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  1. Kamya, Petrina; Ozerov, Ivan V.; Pun, Frank W.; Tretina, Kyle; Fokina, Tatyana; Chen, Shan; Naumov, Vladimir; Long, Xi; Lin, Sha; Korzinkin, Mikhail; Polykovskiy, Daniil; Aliper, Alex; Ren, Feng; Zhavoronkov, Alex

    PandaOmics: An AI-Driven Platform for Therapeutic Target and Biomarker Discovery

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    American Chemical Society (ACS), 2024

    Erschienen in: Journal of Chemical Information and Modeling

  2. Zagirova, Diana; Pushkov, Stefan; Leung, Geoffrey Ho Duen; Liu, Bonnie Hei Man; Urban, Anatoly; Sidorenko, Denis; Kalashnikov, Aleksandr; Kozlova, Ekaterina; Naumov, Vladimir; Pun, Frank W.; Ozerov, Ivan V.; Aliper, Alex; Zhavoronkov, Alex

    Biomedical generative pre-trained based transformer language model for age-related disease target discovery

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    Impact Journals, LLC, 2023

    Erschienen in: Aging

  3. Olsen, Andrea; Harpaz, Zachary; Ren, Christopher; Shneyderman, Anastasia; Veviorskiy, Alexander; Dralkina, Maria; Konnov, Simon; Shcheglova, Olga; Pun, Frank W.; Leung, Geoffrey Ho Duen; Leung, Hoi Wing; Ozerov, Ivan V.; Aliper, Alex; Korzinkin, Mikhail; Zhavoronkov, Alex

    Identification of dual-purpose therapeutic targets implicated in aging and glioblastoma multiforme using PandaOmics - an AI-enabled biological target discovery platform

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    Impact Journals, LLC, 2023

    Erschienen in: Aging

  4. Urban, Anatoly; Sidorenko, Denis; Zagirova, Diana; Kozlova, Ekaterina; Kalashnikov, Aleksandr; Pushkov, Stefan; Naumov, Vladimir; Sarkisova, Viktoria; Leung, Geoffrey Ho Duen; Leung, Hoi Wing; Pun, Frank W.; Ozerov, Ivan V.; Aliper, Alex; Ren, Feng; Zhavoronkov, Alex

    Precious1GPT: multimodal transformer-based transfer learning for aging clock development and feature importance analysis for aging and age-related disease target discovery

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    Impact Journals, LLC, 2023

    Erschienen in: Aging

  5. Rain Talosig, A.; Cosio, Mario N.; Morse, Benjamin; Nguyen, Vinh T.; Kosanovich, Alex J.; Pell, Christopher J.; Li, Chun; Bhuvanesh, Nattamai; Zhou, Jia; Larsen, Anna S.; Ozerov, Oleg. V.

    Distinct modes of Si–H binding to Rh in complexes of a phosphine-diarylamido-silane (SiNP) pincer ligand

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    Royal Society of Chemistry (RSC), 2022

    Erschienen in: Dalton Transactions

  6. Pun, Frank W.; Leung, Geoffrey Ho Duen; Leung, Hoi Wing; Liu, Bonnie Hei Man; Long, Xi; Ozerov, Ivan V.; Wang, Ju; Ren, Feng; Aliper, Alexander; Izumchenko, Evgeny; Moskalev, Alexey; de Magalhães, João Pedro; Zhavoronkov, Alex

    Hallmarks of aging-based dual-purpose disease and age-associated targets predicted using PandaOmics AI-powered discovery engine

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    Impact Journals, LLC, 2022

    Erschienen in: Aging

  7. Broner, Esther C.; Trujillo, Jonathan A.; Korzinkin, Michael; Subbannayya, Tejaswini; Agrawal, Nishant; Ozerov, Ivan V.; Zhavoronkov, Alex; Rooper, Lisa; Kotlov, Nikita; Shen, Le; Pearson, Alexander T.; Rosenberg, Ari J.; Savage, Peter A.; Mishra, Vasudha; Chatterjee, Aditi; Sidransky, David; Izumchenko, Evgeny

    Doublecortin-Like Kinase 1 (DCLK1) Is a Novel NOTCH Pathway Signaling Regulator in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma

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    Frontiers Media SA, 2021

    Erschienen in: Frontiers in Oncology

  8. Ravi, Rajani; Noonan, Kimberly A.; Pham, Vui; Bedi, Rishi; Zhavoronkov, Alex; Ozerov, Ivan V.; Makarev, Eugene; V. Artemov, Artem; Wysocki, Piotr T.; Mehra, Ranee; Nimmagadda, Sridhar; Marchionni, Luigi; Sidransky, David; Borrello, Ivan M.; Izumchenko, Evgeny; Bedi, Atul

    Bifunctional immune checkpoint-targeted antibody-ligand traps that simultaneously disable TGFβ enhance the efficacy of cancer immunotherapy

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    Springer Science and Business Media LLC, 2018

    Erschienen in: Nature Communications

  9. Makarev, Eugene; Schubert, Adrian D; Kanherkar, Riya R; London, Nyall; Teka, Mahder; Ozerov, Ivan; Lezhnina, Ksenia; Bedi, Atul; Ravi, Rajani; Mehra, Rannee; Hoque, Mohammad O; Sloma, Ido; Gaykalova, Daria A; Csoka, Antonei B; Sidransky, David; Zhavoronkov, Alex; Izumchenko, Evgeny

    In silico analysis of pathways activation landscape in oral squamous cell carcinoma and oral leukoplakia

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    Springer Science and Business Media LLC, 2017

    Erschienen in: Cell Death Discovery

  10. Tsvetkova, Anastasia; Ozerov, Ivan V.; Pustovalova, Margarita; Grekhova, Anna; Eremin, Petr; Vorobyeva, Natalia; Eremin, Ilya; Pulin, Andrey; Zorin, Vadim; Kopnin, Pavel; Leonov, Sergey; Zhavoronkov, Alex; Klokov, Dmitry; Osipov, Andreyan N.

    γH2AX, 53BP1 and Rad51 protein foci changes in mesenchymal stem cells during prolonged X-ray irradiation

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    Impact Journals, LLC, 2017

    Erschienen in: Oncotarget

  11. Pustovalova, Margarita; Grekhova, Anna; Astrelina, Тatiana; Nikitina, Viktoria; Dobrovolskaya, Ekaterina; Suchkova, Yulia; Kobzeva, Irina; Usupzhanova, Darya; Vorobyeva, Natalia; Samoylov, Aleksandr; Bushmanov, Andrey; Ozerov, Ivan V.; Zhavoronkov, Alex; Leonov, Sergey; Klokov, Dmitry; Osipov, Andreyan N.

    Accumulation of spontaneous γH2AX foci in long-term cultured mesenchymal stromal cells

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    Impact Journals, LLC, 2016

    Erschienen in: Aging

  12. Ren, Feng; Aliper, Alex; Chen, Jian; Zhao, Heng; Rao, Sujata; Kuppe, Christoph; Ozerov, Ivan V.; Zhang, Man; Witte, Klaus; Kruse, Chris; Aladinskiy, Vladimir; Ivanenkov, Yan; Polykovskiy, Daniil; Fu, Yanyun; Babin, Eugene; Qiao, Junwen; Liang, Xing; Mou, Zhenzhen; Wang, Hui; Pun, Frank W.; Ayuso, Pedro Torres; Veviorskiy, Alexander; Song, Dandan; Liu, Sang; [...]

    A small-molecule TNIK inhibitor targets fibrosis in preclinical and clinical models

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    Springer Science and Business Media LLC, 2024

    Erschienen in: Nature Biotechnology

  13. Ren, Feng; Ding, Xiao; Zheng, Min; Korzinkin, Mikhail; Cai, Xin; Zhu, Wei; Mantsyzov, Alexey; Aliper, Alex; Aladinskiy, Vladimir; Cao, Zhongying; Kong, Shanshan; Long, Xi; Man Liu, Bonnie Hei; Liu, Yingtao; Naumov, Vladimir; Shneyderman, Anastasia; Ozerov, Ivan V.; Wang, Ju; Pun, Frank W.; Polykovskiy, Daniil A.; Sun, Chong; Levitt, Michael; Aspuru-Guzik, Alán; Zhavoronkov, Alex

    AlphaFold accelerates artificial intelligence powered drug discovery: efficient discovery of a novel CDK20 small molecule inhibitor

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    Royal Society of Chemistry (RSC), 2023

    Erschienen in: Chemical Science

  14. Pun, Frank W.; Leung, Geoffrey Ho Duen; Leung, Hoi Wing; Rice, Jared; Schmauck‐Medina, Tomas; Lautrup, Sofie; Long, Xi; Liu, Bonnie Hei Man; Wong, Chun Wai; Ozerov, Ivan V.; Aliper, Alex; Ren, Feng; Rosenberg, Ari J.; Agrawal, Nishant; Izumchenko, Evgeny; Fang, Evandro F.; Zhavoronkov, Alex

    A comprehensive AI‐driven analysis of large‐scale omic datasets reveals novel dual‐purpose targets for the treatment of cancer and aging

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    Wiley, 2023

    Erschienen in: Aging Cell

  15. Naumov, Vladimir; Putin, Evgeny; Pushkov, Stefan; Kozlova, Ekaterina; Romantsov, Konstantin; Kalashnikov, Alexander; Galkin, Fedor; Tihonova, Nina; Shneyderman, Anastasia; Galkin, Egor; Zinkevich, Arsenii; Cope, Stephanie M.; Sethuraman, Ramanathan; Oprea, Tudor I.; Pearson, Alexander T.; Tay, Savas; Agrawal, Nishant; Dubovenko, Alexey; Vanhaelen, Quentin; Ozerov, Ivan; Aliper, Alex; Izumchenko, Evgeny; Zhavoronkov, Alex

    COVIDomic: A multi-modal cloud-based platform for identification of risk factors associated with COVID-19 severity

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    Public Library of Science (PLoS), 2021

    Erschienen in: PLOS Computational Biology

  16. Pun, Frank W.; Liu, Bonnie Hei Man; Long, Xi; Leung, Hoi Wing; Leung, Geoffrey Ho Duen; Mewborne, Quinlan T.; Gao, Junli; Shneyderman, Anastasia; Ozerov, Ivan V.; Wang, Ju; Ren, Feng; Aliper, Alexander; Bischof, Evelyne; Izumchenko, Evgeny; Guan, Xiaoming; Zhang, Ke; Lu, Bai; Rothstein, Jeffrey D.; Cudkowicz, Merit E.; Zhavoronkov, Alex

    Identification of Therapeutic Targets for Amyotrophic Lateral Sclerosis Using PandaOmics – An AI-Enabled Biological Target Discovery Platform

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    Frontiers Media SA, 2022

    Erschienen in: Frontiers in Aging Neuroscience

  17. Solanki, Hitendra S.; Raja, Remya; Zhavoronkov, Alex; Ozerov, Ivan V.; Artemov, Artem V.; Advani, Jayshree; Radhakrishnan, Aneesha; Babu, Niraj; Puttamallesh, Vinuth N.; Syed, Nazia; Nanjappa, Vishalakshi; Subbannayya, Tejaswini; Sahasrabuddhe, Nandini A.; Patil, Arun H.; Prasad, T.S. Keshava; Gaykalova, Daria; Chang, Xiaofei; Sathyendran, Rachana; Prakash Mathur, Premendu; Rangarajan, Annapoorni; Sidransky, David; Pandey, Akhilesh; Izumchenko, Evgeny; Gowda, Harsha;

    Correction: Targeting focal adhesion kinase overcomes erlotinib resistance in smoke induced lung cancer by altering phosphorylation of epidermal growth factor receptor

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    Impact Journals, LLC, 2021

    Erschienen in: Oncoscience

  18. Subbannayya, Tejaswini; Leal-Rojas, Pamela; Zhavoronkov, Alex; Ozerov, Ivan V.; Korzinkin, Mikhail; Babu, Niraj; Radhakrishnan, Aneesha; Chavan, Sandip; Raja, Remya; Pinto, Sneha M.; Patil, Arun H.; Barbhuiya, Mustafa A.; Kumar, Prashant; Guerrero-Preston, Rafael; Navani, Sanjay; Tiwari, Pramod K.; Kumar, Rekha Vijay; Prasad, T. S. Keshava; Roa, Juan Carlos; Pandey, Akhilesh; Sidransky, David; Gowda, Harsha; Izumchenko, Evgeny; Chatterjee, Aditi

    PIM1 kinase promotes gallbladder cancer cell proliferation via inhibition of proline-rich Akt substrate of 40 kDa (PRAS40)

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    Wiley, 2019

    Erschienen in: Journal of Cell Communication and Signaling

  19. Bakula, Daniela; Aliper, Alexander M.; Mamoshina, Polina; Petr, Michael A.; Teklu, Amanuel; Baur, Joseph A.; Campisi, Judith; Ewald, Collin Y.; Georgievskaya, Anastasia; Gladyshev, Vadim N.; Kovalchuk, Olga; Lamming, Dudley W.; Luijsterburg, Martijn S.; Martín-Montalvo, Alejandro; Maudsley, Stuart; Mkrtchyan, Garik V.; Moskalev, Alexey; Olshansky, S. Jay; Ozerov, Ivan V.; Pickett, Alexander; Ristow, Michael; Zhavoronkov, Alex; Scheibye-Knudsen, Morten

    Aging and drug discovery

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    Impact Journals, LLC, 2018

    Erschienen in: Aging

  20. Solanki, Hitendra S.; Raja, Remya; Zhavoronkov, Alex; Ozerov, Ivan V.; Artemov, Artem V.; Advani, Jayshree; Radhakrishnan, Aneesha; Babu, Niraj; Puttamallesh, Vinuth N.; Syed, Nazia; Nanjappa, Vishalakshi; Subbannayya, Tejaswini; Sahasrabuddhe, Nandini A.; Patil, Arun H.; Prasad, T.S. Keshava; Gaykalova, Daria; Chang, Xiaofei; Sathyendran, Rachana; Mathur, Premendu Prakash; Rangarajan, Annapoorni; Sidransky, David; Pandey, Akhilesh; Izumchenko, Evgeny; Gowda, Harsha;

    Targeting focal adhesion kinase overcomes erlotinib resistance in smoke induced lung cancer by altering phosphorylation of epidermal growth factor receptor

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    Impact Journals, LLC, 2018

    Erschienen in: Oncoscience