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  1. Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Greger, Liliana; Li, Siliang; [...]

    Author Correction: Genomic basis for RNA alterations in cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature

  2. Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Calabrese, Claudia; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Kahles, André; Lehmann, Kjong-Van; Liu, Fenglin; Shiraishi, Yuichi; Soulette, Cameron M.; Urban, Lara; Greger, Liliana; Li, Siliang; [...]

    Genomic basis for RNA alterations in cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature

  3. Rheinbay, Esther; Nielsen, Morten Muhlig; Abascal, Federico; Wala, Jeremiah A.; Shapira, Ofer; Tiao, Grace; Hornshøj, Henrik; Hess, Julian M.; Juul, Randi Istrup; Lin, Ziao; Feuerbach, Lars; Sabarinathan, Radhakrishnan; Madsen, Tobias; Kim, Jaegil; Mularoni, Loris; Shuai, Shimin; Lanzós, Andrés; Herrmann, Carl; Maruvka, Yosef E.; Shen, Ciyue; Amin, Samirkumar B.; Bandopadhayay, Pratiti; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; [...]

    Author Correction: Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature

  4. Carlevaro-Fita, Joana; Lanzós, Andrés; Feuerbach, Lars; Hong, Chen; Mas-Ponte, David; Pedersen, Jakob Skou; Abascal, Federico; Amin, Samirkumar B.; Bader, Gary D.; Barenboim, Jonathan; Beroukhim, Rameen; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; Brunak, Søren; Campbell, Peter J.; Carlevaro-Fita, Joana; Chakravarty, Dimple; Chan, Calvin Wing Yiu; Chen, Ken; Choi, Jung Kyoon; Deu-Pons, Jordi; Dhingra, Priyanka; Diamanti, Klev; Feuerbach, Lars; [...]

    Author Correction: Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Communications Biology

  5. Shuai, Shimin; Abascal, Federico; Amin, Samirkumar B.; Bader, Gary D.; Bandopadhayay, Pratiti; Barenboim, Jonathan; Beroukhim, Rameen; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; Brunak, Søren; Campbell, Peter J.; Carlevaro-Fita, Joana; Chakravarty, Dimple; Chan, Calvin Wing Yiu; Chen, Ken; Choi, Jung Kyoon; Deu-Pons, Jordi; Dhingra, Priyanka; Diamanti, Klev; Feuerbach, Lars; Fink, J. Lynn; Fonseca, Nuno A.; Frigola, Joan; Gambacorti-Passerini, Carlo; [...]

    Author Correction: Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications

  6. Zhang, Yiqun; Chen, Fengju; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Fujita, Masashi; Nakagawa, Hidewaki; Zhang, Zemin; Brazma, Alvis; Amin, Samirkumar B.; Awadalla, Philip; Bailey, Peter J.; Brazma, Alvis; Brooks, Angela N.; Calabrese, Claudia; Chateigner, Aurélien; Cortés-Ciriano, Isidro; Craft, Brian; Craft, David; Creighton, Chad J.; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Erkek, Serap; Fonseca, Nuno A.; Frenkel-Morgenstern, Milana; [...]

    Author Correction: High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterations

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications

  7. Paczkowska, Marta; Barenboim, Jonathan; Sintupisut, Nardnisa; Fox, Natalie S.; Zhu, Helen; Abd-Rabbo, Diala; Mee, Miles W.; Boutros, Paul C.; Abascal, Federico; Amin, Samirkumar B.; Bader, Gary D.; Beroukhim, Rameen; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; Brunak, Søren; Campbell, Peter J.; Carlevaro-Fita, Joana; Chakravarty, Dimple; Chan, Calvin Wing Yiu; Chen, Ken; Choi, Jung Kyoon; Deu-Pons, Jordi; Dhingra, Priyanka; Diamanti, Klev; [...]

    Author Correction: Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications

  8. Reyna, Matthew A.; Haan, David; Paczkowska, Marta; Verbeke, Lieven P. C.; Vazquez, Miguel; Kahraman, Abdullah; Pulido-Tamayo, Sergio; Barenboim, Jonathan; Wadi, Lina; Dhingra, Priyanka; Shrestha, Raunak; Getz, Gad; Lawrence, Michael S.; Pedersen, Jakob Skou; Rubin, Mark A.; Wheeler, David A.; Brunak, Søren; Izarzugaza, Jose M. G.; Khurana, Ekta; Marchal, Kathleen; von Mering, Christian; Sahinalp, S. Cenk; Valencia, Alfonso; Abascal, Federico; [...]

    Author Correction: Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications

  9. Rheinbay, Esther; Nielsen, Morten Muhlig; Abascal, Federico; Wala, Jeremiah A.; Shapira, Ofer; Tiao, Grace; Hornshøj, Henrik; Hess, Julian M.; Juul, Randi Istrup; Lin, Ziao; Feuerbach, Lars; Sabarinathan, Radhakrishnan; Madsen, Tobias; Kim, Jaegil; Mularoni, Loris; Shuai, Shimin; Lanzós, Andrés; Herrmann, Carl; Maruvka, Yosef E.; Shen, Ciyue; Amin, Samirkumar B.; Bandopadhayay, Pratiti; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; [...]

    Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature

  10. Carlevaro-Fita, Joana; Lanzós, Andrés; Feuerbach, Lars; Hong, Chen; Mas-Ponte, David; Pedersen, Jakob Skou; Abascal, Federico; Amin, Samirkumar B.; Bader, Gary D.; Barenboim, Jonathan; Beroukhim, Rameen; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; Brunak, Søren; Campbell, Peter J.; Carlevaro-Fita, Joana; Chakravarty, Dimple; Chan, Calvin Wing Yiu; Chen, Ken; Choi, Jung Kyoon; Deu-Pons, Jordi; Dhingra, Priyanka; Diamanti, Klev; Feuerbach, Lars; [...]

    Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis

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    Erschienen in: Communications Biology

  11. Shuai, Shimin; Abascal, Federico; Amin, Samirkumar B.; Bader, Gary D.; Bandopadhayay, Pratiti; Barenboim, Jonathan; Beroukhim, Rameen; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; Brunak, Søren; Campbell, Peter J.; Carlevaro-Fita, Joana; Chakravarty, Dimple; Chan, Calvin Wing Yiu; Chen, Ken; Choi, Jung Kyoon; Deu-Pons, Jordi; Dhingra, Priyanka; Diamanti, Klev; Feuerbach, Lars; Fink, J. Lynn; Fonseca, Nuno A.; Frigola, Joan; Gambacorti-Passerini, Carlo; [...]

    Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature Communications

  12. Zhang, Yiqun; Chen, Fengju; Fonseca, Nuno A.; He, Yao; Fujita, Masashi; Nakagawa, Hidewaki; Zhang, Zemin; Brazma, Alvis; Amin, Samirkumar B.; Awadalla, Philip; Bailey, Peter J.; Brazma, Alvis; Brooks, Angela N.; Calabrese, Claudia; Chateigner, Aurélien; Cortés-Ciriano, Isidro; Craft, Brian; Craft, David; Creighton, Chad J.; Davidson, Natalie R.; Demircioğlu, Deniz; Erkek, Serap; Fonseca, Nuno A.; Frenkel-Morgenstern, Milana; [...]

    High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterations

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature Communications

  13. Paczkowska, Marta; Barenboim, Jonathan; Sintupisut, Nardnisa; Fox, Natalie S.; Zhu, Helen; Abd-Rabbo, Diala; Mee, Miles W.; Boutros, Paul C.; Abascal, Federico; Amin, Samirkumar B.; Bader, Gary D.; Beroukhim, Rameen; Bertl, Johanna; Boroevich, Keith A.; Brunak, Søren; Campbell, Peter J.; Carlevaro-Fita, Joana; Chakravarty, Dimple; Chan, Calvin Wing Yiu; Chen, Ken; Choi, Jung Kyoon; Deu-Pons, Jordi; Dhingra, Priyanka; Diamanti, Klev; [...]

    Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature Communications

  14. Reyna, Matthew A.; Haan, David; Paczkowska, Marta; Verbeke, Lieven P. C.; Vazquez, Miguel; Kahraman, Abdullah; Pulido-Tamayo, Sergio; Barenboim, Jonathan; Wadi, Lina; Dhingra, Priyanka; Shrestha, Raunak; Getz, Gad; Lawrence, Michael S.; Pedersen, Jakob Skou; Rubin, Mark A.; Wheeler, David A.; Brunak, Søren; Izarzugaza, Jose M. G.; Khurana, Ekta; Marchal, Kathleen; von Mering, Christian; Sahinalp, S. Cenk; Valencia, Alfonso; Abascal, Federico; [...]

    Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature Communications

  15. Cortés-Ciriano, Isidro; Lee, Jake June-Koo; Xi, Ruibin; Jain, Dhawal; Jung, Youngsook L.; Yang, Lixing; Gordenin, Dmitry; Klimczak, Leszek J.; Zhang, Cheng-Zhong; Pellman, David S.; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Beroukhim, Rameen; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; Cortés-Ciriano, Isidro; Dueso-Barroso, Ana; Dunford, Andrew J.; [...]

    Author Correction: Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature Genetics

  16. Yuan, Yuan; Ju, Young Seok; Kim, Youngwook; Li, Jun; Wang, Yumeng; Yoon, Christopher J.; Yang, Yang; Martincorena, Inigo; Creighton, Chad J.; Weinstein, John N.; Xu, Yanxun; Han, Leng; Kim, Hyung-Lae; Nakagawa, Hidewaki; Park, Keunchil; Campbell, Peter J.; Liang, Han; Aaltonen, Lauri A.; Abascal, Federico; Abeshouse, Adam; Aburatani, Hiroyuki; Adams, David J.; Agrawal, Nishant; Ahn, Keun Soo; [...]

    Author Correction: Comprehensive molecular characterization of mitochondrial genomes in human cancers

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature Genetics

  17. Akdemir, Kadir C.; Le, Victoria T.; Chandran, Sahaana; Li, Yilong; Verhaak, Roel G.; Beroukhim, Rameen; Campbell, Peter J.; Chin, Lynda; Dixon, Jesse R.; Futreal, P. Andrew; Akdemir, Kadir C.; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Boutros, Paul C.; Bowtell, David D. L.; Brors, Benedikt; Burns, Kathleen H.; Campbell, Peter J.; Chan, Kin; Chen, Ken; Cortés-Ciriano, Isidro; Dueso-Barroso, Ana; Dunford, Andrew J.; Edwards, Paul A.; [...]

    Author Correction: Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature Genetics

  18. Aaltonen, Lauri A.; Abascal, Federico; Abeshouse, Adam; Aburatani, Hiroyuki; Adams, David J.; Agrawal, Nishant; Ahn, Keun Soo; Ahn, Sung-Min; Aikata, Hiroshi; Akbani, Rehan; Akdemir, Kadir C.; Al-Ahmadie, Hikmat; Al-Sedairy, Sultan T.; Al-Shahrour, Fatima; Alawi, Malik; Albert, Monique; Aldape, Kenneth; Alexandrov, Ludmil B.; Ally, Adrian; Alsop, Kathryn; Alvarez, Eva G.; Amary, Fernanda; Amin, Samirkumar B.; Aminou, Brice; [...]

    Author Correction: Pan-cancer analysis of whole genomes

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature

  19. Rodriguez-Martin, Bernardo; Alvarez, Eva G.; Baez-Ortega, Adrian; Zamora, Jorge; Supek, Fran; Demeulemeester, Jonas; Santamarina, Martin; Ju, Young Seok; Temes, Javier; Garcia-Souto, Daniel; Detering, Harald; Li, Yilong; Rodriguez-Castro, Jorge; Dueso-Barroso, Ana; Bruzos, Alicia L.; Dentro, Stefan C.; Blanco, Miguel G.; Contino, Gianmarco; Ardeljan, Daniel; Tojo, Marta; Roberts, Nicola D.; Zumalave, Sonia; Edwards, Paul A.; Weischenfeldt, Joachim; [...]

    Author Correction: Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature Genetics