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  1. Gerighausen, Daniel [Verfasser:in] ; Scheuermann, Gerik [Akademische:r Betreuer:in]; Prohaska, Sonja [Akademische:r Betreuer:in] Universität Leipzig

    TiBi-3D - a Guide through the World of Epigenetics

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    Leipzig, 2014

  2. Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    A Story of Growing Confusion : Genes and Their Regulation

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    2007

    Erschienen in: Biomat 2007 - International Symposium on Mathematical and Computational Biology

  3. Erber, Lieselotte [Verfasser:in]; Franz, Paul [Verfasser:in]; Betat, Heike [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja [Verfasser:in]; Mörl, Mario [Verfasser:in]

    Divergent Evolution of Eukaryotic CC- and A-Adding Enzymes

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    Basel: MDPI, [2024]

    Erschienen in: International Journal of Molecular Sciences ; 21, (2020)

  4. Höner zu Siederdissen, Christian [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    Algebraic dynamic programming over general data structures

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    London: BioMed Central, 2016

    Erschienen in: BMC bioinformatics ; 16(2015,Suppl.19) S2

  5. Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Fritzsch, Guido [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    Rate variations, phylogenetics, and partial orders

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    2008

    Erschienen in: Proceedings of the 5th International Workshop on Computational Systems Biology, WCSB 2008, June 11-13, 2008 Leipzig, Germany

  6. Lehmann, Jörg [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]

    SynBlast : Assisting the Analysis of Conserved Synteny Information

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    2008

    Erschienen in: BMC Bioinformatics ; 2008

  7. Fried, Claudia [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    Exclusion of repetitive DNA elements from gnathostome Hox clusters

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    2004

    Erschienen in: Journal of experimental zoology ; 302B (2004), 2, Seite 165-173

  8. Fried, Claudia [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    Independent Hox‐cluster duplications in lampreys

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    2003

    Erschienen in: Journal of experimental zoology ; 299B (2003), 1, Seite 18-25

  9. Wobus, Manja [Verfasser:in]; Wandel, Elke [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja [Verfasser:in]; Findeiß, Sven [Verfasser:in]; Tschöp, Katrin [Verfasser:in]; Aust, Gabriela [Verfasser:in]

    Transcriptional regulation of the human CD97 promoter by Sp1/Sp3 in smooth muscle cells

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    2008

    Erschienen in: Gene ; 413 (2008), 1-2, Seite 67-75

  10. Wagner, Günter P. [Verfasser:in]; Fried, Claudia [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    Divergence of Conserved Non-Coding Sequences : Rate Estimate and Relative Rate Tests

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    2004

    Erschienen in: Molecular Biology and Evolution ; 21 (2004), 11, Seite 2116-2121

  11. Fried, Claudia [Verfasser:in]; Hordijk, Wim [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Stadler, Claus R. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    The Footprint Sorting Problem

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    2004

    Erschienen in: Journal of chemical information and computer sciences ; 44 (2004), 2, Seite 332-338

  12. Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Fried, Claudia [Verfasser:in]; Flamm, Christoph [Verfasser:in]; Wagner, Günther P. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    Surveying phylogenetic footprints in large gene clusters : applications to Hox cluster duplications

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    2004

    Erschienen in: Molecular Phylogenetics and Evolution ; 31 (2004), 2, Seite 581-604

  13. Dress, Andreas W. M. [Verfasser:in]; Flamm, Christoph [Verfasser:in]; Fritzsch, Guido [Verfasser:in]; Grünewald, Stefan [Verfasser:in]; Kruspe, Matthias [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]

    Noisy : Identification of problematic columns in multiple sequence alignments

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    2008

    Erschienen in: Algorithms for molecular biology ; 2008

  14. Rose, Dominic [Verfasser:in]; Hackermüller, Jörg [Verfasser:in]; Washietl, Stefan [Verfasser:in]; Reiche, Kristin [Verfasser:in]; Hertel, Jana [Verfasser:in]; Findeiß, Sven [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]

    Computational RNomics of Drosophilids

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    2007

    Erschienen in: BMC Genomics ; 2007

  15. Wagner, Günter P. [Verfasser:in]; Takahashi, Kazuhiko [Verfasser:in]; Lynch, Vincent [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Fried, Claudia [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]; Amemiya, Chris [Verfasser:in]

    Molecular Evolution of Duplicated Ray Finned Fish HoxA Clusters : Increased Synonymous Substitution Rate and Asymmetrical Co-divergence of Coding and Non-coding Sequences

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    2005

    Erschienen in: Journal of Molecular Evolution ; 60 (2005), 5, Seite 665-676

  16. Morgenstern, Burkhard [Verfasser:in]; Werner, Nadine [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Steinkamp, Rasmus [Verfasser:in]; Schneider, Isabelle [Verfasser:in]; Subramanian, Amarendran Ramaswami [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]; Weyer-Menkhoff, Jan [Verfasser:in]

    Multiple sequence alignment with user-defined constraints at GOBICS

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    2005

    Erschienen in: Bioinformatics ; 21 (2005), 7, Seite 1271-1273

  17. Stadler, Peter F. [Verfasser:in]; Fried, Claudia [Verfasser:in]; Prohaska, Sonja J. [Verfasser:in]; Bailey, Wendy J. [Verfasser:in]; Misof, Bernhard Y. [Verfasser:in]; Ruddle, Frank H. [Verfasser:in]; Wagner, Günter P. [Verfasser:in]

    Evidence for independent Hox gene duplications in the hagfish lineage : a PCR-based gene inventory of Eptatretus stoutii

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    2004

    Erschienen in: Molecular Phylogenetics and Evolution ; 32 (2004), 3, Seite 686-694