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  1. Liu, Yanting [VerfasserIn]; Brinkhoff, Thorsten [VerfasserIn]; Berger, Martine [VerfasserIn]; Poehlein, Anja [VerfasserIn]; Voget, Sonja [VerfasserIn]; Paoli, Lucas [VerfasserIn]; Sunagawa, Shinichi [VerfasserIn]; Amann, Rudolf [VerfasserIn]; Simon, Meinhard [VerfasserIn]

    Metagenome-assembled genomes reveal greatly expanded taxonomic and functional diversification of the abundant marine Roseobacter RCA cluster

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    2023

    Erschienen in: Microbiome ; 11(2023), Artikel-ID 265, Seite 1-18

  2. Salazar, Guillem [VerfasserIn]; Paoli, Lucas [VerfasserIn]; Alberti, Adriana [VerfasserIn]; Huerta-Cepas, Jaime [VerfasserIn]; Reuscheweyh, Hans-Joachim [VerfasserIn]; Cuenca Vera, Miguelangel [VerfasserIn]; Field, Christopher M. [VerfasserIn]; Coelho, Luis Pedro [VerfasserIn]; Cruaud, Corinne [VerfasserIn]; Engelen, Stefan [VerfasserIn]; Gregory, Ann C. [VerfasserIn]; Labadie, Karine [VerfasserIn]; Marec, Claudie [VerfasserIn]; Pelletier, Éric [VerfasserIn]; Royo-Llonch, Marta [VerfasserIn]; Roux, Simon [VerfasserIn]; Sánchez, Pablo [VerfasserIn]; Uehara, Hideya [VerfasserIn]; Pésant, Stéphane [VerfasserIn]; Sunagawa, Shinichi [VerfasserIn]

    Gene expression changes and community turnover differentially shape the global ocean metatranscriptome

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    14 November 2019

    Erschienen in: Cell ; 179(2019), 5, Seite 1068-1083.e21

  3. Mende, Daniel Richard [VerfasserIn]; Letunić, Ivica [VerfasserIn]; Huerta-Cepas, Jaime [VerfasserIn]; Li, Simone S. [VerfasserIn]; Forslund, Kristoffer [VerfasserIn]; Sunagawa, Shinichi [VerfasserIn]; Bork, Peer [VerfasserIn]

    proGenomes : a resource for consistent functional and taxonomic annotations of prokaryotic genomes

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    2017

    Erschienen in: Nucleic acids research ; 45(2017), D1, Seite D529-D534

  4. Bayer, Till [VerfasserIn]; Aranda, Manuel [VerfasserIn]; Sunagawa, Shinichi [VerfasserIn]; Yum, Lauren K. [VerfasserIn]; Desalvo, Michael K. [VerfasserIn]; Lindquist, Erika [VerfasserIn]; Coffroth, Mary Alice [VerfasserIn]; Voolstra, Christian [VerfasserIn]; Medina, Mónica [VerfasserIn]

    Symbiodinium transcriptomes: genome insights into the dinoflagellate symbionts of reef-building corals

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    Konstanz: KOPS Universität Konstanz, 2012

  5. Voolstra, Christian [VerfasserIn]; Sunagawa, Shinichi [VerfasserIn]; Matz, Mikhail V. [VerfasserIn]; Bayer, Till [VerfasserIn]; Aranda, Manuel [VerfasserIn]; Buschiazzo, Emmanuel [VerfasserIn]; DeSalvo, Michael K. [VerfasserIn]; Lindquist, Erika [VerfasserIn]; Szmant, Alina M. [VerfasserIn]; Coffroth, Mary Alice [VerfasserIn]

    Rapid Evolution of Coral Proteins Responsible for Interaction with the Environment

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    Konstanz: KOPS Universität Konstanz, 2011

  6. Hildebrand, Falk [VerfasserIn]; Moitinho-Silva, Lucas [VerfasserIn]; Blasche, Sonja [VerfasserIn]; Jahn, Martin T. [VerfasserIn]; Gossmann, Toni Ingolf [VerfasserIn]; Heuerta-Cepas, Jaime [VerfasserIn]; Hercog, Rajna [VerfasserIn]; Luetge, Mechthild [VerfasserIn]; Bahram, Mohammad [VerfasserIn]; Pryszlak, Anna [VerfasserIn]; Alves, Renato J [VerfasserIn]; Waszak, Sebastian M [VerfasserIn]; Zhu, Ana [VerfasserIn]; Ye, Lumeng [VerfasserIn]; Costea, Paul Igor [VerfasserIn]; Aalvink, Steven [VerfasserIn]; Belzer, Clara [VerfasserIn]; Forslund, Sofia K [VerfasserIn]; Sunagawa, Shinichi [VerfasserIn]; Hentschel, Ute [VerfasserIn]; Merten, Christoph [VerfasserIn]; Patil, Kiran Raosaheb [VerfasserIn]; Benes, Vladimir [VerfasserIn]; Bork, Peer [VerfasserIn]

    Antibiotics-induced monodominance of a novel gut bacterial order

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    BMJ, 2019-10

  7. Sunagawa, Shinichi [VerfasserIn]; Mende, Daniel R. [VerfasserIn]; Zeller, Georg [VerfasserIn]; Izquierdo-Carrasco, Fernando [VerfasserIn]; Berger, Simon A. [VerfasserIn]; Kultima, Jens Roat [VerfasserIn]; Coelho, Luis Pedro [VerfasserIn]; Arumugam, Manimozhiyan [VerfasserIn]; Tap, Julien [VerfasserIn]; Nielsen, Henrik Bjørn [VerfasserIn]; Rasmussen, Simon [VerfasserIn]; Brunak, Søren [VerfasserIn]; Pedersen, Oluf [VerfasserIn]; Guarner, Francisco [VerfasserIn]; Vos, Willem M. de [VerfasserIn]; Wang, Jun [VerfasserIn]; Li, Junhua [VerfasserIn]; Doré, Joël [VerfasserIn]; Ehrlich, S. Dusko [VerfasserIn]; Stamatakis, Alexandros [VerfasserIn]; Bork, Peer [VerfasserIn]

    Metagenomic species profiling using universal phylogenetic marker genes

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    Nature Research, 2017-01-11

    Erschienen in: Nature methods, 10 (12), 1196–1199 ; ISSN: 1548-7091, 1548-7105

  8. Dittami, Simon M. [VerfasserIn]; Arboleda, Enrique [VerfasserIn]; Auguet, Jean-Christophe [VerfasserIn]; Bigalke, Arite [VerfasserIn]; Briand, Enora [VerfasserIn]; Cárdenas, Paco [VerfasserIn]; Cardini, Ulisse [VerfasserIn]; Decelle, Johan [VerfasserIn]; Engelen, Aschwin H. [VerfasserIn]; Eveillard, Damien [VerfasserIn]; Gachon, Claire M.M. [VerfasserIn]; Griffiths, Sarah M. [VerfasserIn]; Harder, Tilmann [VerfasserIn]; Kayal, Ehsan [VerfasserIn]; Kazamia, Elena [VerfasserIn]; Lallier, François H. [VerfasserIn]; Medina, Mónica [VerfasserIn]; Marzinelli, Ezequiel M. [VerfasserIn]; Morganti, Teresa Maria [VerfasserIn]; Núñez Pons, Laura [VerfasserIn]; Prado, Soizic [VerfasserIn]; Pintado, José [VerfasserIn]; Saha, Mahasweta [VerfasserIn]; Selosse, Marc-André [VerfasserIn]; [...]

    A community perspective on the concept of marine holobionts: current status, challenges, and future directions

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    PeerJ, 2021-02-25

  18. Costea, Paul I; Zeller, Georg; Sunagawa, Shinichi; Bork, Peer

    A fair comparison

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    Springer Science and Business Media LLC, 2014

    Erschienen in: Nature Methods