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  1. Rodriguez-Martin, Bernardo; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Zamora, Jorge; Supek, Fran; Demeulemeester, Jonas; Santamarina, Martin; Ju, Young Seok; Temes, Javier; Garcia-Souto, Daniel; Detering, Harald; Li, Yilong; Rodriguez-Castro, Jorge; Dueso-Barroso, Ana; Bruzos, Alicia L.; Dentro, Stefan C.; Blanco, Miguel G.; Contino, Gianmarco; Ardeljan, Daniel; Tojo, Marta; Roberts, Nicola D.; Zumalave, Sonia; Edwards, Paul A.; Weischenfeldt, Joachim; [...]

    Author Correction: Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature Genetics

  2. Rodriguez-Martin, Bernardo; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Zamora, Jorge; Supek, Fran; Demeulemeester, Jonas; Santamarina, Martin; Ju, Young Seok; Temes, Javier; Garcia-Souto, Daniel; Detering, Harald; Li, Yilong; Rodriguez-Castro, Jorge; Dueso-Barroso, Ana; Bruzos, Alicia L.; Dentro, Stefan C.; Blanco, Miguel G.; Contino, Gianmarco; Ardeljan, Daniel; Tojo, Marta; Roberts, Nicola D.; Zumalave, Sonia; Edwards, Paul A.; Weischenfeldt, Joachim; [...]

    Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature Genetics

  3. Zhang, Yiqun; Chen, Fengju; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Fujita, Masashi; Nakagawa, Hidewaki; Zhang, Zemin; Brazma, Alvis; Amin, Samirkumar B.; Awadalla, Philip; Bailey, Peter J.; Brazma, Alvis; Brooks, Angela N.; Calabrese, Claudia; Chateigner, Aurélien; Cortés-Ciriano, Isidro; Craft, Brian; Craft, David; Creighton, Chad J.; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Erkek, Serap; Fonseca, Nuno A.; Frenkel-Morgenstern, Milana; [...]

    Author Correction: High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterations

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications

  4. Zhang, Yiqun; Chen, Fengju; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Fujita, Masashi; Nakagawa, Hidewaki; Zhang, Zemin; Brazma, Alvis; Amin, Samirkumar B.; Awadalla, Philip; Bailey, Peter J.; Brazma, Alvis; Brooks, Angela N.; Calabrese, Claudia; Chateigner, Aurélien; Cortés-Ciriano, Isidro; Craft, Brian; Craft, David; Creighton, Chad J.; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Erkek, Serap; Fonseca, Nuno A.; Frenkel-Morgenstern, Milana; [...]

    High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterations

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature Communications

  5. Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Greger, Liliana; Li, Siliang; [...]

    Author Correction: Genomic basis for RNA alterations in cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature

  6. Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Greger, Liliana; Li, Siliang; [...]

    Genomic basis for RNA alterations in cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature

  7. Sieverling, Lina; Hong, Chen; Koser, Sandra D.; Ginsbach, Philip; Kleinheinz, Kortine; Hutter, Barbara; Braun, Delia M.; Cortés-Ciriano, Isidro; Xi, Ruibin; Kabbe, Rolf; Park, Peter J.; Eils, Roland; Schlesner, Matthias; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; [...]

    Author Correction: Genomic footprints of activated telomere maintenance mechanisms in cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications

  8. Sieverling, Lina; Hong, Chen; Koser, Sandra D.; Ginsbach, Philip; Kleinheinz, Kortine; Hutter, Barbara; Braun, Delia M.; Cortés-Ciriano, Isidro; Xi, Ruibin; Kabbe, Rolf; Park, Peter J.; Eils, Roland; Schlesner, Matthias; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; [...]

    Genomic footprints of activated telomere maintenance mechanisms in cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature Communications

  9. Rheinbay, Esther; Nielsen, Morten Muhlig; Abascal, Federico; Wala, Jeremiah A.; Shapira, Ofer; Tiao, Grace; Hornshøj, Henrik; Hess, Julian M.; Juul, Randi Istrup; Lin, Ziao; Feuerbach, Lars; Sabarinathan, Radhakrishnan; Madsen, Tobias; Kim, Jaegil; Mularoni, Loris; Shuai, Shimin; Lanzós, Andrés; Herrmann, Carl; Maruvka, Yosef E.; Shen, Ciyue; Amin, Samirkumar B.; Bandopadhayay, Pratiti; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; [...]

    Author Correction: Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes

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    Erschienen in: Nature

  10. Rheinbay, Esther; Nielsen, Morten Muhlig; Abascal, Federico; Wala, Jeremiah A.; Shapira, Ofer; Tiao, Grace; Hornshøj, Henrik; Hess, Julian M.; Juul, Randi Istrup; Lin, Ziao; Feuerbach, Lars; Sabarinathan, Radhakrishnan; Madsen, Tobias; Kim, Jaegil; Mularoni, Loris; Shuai, Shimin; Lanzós, Andrés; Herrmann, Carl; Maruvka, Yosef E.; Shen, Ciyue; Amin, Samirkumar B.; Bandopadhayay, Pratiti; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; [...]

    Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature

  11. Gerstung, Moritz; Jolly, Clemency; Leshchiner, Ignaty; Dentro, Stefan C.; Gonzalez, Santiago; Rosebrock, Daniel; Mitchell, Thomas J.; Rubanova, Yulia; Anur, Pavana; Yu, Kaixian; Tarabichi, Maxime; Deshwar, Amit; Wintersinger, Jeff; Kleinheinz, Kortine; Vázquez-García, Ignacio; Haase, Kerstin; Jerman, Lara; Sengupta, Subhajit; Macintyre, Geoff; Malikic, Salem; Donmez, Nilgun; Livitz, Dimitri G.; Cmero, Marek; Demeulemeester, Jonas; [...]

    Author Correction: The evolutionary history of 2,658 cancers

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    Erschienen in: Nature

  12. Gerstung, Moritz; Jolly, Clemency; Leshchiner, Ignaty; Dentro, Stefan C.; Gonzalez, Santiago; Rosebrock, Daniel; Mitchell, Thomas J.; Rubanova, Yulia; Anur, Pavana; Yu, Kaixian; Tarabichi, Maxime; Deshwar, Amit; Wintersinger, Jeff; Kleinheinz, Kortine; Vázquez-García, Ignacio; Haase, Kerstin; Jerman, Lara; Sengupta, Subhajit; Macintyre, Geoff; Malikic, Salem; Donmez, Nilgun; Livitz, Dimitri G.; Cmero, Marek; Demeulemeester, Jonas; [...]

    The evolutionary history of 2,658 cancers

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature

  13. Zapatka, Marc; Borozan, Ivan; Brewer, Daniel S.; Iskar, Murat; Grundhoff, Adam; Alawi, Malik; Desai, Nikita; Sültmann, Holger; Moch, Holger; Alawi, Malik; Borozan, Ivan; Brewer, Daniel S.; Cooper, Colin S.; Desai, Nikita; Eils, Roland; Ferretti, Vincent; Grundhoff, Adam; Iskar, Murat; Kleinheinz, Kortine; Lichter, Peter; Nakagawa, Hidewaki; Ojesina, Akinyemi I.; Pedamallu, Chandra Sekhar; Schlesner, Matthias; [...]

    Author Correction: The landscape of viral associations in human cancers

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    Erschienen in: Nature Genetics

  14. Zapatka, Marc; Borozan, Ivan; Brewer, Daniel S.; Iskar, Murat; Grundhoff, Adam; Alawi, Malik; Desai, Nikita; Sültmann, Holger; Moch, Holger; Alawi, Malik; Borozan, Ivan; Brewer, Daniel S.; Cooper, Colin S.; Desai, Nikita; Eils, Roland; Ferretti, Vincent; Grundhoff, Adam; Iskar, Murat; Kleinheinz, Kortine; Lichter, Peter; Nakagawa, Hidewaki; Ojesina, Akinyemi I.; Pedamallu, Chandra Sekhar; Schlesner, Matthias; [...]

    The landscape of viral associations in human cancers

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    Erschienen in: Nature Genetics

  15. Cmero, Marek; Yuan, Ke; Ong, Cheng Soon; Schröder, Jan; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Campbell, Peter J.; Cao, Shaolong; Christie, Elizabeth L.; Cun, Yupeng; Dawson, Kevin J.; Demeulemeester, Jonas; Dentro, Stefan C.; Deshwar, Amit G.; Donmez, Nilgun; Drews, Ruben M.; Eils, Roland; Fan, Yu; Fittall, Matthew W.; Garsed, Dale W.; Gerstung, Moritz; [...]

    Author Correction: Inferring structural variant cancer cell fraction

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    Erschienen in: Nature Communications

  16. Rubanova, Yulia; Shi, Ruian; Harrigan, Caitlin F.; Li, Roujia; Wintersinger, Jeff; Sahin, Nil; Deshwar, Amit G.; Dentro, Stefan C.; Leshchiner, Ignaty; Gerstung, Moritz; Jolly, Clemency; Haase, Kerstin; Tarabichi, Maxime; Wintersinger, Jeff; Deshwar, Amit G.; Yu, Kaixian; Gonzalez, Santiago; Rubanova, Yulia; Macintyre, Geoff; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D.; [...]

    Author Correction: Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications

  17. Cmero, Marek; Yuan, Ke; Ong, Cheng Soon; Schröder, Jan; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Campbell, Peter J.; Cao, Shaolong; Christie, Elizabeth L.; Cun, Yupeng; Dawson, Kevin J.; Demeulemeester, Jonas; Dentro, Stefan C.; Deshwar, Amit G.; Donmez, Nilgun; Drews, Ruben M.; Eils, Roland; Fan, Yu; Fittall, Matthew W.; Garsed, Dale W.; Gerstung, Moritz; [...]

    Inferring structural variant cancer cell fraction

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    Erschienen in: Nature Communications

  18. Rubanova, Yulia; Shi, Ruian; Harrigan, Caitlin F.; Li, Roujia; Wintersinger, Jeff; Sahin, Nil; Deshwar, Amit G.; Dentro, Stefan C.; Leshchiner, Ignaty; Gerstung, Moritz; Jolly, Clemency; Haase, Kerstin; Tarabichi, Maxime; Wintersinger, Jeff; Deshwar, Amit G.; Yu, Kaixian; Gonzalez, Santiago; Rubanova, Yulia; Macintyre, Geoff; Adams, David J.; Anur, Pavana; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D.; [...]

    Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig

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    Erschienen in: Nature Communications

  19. Akdemir, Kadir C.; Le, Victoria T.; Chandran, Sahaana; Li, Yilong; Verhaak, Roel G.; Beroukhim, Rameen; Campbell, Peter J.; Chin, Lynda; Dixon, Jesse R.; Futreal, P. Andrew; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; Cortés-Ciriano, Isidro; Dueso-Barroso, Ana; Dunford, Andrew J.; Edwards, Paul A.; [...]

    Author Correction: Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancer

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    Erschienen in: Nature Genetics

  20. Akdemir, Kadir C.; Le, Victoria T.; Chandran, Sahaana; Li, Yilong; Verhaak, Roel G.; Beroukhim, Rameen; Campbell, Peter J.; Chin, Lynda; Dixon, Jesse R.; Futreal, P. Andrew; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; Cortés-Ciriano, Isidro; Dueso-Barroso, Ana; Dunford, Andrew J.; Edwards, Paul A.; [...]

    Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancer

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    Erschienen in: Nature Genetics