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  1. Okonechnikov, Konstantin [VerfasserIn] ; k.okonechnikov@gmail.com [MitwirkendeR]; Knut Reinert [MitwirkendeR]; Steven Salzberg [MitwirkendeR]; Fernando Garcia-Alcalde [MitwirkendeR]

    High-throughput RNA sequencing: a step forward in transcriptome analysis ; RNA-Sequenzierung: der große Schritt nach vorn in der Transkriptomforschung

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    Freie Universität Berlin: Refubium (FU Berlin), 2016

  2. Sepp, Mari [VerfasserIn]; Leiss, Kevin [VerfasserIn]; Sarropoulos, Ioannis [VerfasserIn]; Murat, Florent [VerfasserIn]; Okonechnikov, Konstantin [VerfasserIn]; Joshi, Piyush [VerfasserIn]; Leushkin, Evgeny [VerfasserIn]; Mbengue, Noe [VerfasserIn]; Schneider, Céline [VerfasserIn]; Schmidt, Julia [VerfasserIn]; Trost, Nils [VerfasserIn]; Spänig, Lisa [VerfasserIn]; Giere, Peter [VerfasserIn]; Khaitovich, Philipp [VerfasserIn]; Lisgo, Steven [VerfasserIn]; Palkovits, Miklós [VerfasserIn]; Kutscher, Lena [VerfasserIn]; Anders, Simon [VerfasserIn]; Cardoso-Moreira, Margarida [VerfasserIn]; Pfister, Stefan [VerfasserIn]; Kaessmann, Henrik [VerfasserIn]

    Cellular development and evolution of the mammalian cerebellum [research data]

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    Heidelberg: Universität, 2021-12-03

  3. Okonechnikov, Konstantin [VerfasserIn]; Joshi, Piyush [VerfasserIn]; Sepp, Mari [VerfasserIn]; Leiss, Kevin [VerfasserIn]; Sarropoulos, Ioannis [VerfasserIn]; Murat, Florent [VerfasserIn]; Sill, Martin [VerfasserIn]; Beck, Pengbo [VerfasserIn]; Chan, Kenneth Chun-Ho [VerfasserIn]; Korshunov, Andrey [VerfasserIn]; Sahm, Felix [VerfasserIn]; Deng, Maximilian [VerfasserIn]; Sturm, Dominik [VerfasserIn]; DeSisto, John [VerfasserIn]; Donson, Andrew M [VerfasserIn]; Foreman, Nicholas K [VerfasserIn]; Green, Adam L [VerfasserIn]; Robinson, Giles [VerfasserIn]; Orr, Brent A [VerfasserIn]; Gao, Qingsong [VerfasserIn]; Darrow, Emily [VerfasserIn]; Hadley, Jennifer L [VerfasserIn]; Northcott, Paul A [VerfasserIn]; Gojo, Johannes [VerfasserIn]; [...]

    Mapping pediatric brain tumors to their origins in the developing cerebellum

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    October 2023

    Erschienen in: Neuro-Oncology ; 25(2023), 10 vom: Okt., Seite 1895-1909

  4. Okonechnikov, Konstantin [VerfasserIn]; Camgöz, Aylin [VerfasserIn]; Chapman, Owen [VerfasserIn]; Wani, Sameena [VerfasserIn]; Park, Donglim Esther [VerfasserIn]; Hübner, Jens-Martin [VerfasserIn]; Chakraborty, Abhijit [VerfasserIn]; Pagadala, Meghana [VerfasserIn]; Bump, Rosalind [VerfasserIn]; Chandran, Sahaana [VerfasserIn]; Kraft, Katerina [VerfasserIn]; Acuna-Hidalgo, Rocio [VerfasserIn]; Reid, Derek [VerfasserIn]; Sikkink, Kristin [VerfasserIn]; Mauermann, Monika [VerfasserIn]; Juarez, Edwin F. [VerfasserIn]; Jenseit, Anne [VerfasserIn]; Robinson, James T. [VerfasserIn]; Pajtler, Kristian Wilfried [VerfasserIn]; Milde, Till [VerfasserIn]; Jäger, Natalie [VerfasserIn]; Fiesel, Petra [VerfasserIn]; Morgan, Ling [VerfasserIn]; Sridhar, Sunita [VerfasserIn]; [...]

    3D genome mapping identifies subgroup-specific chromosome conformations and tumor-dependency genes in ependymoma

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    21 April 2023

    Erschienen in: Nature Communications ; 14(2023), Artikel-ID 2300, Seite 1-16

  5. Sievers, Philipp [VerfasserIn]; Henneken, Sophie C. [VerfasserIn]; Blume, Christina [VerfasserIn]; Sill, Martin [VerfasserIn]; Schrimpf, Daniel [VerfasserIn]; Stichel, Damian [VerfasserIn]; Okonechnikov, Konstantin [VerfasserIn]; Reuss, David [VerfasserIn]; Benzel, Julia [VerfasserIn]; Maaß, Kendra K. [VerfasserIn]; Kool, Marcel [VerfasserIn]; Sturm, Dominik [VerfasserIn]; Zheng, Tuyu [VerfasserIn]; Ghasemi, David R. [VerfasserIn]; Kohlhof-Meinecke, Patricia [VerfasserIn]; Cruz, Ofelia [VerfasserIn]; Suñol, Mariona [VerfasserIn]; Lavarino, Cinzia [VerfasserIn]; Ruf, Viktoria Constanze Hwei-Chuen [VerfasserIn]; Boldt, Henning B. [VerfasserIn]; Pagès, Mélanie [VerfasserIn]; Pouget, Celso [VerfasserIn]; Schweizer, Leonille [VerfasserIn]; Kranendonk, Mariëtte E. G. [VerfasserIn]; [...]

    Recurrent fusions in PLAGL1 define a distinct subset of pediatric-type supratentorial neuroepithelial tumors

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    05 August 2021

    Erschienen in: Acta neuropathologica ; 142(2021), 5, Seite 827-839

  6. Camgöz, Aylin; Okonechnikov, Konstantin; Chapman, Owen; Maurmann, Monika; Buchholz, Frank; Pfister, Stefan; Chavez, Lukas; Kool, Marcel

    Abstract 3886: 3D genome conformation analysis in ST-EPN-ZFTA ependymoma identifies RCOR2 as a potential target

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    American Association for Cancer Research (AACR), 2022

    Erschienen in: Cancer Research

  7. Joshi, Piyush; Okonechnikov, Konstantin; Sepp, Mari; Sarropoulos, Ioannis; Leiss, Kevin; Kutscher, Lena M; Kaessmann, Henrik; Pfister, Stefan M

    OTHR-04. Single-nucleus transcriptomic atlas of human hindbrain development identifies cellular origins of pediatric brainstem tumors

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    Oxford University Press (OUP), 2022

    Erschienen in: Neuro-Oncology

  8. Kawauchi, Daisuke; Pajtler, Kristian; Wei, Yiju; Okonechnikov, Konstantin; Silva, Patricia; Jones, David; Hoshino, Mikio; Pfister, Stefan; Kool, Marcel; Li, Wei

    TB-06 MOLECULAR MECHANISM OF BRAIN TUMOUR FORMATION DRIVEN BY SUPRATENTORIAL EPENDYMOMA-SPECIFIC YAP1 FUSION GENES

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    Oxford University Press (OUP), 2019

    Erschienen in: Neuro-Oncology Advances

  9. Okonechnikov, Konstantin; Federico, Aniello; Schrimpf, Daniel; Sievers, Philipp; Sahm, Felix; Koster, Jan; Jones, David T. W.; von Deimling, Andreas; Pfister, Stefan M.; Kool, Marcel; Korshunov, Andrey

    Comparison of transcriptome profiles between medulloblastoma primary and recurrent tumors uncovers novel variance effects in relapses

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Acta Neuropathologica Communications

  10. Ghasemi, David R; Okonechnikov, Konstantin; Tirier, Stephan; Rademacher, Anne; Mallm, Jan-Philipp; Ernst, Kati; Rippe, Karsten; Korshunov, Andrey; Pfister, Stefan M; Pajtler, Kristian W

    MEDB-60. Medulloblastoma with extensive nodularity mimics cerebellar development and differentiates along the granular precursor lineage

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    Oxford University Press (OUP), 2022

    Erschienen in: Neuro-Oncology

  11. Okonechnikov, Konstantin; Joshi, Piyush; Sepp, Mari; Leiss, Kevin; Sarropoulos, Ioannis; Jones, David T W; Kool, Marcel; Jäger, Natalie; Kutscher, Lena M; Kaessmann, Henrik; Pfister, Stefan M

    TBIO-02. Mapping the origins of pediatric brain tumors to cell type lineages in the developing cerebellum

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    Oxford University Press (OUP), 2022

    Erschienen in: Neuro-Oncology

  12. Ballabio, Claudio; Gianesello, Matteo; Lago, Chiara; Okonechnikov, Konstantin; Anderle, Marica; Aiello, Giuseppe; Antonica, Francesco; Zhang, Tingting; Gianno, Francesca; Giangaspero, Felice; Hassan, Bassem A.; Pfister, Stefan M.; Tiberi, Luca

    Notch1 switches progenitor competence in inducing medulloblastoma

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    American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2021

    Erschienen in: Science Advances