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Merelli, Ivan [Veranstalter:in]; Leporati, Francesco [Veranstalter:in]; Danese, Giovanni [Veranstalter:in] ; Euromicro International Conference on Parallel, Distributed and Network-Based Processing 27. 2019 Pavia

27th Euromicro International Conference on Parallel, Distributed and Network-Based Processing : PDP 2019 : Pavia, Italy, 13-15 February 2019 : proceedings

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Piscataway, NJ: IEEE, 2019
Merelli, Ivan [Herausgeber:in]; Liò, Pietro [Herausgeber:in]; Kotenko, Igor [Herausgeber:in] ; Euromicro International Conference on Parallel, Distributed, and Network-Based Processing 26. 2018 Cambridge, European Organisation for Information Technology and Microelectronics

26th Euromicro International Conference on Parallel, Distributed, and Network-Based Processing : PDP 2018 : Cambridge, United Kingdom, 21-23 March 2018 : proceedings

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Piscataway, NJ: IEEE, 2018
Cazzaniga, Paolo [Herausgeber:in]; Besozzi, Daniela [Herausgeber:in]; Merelli, Ivan [Herausgeber:in]; Manzoni, Luca [Herausgeber:in]

Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics : 16th International Meeting, CIBB 2019, Bergamo, Italy, September 4–6, 2019, Revised Selected Papers - [1st ed. 2020.]

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Cham: Springer International Publishing, 2020. ; Cham: Imprint: Springer, 2020.

Erschienen in: Lecture Notes in Bioinformatics ; 12313 - Springer eBook Collection
Beretta, Stefano; Maj, Carlo; Merelli, Ivan

Rank miRNA: a web tool for identifying polymorphisms altering miRNA target sites

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Elsevier BV, 2017

Erschienen in: Procedia Computer Science, 108 (2017), Seite 1125-1134
D’Agostino, Daniele; Pasquale, Giulia; Merelli, Ivan

Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics: A Fine-Grained CUDA Implementation of the Multi-objective Evolutionary Approach NSGA-II: Potential Impact for Computational and Systems Biology Applications

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Springer International Publishing, 2015

Erschienen in: Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics (2015), Seite 273-284
Merelli, Ivan; Liò, Pietro; Milanesi, Luciano

NuChart: An R Package to Study Gene Spatial Neighbourhoods with Multi-Omics Annotations

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Public Library of Science (PLoS), 2013

Erschienen in: PLoS ONE, 8 (2013) 9, Seite e75146
Cozzi, Paolo; Merelli, Ivan; Milanesi, Luciano

Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics: A Visualization ToolKit Based Application for Representing Macromolecular Surfaces

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Springer Berlin Heidelberg, 2009

Erschienen in: Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics (2009), Seite 284-292
Merelli, Ivan; Morra, Giulia; Milanesi, Luciano

Evaluation of a Grid Based Molecular Dynamics Approach for Polypeptide Simulations

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Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2007

Erschienen in: IEEE Transactions on Nanobioscience, 6 (2007) 3, Seite 229-234
D’Agostino, Daniele; Liò, Pietro; Aldinucci, Marco; Merelli, Ivan

Advantages of using graph databases to explore chromatin conformation capture experiments

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Springer Science and Business Media LLC, 2021

Erschienen in: BMC Bioinformatics, 22 (2021) S2
D’Agostino, Daniele; Merelli, Ivan; Aldinucci, Marco; Cesini, Daniele

Hardware and Software Solutions for Energy-Efficient Computing in Scientific Programming

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Hindawi Limited, 2021

Erschienen in: Scientific Programming, 2021 (2021), Seite 1-9
Caudai, Claudia; Zoppè, Monica; Tonazzini, Anna; Merelli, Ivan; Salerno, Emanuele

Integration of Multiple Resolution Data in 3D Chromatin Reconstruction Using ChromStruct

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MDPI AG, 2021

Erschienen in: Biology, 10 (2021) 4, Seite 338
Colonnelli, Iacopo; Cantalupo, Barbara; Merelli, Ivan; Aldinucci, Marco

StreamFlow: Cross-Breeding Cloud With HPC

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Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2021

Erschienen in: IEEE Transactions on Emerging Topics in Computing, 9 (2021) 4, Seite 1723-1737
D’Agostino, Daniele; Liò, Pietro; Aldinucci, Marco; Merelli, Ivan

Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics: NeoHiC: A Web Application for the Analysis of Hi-C Data

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Springer International Publishing, 2020

Erschienen in: Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics (2020), Seite 98-107
Merelli, Ivan; Liò, Pietro; Kotenko, Igor; D'Agostino, Daniele

Latest advances in parallel, distributed, and network‐based processing

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Wiley, 2020

Erschienen in: Concurrency and Computation: Practice and Experience, 32 (2020) 10
Caudai, Claudia; Salerno, Emanuele; Zoppè, Monica; Merelli, Ivan; Tonazzini, Anna

ChromStruct 4: A Python Code to Estimate the Chromatin Structure from Hi-C Data

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Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2019

Erschienen in: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 16 (2019) 6, Seite 1867-1878
Giansanti, Valentina; Castelli, Mauro; Beretta, Stefano; Merelli, Ivan

Lecture Notes in Computer Science: Comparing Deep and Machine Learning Approaches in Bioinformatics: A miRNA-Target Prediction Case Study

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Springer International Publishing, 2019

Erschienen in: Lecture Notes in Computer Science (2019), Seite 31-44
Chiappori, Federica; Merelli, Ivan; Milanesi, Luciano; Colombo, Giorgio; Morra, Giulia

An atomistic view of Hsp70 allosteric crosstalk: from the nucleotide to the substrate binding domain and back

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Springer Science and Business Media LLC, 2016

Erschienen in: Scientific Reports, 6 (2016) 1
Tordini, Fabio; Merelli, Ivan; Liò, Pietro; Milanesi, Luciano; Aldinucci, Marco

Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics: NuchaRt: Embedding High-Level Parallel Computing in R for Augmented Hi-C Data Analysis

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Springer International Publishing, 2016

Erschienen in: Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics (2016), Seite 259-272
Tordini, Fabio; Aldinucci, Marco; Milanesi, Luciano; Liò, Pietro; Merelli, Ivan

The Genome Conformation As an Integrator of Multi-Omic Data: The Example of Damage Spreading in Cancer

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Frontiers Media SA, 2016

Erschienen in: Frontiers in Genetics, 7 (2016)
Shavit, Yoli; Merelli, Ivan; Milanesi, Luciano; Lio’, Pietro

How computer science can help in understanding the 3D genome architecture

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Oxford University Press (OUP), 2016

Erschienen in: Briefings in Bioinformatics, 17 (2016) 5, Seite 733-744

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