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  1. Hong, Aaron; Oliva, Marco; Köppl, Dominik; Bannai, Hideo; Boucher, Christina; Gagie, Travis

    Pfp-fm: an accelerated FM-index

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    Springer Science and Business Media LLC, 2024

    Erschienen in: Algorithms for Molecular Biology

  2. Na, Joong Chae; Kim, Hyunjoon; Min, Seunghwan; Park, Heejin; Lecroq, Thierry; Léonard, Martine; Mouchard, Laurent; Park, Kunsoo

    FM-index of alignment with gaps

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: Theoretical Computer Science

  3. Belazzougui, Djamal; Gagie, Travis; Gog, Simon; Manzini, Giovanni; Sirén, Jouni

    String Processing and Information Retrieval: Relative FM-Indexes

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    Springer International Publishing, 2014

    Erschienen in: String Processing and Information Retrieval

  4. Yang, Chung-Hsuan; Wu, Yi-Chung; Chen, Yen-Lung; Lee, Chao-Hsi; Hung, Jui-Hung; Yang, Chia-Hsiang

    An FM-Index Based High-Throughput Memory-Efficient FPGA Accelerator for Paired-End Short-Read Mapping

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    Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2023

    Erschienen in: IEEE Transactions on Biomedical Circuits and Systems

  5. Langarita, Ruben; Armejach, Adria; Setoain, Javier; Ibanez-Marin, Pablo; Alastruey-Benede, Jesus; Moreto, Miquel

    Compressed Sparse FM-Index: Fast Sequence Alignment Using Large K-Steps

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    Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2022

    Erschienen in: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics