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  1. Rougny, Adrien [Verfasser:in]; Touré, Vasundra [Verfasser:in]; Moodie, Stuart [Verfasser:in]; Balaur, Irina [Verfasser:in]; Czauderna, Tobias [Verfasser:in]; Borlinghaus, Hanna [Verfasser:in]; Dogrusoz, Ugur [Verfasser:in]; Mazein, Alexander [Verfasser:in]; Dräger, Andreas [Verfasser:in]; Blinov, Michael L [Verfasser:in]; Villéger, Alice [Verfasser:in]; Haw, Robin [Verfasser:in]; Demir, Emek [Verfasser:in]; Mi, Huaiyu [Verfasser:in]; Sorokin, Anatoly [Verfasser:in]; Schreiber, Falk [Verfasser:in]; Luna, Augustin [Verfasser:in]

    Systems Biology Graphical Notation: Process Description language Level 1 Version 2.0

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    Konstanz: KOPS Universität Konstanz, 2019

  2. Rougny, Adrien [Verfasser:in]; Touré, Vasundra [Verfasser:in]; Moodie, Stuart [Verfasser:in]; Balaur, Irina [Verfasser:in]; Czauderna, Tobias [Verfasser:in]; Borlinghaus, Hanna [Verfasser:in]; Dogrusoz, Ugur [Verfasser:in]; Mazein, Alexander [Verfasser:in]; Dräger, Andreas [Verfasser:in]; Blinov, Michael L [Verfasser:in]; Villéger, Alice [Verfasser:in]; Haw, Robin [Verfasser:in]; Demir, Emek [Verfasser:in]; Mi, Huaiyu [Verfasser:in]; Sorokin, Anatoly [Verfasser:in]; Schreiber, Falk [Verfasser:in]; Luna, Augustin [Verfasser:in]

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    KOPS - The Institutional Repository of the University of Konstanz, 2019-06-26

    Erschienen in: Journal of integrative bioinformatics. 2019, 16(2), 20190022. eISSN 1613-4516. Available under: doi:10.1515/jib-2019-0022

  3. Niarakis, Anna [Verfasser:in]; Ostaszewski, Marek [Verfasser:in]; Mazein, Alexander [Verfasser:in]; Kuperstein, Inna [Verfasser:in]; Kutmon, Martina [Verfasser:in]; Gillespie, Marc E. [Verfasser:in]; Funahashi, Akira [Verfasser:in]; Acencio, Marcio Luis [Verfasser:in]; Hemedan, Ahmed [Verfasser:in]; Aichem, Michael [Verfasser:in]; Klein, Karsten [Verfasser:in]; Czauderna, Tobias [Verfasser:in]; Burtscher, Felicia [Verfasser:in]; Yamada, Takahiro G. [Verfasser:in]; Hiki, Yusuke [Verfasser:in]; Hiroi, Noriko F. [Verfasser:in]; Hu, Finterly [Verfasser:in]; Pham, Nhung [Verfasser:in]; Ehrhart, Friederike [Verfasser:in]; Willighagen, Egon L. [Verfasser:in]; Valdeolivas, Alberto [Verfasser:in]; Dugourd, Aurélien [Verfasser:in]; Messina, Francesco [Verfasser:in]; Esteban-Medina, Marina [Verfasser:in]; [...]

    Drug-target identification in COVID-19 disease mechanisms using computational systems biology approaches

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    13 February 2024

    Erschienen in: Frontiers in immunology ; 14(2023), Artikel-ID 1282859, Seite 1-24

  12. Balaur, Irina; Saqi, Mansoor; Barat, Ana; Lysenko, Artem; Mazein, Alexander; Rawlings, Christopher J.; Ruskin, Heather J.; Auffray, Charles

    EpiGeNet: A Graph Database of Interdependencies Between Genetic and Epigenetic Events in Colorectal Cancer

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    Mary Ann Liebert Inc, 2017

    Erschienen in: Journal of Computational Biology, 24 (2017) 10, Seite 969-980

  13. Pereira, Catarina; Mazein, Alexander; Farinha, Carlos M.; Gray, Michael A.; Kunzelmann, Karl; Ostaszewski, Marek; Balaur, Irina; Amaral, Margarida D.; Falcao, Andre O.

    CyFi-MAP: an interactive pathway-based resource for cystic fibrosis

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    Springer Science and Business Media LLC, 2021

    Erschienen in: Scientific Reports, 11 (2021) 1

  14. Hussein, Rada; Balaur, Irina; Burmann, Anja; Ćwiek-Kupczyńska, Hanna; Gadiya, Yojana; Ghosh, Soumyabrata; Jayathissa, Prabath; Katsch, Florian; Kremer, Andreas; Lähteenmäki, Jaakko; Meng, Zhaoling; Morasek, Kathrin; C. Rancourt, Rebecca; Satagopam, Venkata; Sauermann, Stefan; Scheider, Simon; Stamm, Tanja; Muehlendyck, Christian; Gribbon, Philip

    Getting ready for the European Health Data Space (EHDS): IDERHA's plan to align with the latest EHDS requirements for the secondary use of health data

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    F1000 Research Ltd, 2024

    Erschienen in: Open Research Europe, 4 (2024), Seite 160

  15. Mazein, Alexander; Acencio, Marcio Luis; Balaur, Irina; Rougny, Adrien; Welter, Danielle; Niarakis, Anna; Ramirez Ardila, Diana; Dogrusoz, Ugur; Gawron, Piotr; Satagopam, Venkata; Gu, Wei; Kremer, Andreas; Schneider, Reinhard; Ostaszewski, Marek

    A guide for developing comprehensive systems biology maps of disease mechanisms: planning, construction and maintenance

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    Frontiers Media SA, 2023

    Erschienen in: Frontiers in Bioinformatics, 3 (2023)

  16. Rougny, Adrien; Touré, Vasundra; Moodie, Stuart; Balaur, Irina; Czauderna, Tobias; Borlinghaus, Hanna; Dogrusoz, Ugur; Mazein, Alexander; Dräger, Andreas; Blinov, Michael L.; Villéger, Alice; Haw, Robin; Demir, Emek; Mi, Huaiyu; Sorokin, Anatoly; Schreiber, Falk; Luna, Augustin

    Systems Biology Graphical Notation: Process Description language Level 1 Version 2.0

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    Walter de Gruyter GmbH, 2019

    Erschienen in: Journal of Integrative Bioinformatics, 16 (2019) 2

  17. Mazein, Alexander; Ivanova, Olga; Balaur, Irina; Ostaszewski, Marek; Berzhitskaya, Valeriya; Serebriyskaya, Tatiana; Ligon, Thomas; Hasenauer, Jan; De Meulder, Bertrand; Overall, Rupert W.; Roy, Ludovic; Knowles, Richard G.; Wheelock, Craig E.; Dahlen, Sven-Erik; Chung, Kian Fan; Adcock, Ian M.; Roberts, Graham; Djukanovic, Ratko; Pellet, Johann; Gawron, Piotr; Balling, Rudi; Maitland-van der Zee, Anke H.; Schneider, Reinhard; Sterk, Peter J.;

    AsthmaMap: An interactive knowledge repository for mechanisms of asthma

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    Elsevier BV, 2021

    Erschienen in: Journal of Allergy and Clinical Immunology, 147 (2021) 3, Seite 853-856

  18. Mazein, Alexander; Ostaszewski, Marek; Kuperstein, Inna; Watterson, Steven; Le Novère, Nicolas; Lefaudeux, Diane; De Meulder, Bertrand; Pellet, Johann; Balaur, Irina; Saqi, Mansoor; Nogueira, Maria Manuela; He, Feng; Parton, Andrew; Lemonnier, Nathanaël; Gawron, Piotr; Gebel, Stephan; Hainaut, Pierre; Ollert, Markus; Dogrusoz, Ugur; Barillot, Emmanuel; Zinovyev, Andrei; Schneider, Reinhard; Balling, Rudi; Auffray, Charles

    Systems medicine disease maps: community-driven comprehensive representation of disease mechanisms

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    Springer Science and Business Media LLC, 2018

    Erschienen in: npj Systems Biology and Applications, 4 (2018) 1

  19. De Meulder, Bertrand; Lefaudeux, Diane; Bansal, Aruna T.; Mazein, Alexander; Chaiboonchoe, Amphun; Ahmed, Hassan; Balaur, Irina; Saqi, Mansoor; Pellet, Johann; Ballereau, Stéphane; Lemonnier, Nathanaël; Sun, Kai; Pandis, Ioannis; Yang, Xian; Batuwitage, Manohara; Kretsos, Kosmas; van Eyll, Jonathan; Bedding, Alun; Davison, Timothy; Dodson, Paul; Larminie, Christopher; Postle, Anthony; Corfield, Julie; Djukanovic, Ratko; [...]

    A computational framework for complex disease stratification from multiple large-scale datasets

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    Springer Science and Business Media LLC, 2018

    Erschienen in: BMC Systems Biology, 12 (2018) 1

  20. Niarakis, Anna; Ostaszewski, Marek; Mazein, Alexander; Kuperstein, Inna; Kutmon, Martina; Gillespie, Marc E.; Funahashi, Akira; Acencio, Marcio Luis; Hemedan, Ahmed; Aichem, Michael; Klein, Karsten; Czauderna, Tobias; Burtscher, Felicia; Yamada, Takahiro G.; Hiki, Yusuke; Hiroi, Noriko F.; Hu, Finterly; Pham, Nhung; Ehrhart, Friederike; Willighagen, Egon L.; Valdeolivas, Alberto; Dugourd, Aurelien; Messina, Francesco; Esteban-Medina, Marina; [...]

    Drug-target identification in COVID-19 disease mechanisms using computational systems biology approaches

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    Frontiers Media SA, 2024

    Erschienen in: Frontiers in Immunology, 14 (2024)