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Xue, Haoliang [Verfasser:in] ; université Paris-Saclay [Mitwirkende:r]; Gautheret, Daniel [Mitwirkende:r]

k-mer based analysis for cancer transcriptomics at nucleotide resolution ; Analyse de k-mers pour la transcriptomique du cancer à la résolution du nucléotide

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theses.fr, 2021-12-13
Kehr, Stephanie [Verfasser:in] ; Hertel, Jana [Akademische:r Betreuer:in]; Stadler, Peter F. [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]; Gautheret, Daniel [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]

Expanding the SnoRNA Interaction Network : Conservation of Guiding Function in Vertebrates

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Leipzig: Universitätsbibliothek Leipzig, 2016
Nguyen, Thi Ngoc Ha [Verfasser:in] ; université Paris-Saclay [Mitwirkende:r]; Gautheret, Daniel [Mitwirkende:r]; Ponty, Yann [Mitwirkende:r]

Combining machine learning and reference-free transcriptome analysis for the identification of prostate cancer signatures ; Combiner apprentissage automatique et analyse transcriptomique sans référence pour l'identification de signatures du cancer de la prostate

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theses.fr, 2020-12-18
Robert, Caroline; Gautheret, Daniel

Multi-omics prediction in melanoma immunotherapy: A new brick in the wall

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Elsevier BV, 2022

Erschienen in: Cancer Cell, 40 (2022) 1, Seite 14-16
Morillon, Antonin; Gautheret, Daniel

Bridging the gap between reference and real transcriptomes

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Springer Science and Business Media LLC, 2019

Erschienen in: Genome Biology, 20 (2019) 1
Naville, Magali; Gautheret, Daniel

Premature terminator analysis sheds light on a hidden world of bacterial transcriptional attenuation

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Springer Science and Business Media LLC, 2010

Erschienen in: Genome Biology, 11 (2010) 9, Seite R97
Legendre, Matthieu; Gautheret, Daniel

Sequence determinants in human polyadenylation site selection

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Springer Science and Business Media LLC, 2003

Erschienen in: BMC Genomics, 4 (2003) 1
Gautheret, Daniel; Lambert, André

Direct RNA motif definition and identification from multiple sequence alignments using secondary structure profiles 1 1Edited by J. Doudna

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Elsevier BV, 2001

Erschienen in: Journal of Molecular Biology, 313 (2001) 5, Seite 1003-1011
Beaudoing, Emmanuel; Gautheret, Daniel

Identification of Alternate Polyadenylation Sites and Analysis of their Tissue Distribution Using EST Data

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Cold Spring Harbor Laboratory, 2001

Erschienen in: Genome Research, 11 (2001) 9, Seite 1520-1526
Drubay, Damien; Gautheret, Daniel; Michiels, Stefan

A benchmark study of scoring methods for non-coding mutations

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Oxford University Press (OUP), 2018

Erschienen in: Bioinformatics, 34 (2018) 10, Seite 1635-1641
Drubay, Damien; Gautheret, Daniel; Michiels, Stefan

Abstract 388: A benchmark study for identifying cancer drivers in the non-coding part of the genome

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American Association for Cancer Research (AACR), 2017

Erschienen in: Cancer Research, 77 (2017) 13_Supplement, Seite 388-388
Toffano-Nioche, Claire; Gautheret, Daniel; Leclerc, Fabrice

Revisiting the structure/function relationships of H/ACA(-like) RNAs: a unified model for Euryarchaea and Crenarchaea

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Oxford University Press (OUP), 2015

Erschienen in: Nucleic Acids Research, 43 (2015) 16, Seite 7744-7761
Lehmann, Jean; Jossinet, Fabrice; Gautheret, Daniel

A universal RNA structural motif docking the elbow of tRNA in the ribosome, RNAse P and T-box leaders

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Oxford University Press (OUP), 2013

Erschienen in: Nucleic Acids Research, 41 (2013) 10, Seite 5494-5502
Ritchie, William; Théodule, François-Xavier; Gautheret, Daniel

Mireval: a web tool for simple microRNA prediction in genome sequences

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Oxford University Press (OUP), 2008

Erschienen in: Bioinformatics, 24 (2008) 11, Seite 1394-1396
Ritchie, William; Legendre, Matthieu; Gautheret, Daniel

RNA stem–loops: To be or not to be cleaved by RNAse III

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Cold Spring Harbor Laboratory, 2007

Erschienen in: RNA, 13 (2007) 4, Seite 457-462
Legendre, Matthieu; Lambert, André; Gautheret, Daniel

Profile-based detection of microRNA precursors in animal genomes

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Oxford University Press (OUP), 2005

Erschienen in: Bioinformatics, 21 (2005) 7, Seite 841-845
Steinberg, Sergey; Gautheret, Daniel; Cedergren, Robert

Fitting the structurally diverse animal mitochondrial tRNAsSer to common three-dimensional constraitns

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Elsevier BV, 1994

Erschienen in: Journal of Molecular Biology, 236 (1994) 4, Seite 982-989
Gautheret, Daniel; Konings, Danielle; Gutell, Robin R.

A major family of motifs involving G ? A mismatches in ribosomal RNA

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Elsevier BV, 1994

Erschienen in: Journal of Molecular Biology, 242 (1994) 1, Seite 1-8
Laferrière, Alain; Gautheret, Daniel; Cedergren, Robert

An RNA pattern matching program with enhanced performance and portability

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Oxford University Press (OUP), 1994

Erschienen in: Bioinformatics, 10 (1994) 2, Seite 211-212
Gautheret, Daniel; Major, François; Cedergren, Robert

Modeling the Three-dimensional Structure of RNA Using Discrete Nucleotide Conformational Sets

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Elsevier BV, 1993

Erschienen in: Journal of Molecular Biology, 229 (1993) 4, Seite 1049-1064

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