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  2. Niarakis, Anna [Verfasser:in]; Ostaszewski, Marek [Verfasser:in]; Mazein, Alexander [Verfasser:in]; Kuperstein, Inna [Verfasser:in]; Kutmon, Martina [Verfasser:in]; Gillespie, Marc E. [Verfasser:in]; Funahashi, Akira [Verfasser:in]; Acencio, Marcio Luis [Verfasser:in]; Hemedan, Ahmed [Verfasser:in]; Aichem, Michael [Verfasser:in]; Klein, Karsten [Verfasser:in]; Czauderna, Tobias [Verfasser:in]; Burtscher, Felicia [Verfasser:in]; Yamada, Takahiro G. [Verfasser:in]; Hiki, Yusuke [Verfasser:in]; Hiroi, Noriko F. [Verfasser:in]; Hu, Finterly [Verfasser:in]; Pham, Nhung [Verfasser:in]; Ehrhart, Friederike [Verfasser:in]; Willighagen, Egon L. [Verfasser:in]; Valdeolivas, Alberto [Verfasser:in]; Dugourd, Aurélien [Verfasser:in]; Messina, Francesco [Verfasser:in]; Esteban-Medina, Marina [Verfasser:in]; [...]

    Drug-target identification in COVID-19 disease mechanisms using computational systems biology approaches

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    13 February 2024

    Erschienen in: Frontiers in immunology ; 14(2023), Artikel-ID 1282859, Seite 1-24

  4. Naldi, Aurélien; Richard, Adrien; Tonello, Elisa

    Linear cuts in Boolean networks

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Natural Computing, 22 (2023) 3, Seite 431-451

  12. Buffard, Marion; Desoeuvres, Aurélien; Naldi, Aurélien; Requilé, Clément; Zinovyev, Andrei; Radulescu, Ovidiu

    Lecture Notes in Computer Science: LNetReduce: Tool for Reducing Linear Dynamic Networks with Separated Timescales

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    Springer International Publishing, 2021

    Erschienen in: Lecture Notes in Computer Science (2021), Seite 238-244

  13. Stoll, Gautier; Caron, Barthélémy; Viara, Eric; Dugourd, Aurélien; Zinovyev, Andrei; Naldi, Aurélien; Kroemer, Guido; Barillot, Emmanuel; Calzone, Laurence

    MaBoSS 2.0: an environment for stochastic Boolean modeling

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    Oxford University Press (OUP), 2017

    Erschienen in: Bioinformatics, 33 (2017) 14, Seite 2226-2228

  16. Buffard, Marion; Naldi, Aurélien; Freiss, Gilles; Deckert, Marcel; Radulescu, Ovidiu; Coopman, Peter J.; Larive, Romain M.

    Comparison of SYK Signaling Networks Reveals the Potential Molecular Determinants of Its Tumor-Promoting and Suppressing Functions

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    MDPI AG, 2021

    Erschienen in: Biomolecules, 11 (2021) 2, Seite 308

  19. Wigger, Leonore; Casals-Casas, Cristina; Baruchet, Michaël; Trang, Khanh B.; Pradervand, Sylvain; Naldi, Aurélien; Desvergne, Béatrice

    System analysis of cross-talk between nuclear receptors reveals an opposite regulation of the cell cycle by LXR and FXR in human HepaRG liver cells

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    Public Library of Science (PLoS), 2019

    Erschienen in: PLOS ONE, 14 (2019) 8, Seite e0220894