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Voges, Jan [Verfasser:in]; Hernaez, Mikel [Verfasser:in]; Mattavelli, Marco [Verfasser:in]; Ostermann, Jorn [Verfasser:in]

An Introduction to MPEG-G: The First Open ISO/IEC Standard for the Compression and Exchange of Genomic Sequencing Data

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Hannover: Gottfried Wilhelm Leibniz Universität Hannover, 2021 ; Hannover: Technische Informationsbibliothek (TIB), 2021

Erschienen in: Proceedings of the IEEE (PROC) ; 109 (2021), Nr. 9, S. 1607-1622
Voges, Jan [Verfasser:in]; Hernaez, Mikel [Verfasser:in]; Mattavelli, Marco [Verfasser:in]; Ostermann, Jorn [Verfasser:in]

An Introduction to MPEG-G: The First Open ISO/IEC Standard for the Compression and Exchange of Genomic Sequencing Data - [published Version]

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New York, NY [u.a.] : Inst., 2021

Erschienen in: Proceedings of the IEEE (PROC) 109 (2021), Nr. 9 ; Proceedings of the IEEE (PROC)
Voges, Jan [Verfasser:in]; Paridaens, Tom [Verfasser:in]; Müntefering, Fabian [Verfasser:in]; Mainzer, Liudmila S. [Verfasser:in]; Bliss, Brian [Verfasser:in]; Yang, Mingyu [Verfasser:in]; Ochoa, Idoia [Verfasser:in]; Fostier, Jan [Verfasser:in]; Ostermann, Jörn [Verfasser:in]; Hernaez, Mikel [Verfasser:in]

GABAC : An arithmetic coding solution for genomic data - [published Version]

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Oxford : Oxford Univ. Press, 2020

Erschienen in: Bioinformatics 36 (2020), Nr. 7
Voges, Jan [Verfasser:in]; Paridaens, Tom [Verfasser:in]; Müntefering, Fabian [Verfasser:in]; Mainzer, Liudmila S. [Verfasser:in]; Bliss, Brian [Verfasser:in]; Yang, Mingyu [Verfasser:in]; Ochoa, Idoia [Verfasser:in]; Fostier, Jan [Verfasser:in]; Ostermann, Jörn [Verfasser:in]; Hernaez, Mikel [Verfasser:in]

GABAC : An arithmetic coding solution for genomic data

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Hannover: Gottfried Wilhelm Leibniz Universität Hannover, 2020 ; Hannover: Technische Informationsbibliothek (TIB), 2020

Erschienen in: Bioinformatics ; 36 (2020), Nr. 7, S. 2275-2277
Vidal, Gerard; Hernaez, Mikel

Financial Cryptography and Data Security: Communication Services Empowered with a Classical Chaos Based Cryptosystem

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Springer Berlin Heidelberg, 2013

Erschienen in: Financial Cryptography and Data Security (2013), Seite 403-403
Hernaez, Mikel; Blatti, Charles; Gevaert, Olivier

Comparison of single and module-based methods for modeling gene regulatory networks

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Oxford University Press (OUP), 2020

Erschienen in: Bioinformatics, 36 (2020) 2, Seite 558-567
Meng, Qingxi; Ochoa, Idoia; Hernaez, Mikel

GPress: a framework for querying general feature format (GFF) files and expression files in a compressed form

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Oxford University Press (OUP), 2020

Erschienen in: Bioinformatics, 36 (2020) 18, Seite 4810-4812
Voges, Jan; Ostermann, Jörn; Hernaez, Mikel

CALQ: compression of quality values of aligned sequencing data

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Oxford University Press (OUP), 2018

Erschienen in: Bioinformatics, 34 (2018) 10, Seite 1650-1658
Alustiza, Iker; Hernaez, Mikel; Crespo, Pedro

Design of a new scheme for multi-hop wireless networks using decode-and-forward strategy

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Springer Science and Business Media LLC, 2015

Erschienen in: EURASIP Journal on Wireless Communications and Networking, 2015 (2015) 1
Ochoa, Idoia; Hernaez, Mikel; Weissman, Tsachy

iDoComp: a compression scheme for assembled genomes

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Oxford University Press (OUP), 2015

Erschienen in: Bioinformatics, 31 (2015) 5, Seite 626-633
Ochoa, Idoia; Crespo, Pedro M.; Hernaez, Mikel

LDPC Codes for Non-Uniform Memoryless Sources and Unequal Energy Allocation

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Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2010

Erschienen in: IEEE Communications Letters, 14 (2010) 9, Seite 794-796
Chembazhi, Ullas V.; Bangru, Sushant; Hernaez, Mikel; Kalsotra, Auinash

Cellular plasticity balances the metabolic and proliferation dynamics of a regenerating liver

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Cold Spring Harbor Laboratory, 2021

Erschienen in: Genome Research, 31 (2021) 4, Seite 576-591
Voges, Jan; Hernaez, Mikel; Mattavelli, Marco; Ostermann, Jorn

An Introduction to MPEG-G: The First Open ISO/IEC Standard for the Compression and Exchange of Genomic Sequencing Data

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Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2021

Erschienen in: Proceedings of the IEEE, 109 (2021) 9, Seite 1607-1622
Zheng, Hong; Brennan, Kevin; Hernaez, Mikel; Gevaert, Olivier

Benchmark of long non-coding RNA quantification for RNA sequencing of cancer samples

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Oxford University Press (OUP), 2019

Erschienen in: GigaScience, 8 (2019) 12
Fischer-Hwang, Irena; Ochoa, Idoia; Weissman, Tsachy; Hernaez, Mikel

Denoising of Aligned Genomic Data

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Springer Science and Business Media LLC, 2019

Erschienen in: Scientific Reports, 9 (2019) 1
Hernaez, Mikel; Pavlichin, Dmitri; Weissman, Tsachy; Ochoa, Idoia

Genomic Data Compression

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Annual Reviews, 2019

Erschienen in: Annual Review of Biomedical Data Science, 2 (2019) 1, Seite 19-37
Chandak, Shubham; Tatwawadi, Kedar; Ochoa, Idoia; Hernaez, Mikel; Weissman, Tsachy

SPRING: a next-generation compressor for FASTQ data

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Oxford University Press (OUP), 2019

Erschienen in: Bioinformatics, 35 (2019) 15, Seite 2674-2676
Zheng, Hong; Hernaez, Mikel; Brennan, Kevin; Gevaert, Olivier

Abstract 2472: Benchmark of lncRNA quantification in RNA-Seq of cancer samples

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American Association for Cancer Research (AACR), 2018

Erschienen in: Cancer Research, 78 (2018) 13_Supplement, Seite 2472-2472
Roguski, Łukasz; Ochoa, Idoia; Hernaez, Mikel; Deorowicz, Sebastian

FaStore: a space-saving solution for raw sequencing data

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Oxford University Press (OUP), 2018

Erschienen in: Bioinformatics, 34 (2018) 16, Seite 2748-2756
Deorowicz, Sebastian; Grabowski, Szymon; Ochoa, Idoia; Hernaez, Mikel; Weissman, Tsachy

Comment on: ‘ERGC: an efficient referential genome compression algorithm’

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Oxford University Press (OUP), 2016

Erschienen in: Bioinformatics, 32 (2016) 7, Seite 1115-1117

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