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  1. Herruzo, Jose Manuel; Gonzalez Navarro, Sonia; Ibanez, Pablo; Vinals Yufera, Victor; Alastruey, Jesus; Plata, Oscar

    Accelerating Sequence Alignments Based on FM-Index Using the Intel KNL Processor

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    Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2018

    Erschienen in: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

  2. Chacon, Alejandro; Marco-Sola, Santiago; Espinosa, Antonio; Ribeca, Paolo; Moure, Juan Carlos

    Boosting the FM-Index on the GPU: Effective Techniques to Mitigate Random Memory Access

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    Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2015

    Erschienen in: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

  3. Grabowski, Szymon; Mäkinen, Veli; Navarro, Gonzalo

    String Processing and Information Retrieval: First Huffman, Then Burrows-Wheeler: A Simple Alphabet-Independent FM-Index

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    Springer Berlin Heidelberg, 2004

    Erschienen in: String Processing and Information Retrieval

  4. Ullah, M. M. Imdad; Ben Ahmed, Akram; Amano, Hideharu

    Applied Reconfigurable Computing. Architectures, Tools, and Applications: Implementation of FM-Index Based Pattern Search on a Multi-FPGA System

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    Springer International Publishing, 2020

    Erschienen in: Applied Reconfigurable Computing. Architectures, Tools, and Applications

  5. Alatabbi, Ali; Daykin, Jacqueline W.; Mhaskar, Neerja; Rahman, M. Sohel; Smyth, W. F.

    WALCOM: Algorithms and Computation: Applications of V-Order: Suffix Arrays, the Burrows-Wheeler Transform & the FM-index

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    Springer International Publishing, 2019

    Erschienen in: WALCOM: Algorithms and Computation