R.; Hewitt, Katherine J.; Muti, Hannah S.; Graziani, Mara; Zeng, Qinghe; Calderaro, Julien; Ortiz-Brüchle, Nadina; Yuan, Tanwei; Hoffmeister, Michael; Brenner, Hermann; Brobeil, Alexander; Reis-Filho, Jorge S.; Kather, Jakob Nikolas

    Author Correction: Regression-based Deep-Learning predicts molecular biomarkers from pathology slides

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    Springer Science and Business Media LLC, 2024

    Erschienen in: Nature Communications, 15 (2024) 1