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Bhandari, Vinayak; Li, Constance H.; Bristow, Robert G.; Boutros, Paul C.; Aaltonen, Lauri A.; Abascal, Federico; Abeshouse, Adam; Aburatani, Hiroyuki; Adams, David J.; Agrawal, Nishant; Ahn, Keun Soo; Ahn, Sung-Min; Aikata, Hiroshi; Akbani, Rehan; Akdemir, Kadir C.; Al-Ahmadie, Hikmat; Al-Sedairy, Sultan T.; Al-Shahrour, Fatima; Alawi, Malik; Albert, Monique; Aldape, Kenneth; Alexandrov, Ludmil B.; Ally, Adrian; Alsop, Kathryn; [...]Divergent mutational processes distinguish hypoxic and normoxic tumoursOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Gerstung, Moritz; Jolly, Clemency; Leshchiner, Ignaty; Dentro, Stefan C.; Gonzalez, Santiago; Rosebrock, Daniel; Mitchell, Thomas J.; Rubanova, Yulia; Anur, Pavana; Yu, Kaixian; Tarabichi, Maxime; Deshwar, Amit; Wintersinger, Jeff; Kleinheinz, Kortine; Vázquez-García, Ignacio; Haase, Kerstin; Jerman, Lara; Sengupta, Subhajit; Macintyre, Geoff; Malikic, Salem; Donmez, Nilgun; Livitz, Dimitri G.; Cmero, Marek; Demeulemeester, Jonas; [...]The evolutionary history of 2,658 cancersOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature
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Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Greger, Liliana; Li, Siliang; [...]Genomic basis for RNA alterations in cancerOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature
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Zhang, Yiqun; Chen, Fengju; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Fujita, Masashi; Nakagawa, Hidewaki; Zhang, Zemin; Brazma, Alvis; Amin, Samirkumar B.; Awadalla, Philip; Bailey, Peter J.; Brazma, Alvis; Brooks, Angela N.; Calabrese, Claudia; Chateigner, Aurélien; Cortés-Ciriano, Isidro; Craft, Brian; Craft, David; Creighton, Chad J.; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Erkek, Serap; Fonseca, Nuno A.; Frenkel-Morgenstern, Milana; [...]High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterationsOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Cmero, Marek; Yuan, Ke; Ong, Cheng Soon; Schröder, Jan; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Campbell, Peter J.; Cao, Shaolong; Christie, Elizabeth L.; Cun, Yupeng; Dawson, Kevin J.; Demeulemeester, Jonas; Dentro, Stefan C.; Deshwar, Amit G.; Donmez, Nilgun; Drews, Ruben M.; Eils, Roland; Fan, Yu; Fittall, Matthew W.; Garsed, Dale W.; Gerstung, Moritz; [...]Inferring structural variant cancer cell fractionOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Paczkowska, Marta; Barenboim, Jonathan; Sintupisut, Nardnisa; Fox, Natalie S.; Zhu, Helen; Abd-Rabbo, Diala; Mee, Miles W.; Boutros, Paul C.; Abascal, Federico; Amin, Samirkumar B.; Bader, Gary D.; Beroukhim, Rameen; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; Brunak, Søren; Campbell, Peter J.; Carlevaro-Fita, Joana; Chakravarty, Dimple; Chan, Calvin Wing Yiu; Chen, Ken; Choi, Jung Kyoon; Deu-Pons, Jordi; Dhingra, Priyanka; Diamanti, Klev; [...]Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics dataOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Zapatka, Marc; Borozan, Ivan; Brewer, Daniel S.; Iskar, Murat; Grundhoff, Adam; Alawi, Malik; Desai, Nikita; Sültmann, Holger; Moch, Holger; Alawi, Malik; Borozan, Ivan; Brewer, Daniel S.; Cooper, Colin S.; Desai, Nikita; Eils, Roland; Ferretti, Vincent; Grundhoff, Adam; Iskar, Murat; Kleinheinz, Kortine; Lichter, Peter; Nakagawa, Hidewaki; Ojesina, Akinyemi I.; Pedamallu, Chandra Sekhar; Schlesner, Matthias; [...]The landscape of viral associations in human cancersOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Genetics
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Aaltonen, Lauri A.; Abascal, Federico; Abeshouse, Adam; Aburatani, Hiroyuki; Adams, David J.; Agrawal, Nishant; Ahn, Keun Soo; Ahn, Sung-Min; Aikata, Hiroshi; Akbani, Rehan; Akdemir, Kadir C.; Al-Ahmadie, Hikmat; Al-Sedairy, Sultan T.; Al-Shahrour, Fatima; Alawi, Malik; Albert, Monique; Aldape, Kenneth; Alexandrov, Ludmil B.; Ally, Adrian; Alsop, Kathryn; Alvarez, Eva G.; Amary, Fernanda; Amin, Samirkumar B.; Aminou, Brice; [...]Pan-cancer analysis of whole genomesOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature
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Rodriguez-Martin, Bernardo; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Zamora, Jorge; Supek, Fran; Demeulemeester, Jonas; Santamarina, Martin; Ju, Young Seok; Temes, Javier; Garcia-Souto, Daniel; Detering, Harald; Li, Yilong; Rodriguez-Castro, Jorge; Dueso-Barroso, Ana; Bruzos, Alicia L.; Dentro, Stefan C.; Blanco, Miguel G.; Contino, Gianmarco; Ardeljan, Daniel; Tojo, Marta; Roberts, Nicola D.; Zumalave, Sonia; Edwards, Paul A.; Weischenfeldt, Joachim; [...]Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotranspositionOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Genetics
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Reyna, Matthew A.; Haan, David; Paczkowska, Marta; Verbeke, Lieven P. C.; Vazquez, Miguel; Kahraman, Abdullah; Pulido-Tamayo, Sergio; Barenboim, Jonathan; Wadi, Lina; Dhingra, Priyanka; Shrestha, Raunak; Getz, Gad; Lawrence, Michael S.; Pedersen, Jakob Skou; Rubin, Mark A.; Wheeler, David A.; Brunak, Søren; Izarzugaza, Jose M. G.; Khurana, Ekta; Marchal, Kathleen; von Mering, Christian; Sahinalp, S. Cenk; Valencia, Alfonso; Abascal, Federico; [...]Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomesOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Li, Yilong; Roberts, Nicola D.; Wala, Jeremiah A.; Shapira, Ofer; Schumacher, Steven E.; Kumar, Kiran; Khurana, Ekta; Waszak, Sebastian; Korbel, Jan O.; Haber, James E.; Imielinski, Marcin; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; Cortés-Ciriano, Isidro; Dueso-Barroso, Ana; [...]Patterns of somatic structural variation in human cancer genomesOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature
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Rubanova, Yulia; Shi, Ruian; Harrigan, Caitlin F.; Li, Roujia; Wintersinger, Jeff; Sahin, Nil; Deshwar, Amit G.; Dentro, Stefan C.; Leshchiner, Ignaty; Gerstung, Moritz; Jolly, Clemency; Haase, Kerstin; Tarabichi, Maxime; Wintersinger, Jeff; Deshwar, Amit G.; Yu, Kaixian; Gonzalez, Santiago; Rubanova, Yulia; Macintyre, Geoff; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D.; [...]Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSigOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Alexandrov, Ludmil B.; Kim, Jaegil; Haradhvala, Nicholas J.; Huang, Mi Ni; Tian Ng, Alvin Wei; Wu, Yang; Boot, Arnoud; Covington, Kyle R.; Gordenin, Dmitry A.; Bergstrom, Erik N.; Islam, S. M. Ashiqul; Lopez-Bigas, Nuria; Klimczak, Leszek J.; McPherson, John R.; Morganella, Sandro; Sabarinathan, Radhakrishnan; Wheeler, David A.; Mustonen, Ville; Alexandrov, Ludmil B.; Bergstrom, Erik N.; Boot, Arnoud; Boutros, Paul; Chan, Kin; Covington, Kyle R.; [...]The repertoire of mutational signatures in human cancerOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature
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Bailey, Matthew H.; Meyerson, William U.; Dursi, Lewis Jonathan; Wang, Liang-Bo; Dong, Guanlan; Liang, Wen-Wei; Weerasinghe, Amila; Li, Shantao; Li, Yize; Kelso, Sean; Akbani, Rehan; Anur, Pavana; Bailey, Matthew H.; Buchanan, Alex; Chiotti, Kami; Covington, Kyle; Creason, Allison; Ding, Li; Ellrott, Kyle; Fan, Yu; Foltz, Steven; Getz, Gad; Hale, Walker; Haussler, David; [...]Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samplesOnline ansehenSchließen
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Erschienen in: Nature Communications
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Li, Constance H.; Prokopec, Stephenie D.; Sun, Ren X.; Yousif, Fouad; Schmitz, Nathaniel; Al-Shahrour, Fatima; Atwal, Gurnit; Bailey, Peter J.; Biankin, Andrew V.; Boutros, Paul C.; Campbell, Peter J.; Chang, David K.; Cooke, Susanna L.; Deshpande, Vikram; Faltas, Bishoy M.; Faquin, William C.; Garraway, Levi; Getz, Gad; Grimmond, Sean M.; Haider, Syed; Hoadley, Katherine A.; Jiao, Wei; Kaiser, Vera B.; Karlić, Rosa; [...]Sex differences in oncogenic mutational processesOnline ansehenSchließen
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