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  1. Müller-Dott, Sophia [Verfasser:in]; Tsirvouli, Eirini [Verfasser:in]; Vazquez, Miguel [Verfasser:in]; Ramirez Flores, Ricardo O. [Verfasser:in]; Badia-i-Mompel, Pau [Verfasser:in]; Fallegger, Robin [Verfasser:in]; Türei, Dénes [Verfasser:in]; Lægreid, Astrid [Verfasser:in]; Sáez Rodríguez, Julio [Verfasser:in]

    Expanding the coverage of regulons from high-confidence prior knowledge for accurate estimation of transcription factor activities

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    10 November 2023

    Erschienen in: Nucleic acids research ; 51(2023), 20, Seite 10934-10949

  2. Niarakis, Anna [Verfasser:in]; Ostaszewski, Marek [Verfasser:in]; Mazein, Alexander [Verfasser:in]; Kuperstein, Inna [Verfasser:in]; Kutmon, Martina [Verfasser:in]; Gillespie, Marc E. [Verfasser:in]; Funahashi, Akira [Verfasser:in]; Acencio, Marcio Luis [Verfasser:in]; Hemedan, Ahmed [Verfasser:in]; Aichem, Michael [Verfasser:in]; Klein, Karsten [Verfasser:in]; Czauderna, Tobias [Verfasser:in]; Burtscher, Felicia [Verfasser:in]; Yamada, Takahiro G. [Verfasser:in]; Hiki, Yusuke [Verfasser:in]; Hiroi, Noriko F. [Verfasser:in]; Hu, Finterly [Verfasser:in]; Pham, Nhung [Verfasser:in]; Ehrhart, Friederike [Verfasser:in]; Willighagen, Egon L. [Verfasser:in]; Valdeolivas, Alberto [Verfasser:in]; Dugourd, Aurélien [Verfasser:in]; Messina, Francesco [Verfasser:in]; Esteban-Medina, Marina [Verfasser:in]; [...]

    Drug-target identification in COVID-19 disease mechanisms using computational systems biology approaches

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    13 February 2024

    Erschienen in: Frontiers in immunology ; 14(2024), Artikel-ID 1282859, Seite 1-24

  6. Tsirvouli, Eirini; Touré, Vasundra; Niederdorfer, Barbara; Vázquez, Miguel; Flobak, Åsmund; Kuiper, Martin

    A Middle-Out Modeling Strategy to Extend a Colon Cancer Logical Model Improves Drug Synergy Predictions in Epithelial-Derived Cancer Cell Lines

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    Frontiers Media SA, 2020

    Erschienen in: Frontiers in Molecular Biosciences, 7 (2020)

  8. Müller-Dott, Sophia; Tsirvouli, Eirini; Vazquez, Miguel; Ramirez Flores, Ricardo O; Badia-i-Mompel, Pau; Fallegger, Robin; Türei, Dénes; Lægreid, Astrid; Saez-Rodriguez, Julio

    Expanding the coverage of regulons from high-confidence prior knowledge for accurate estimation of transcription factor activities

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    Oxford University Press (OUP), 2023

    Erschienen in: Nucleic Acids Research, 51 (2023) 20, Seite 10934-10949

  9. Nymark, Marianne; Grønbech Hafskjold, Marthe Caroline; Volpe, Charlotte; Fonseca, Davi de Miranda; Sharma, Animesh; Tsirvouli, Eirini; Serif, Manuel; Winge, Per; Finazzi, Giovanni; Bones, Atle Magnar

    Functional studies of CpSRP54 in diatoms show that the mechanism of thylakoid protein insertion differs from that in plants and green algae

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    Wiley, 2021

    Erschienen in: The Plant Journal, 106 (2021) 1, Seite 113-132

  10. Chatzidaki, Maria D.; Papadimitriou, Konstantinos; Alexandraki, Voula; Tsirvouli, Eirini; Chakim, Zena; Ghazal, Aghiad; Mortensen, Kell; Yaghmur, Anan; Salentinig, Stefan; Papadimitriou, Vassiliki; Tsakalidou, Effie; Xenakis, Aristotelis

    Microemulsions as Potential Carriers of Nisin: Effect of Composition on Structure and Efficacy

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    American Chemical Society (ACS), 2016

    Erschienen in: Langmuir, 32 (2016) 35, Seite 8988-8998

  11. Niarakis, Anna; Ostaszewski, Marek; Mazein, Alexander; Kuperstein, Inna; Kutmon, Martina; Gillespie, Marc E.; Funahashi, Akira; Acencio, Marcio Luis; Hemedan, Ahmed; Aichem, Michael; Klein, Karsten; Czauderna, Tobias; Burtscher, Felicia; Yamada, Takahiro G.; Hiki, Yusuke; Hiroi, Noriko F.; Hu, Finterly; Pham, Nhung; Ehrhart, Friederike; Willighagen, Egon L.; Valdeolivas, Alberto; Dugourd, Aurelien; Messina, Francesco; Esteban-Medina, Marina; [...]

    Drug-target identification in COVID-19 disease mechanisms using computational systems biology approaches

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    Frontiers Media SA, 2024

    Erschienen in: Frontiers in Immunology, 14 (2024)