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  1. Wendorff, Mareike [Verfasser:in] ; Franke, Andre [Akademische:r Betreuer:in] Christian-Albrechts-Universität zu Kiel

    Bioinformatic analysis of the human leucocyte antigen in inflammatory bowel disease

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    Kiel: Universitätsbibliothek Kiel, November 2022

  2. El Abd, Hesham [Verfasser:in]; Degenhardt, Frauke [Verfasser:in]; Koudelka, Tomas [Verfasser:in]; Kamps, Ann-Kristin [Verfasser:in]; Tholey, Andreas [Verfasser:in]; Bacher, Petra [Verfasser:in]; Lenz, Tobias L. [Verfasser:in]; Franke, Andre [Verfasser:in]; Wendorff, Mareike [Verfasser:in]

    Immunopeptidomics toolkit library (IPTK) : a python-based modular toolbox for analyzing immunopeptidomics data

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    London: BioMed Central, 2021

    Erschienen in: BMC Bioinformatics ; 22, 1 (2021), 405

  3. Wendorff, Mareike [Verfasser:in]; Garcia Alvarez, Heli M. [Verfasser:in]; Østerbye, Thomas [Verfasser:in]; ElAbd, Hesham [Verfasser:in]; Rosati, Elisa [Verfasser:in]; Degenhardt, Frauke [Verfasser:in]; Buus, Søren [Verfasser:in]; Franke, Andre [Verfasser:in]; Nielsen, Morten [Verfasser:in]

    Unbiased Characterization of Peptide-HLA Class II Interactions Based on Large-Scale Peptide Microarrays; Assessment of the Impact on HLA Class II Ligand and Epitope Prediction

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    Lausanne: Frontiers, 05 August 2020

    Erschienen in: Frontiers in Immunology ; 11 (2020), 1705

  4. Wendorff, Mareike [Verfasser:in] ; Franke, Andre [Akademische:r Betreuer:in]; Dagan, Tal [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]

    Bioinformatic analysis of the Human Leucocyte Antigen in Inflammatory BowelDisease

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    Kiel: Universitätsbibliothek Kiel, 2022

  5. Strippel, Christine [Verfasser:in]; Herrera-Rivero, Marisol [Verfasser:in]; Wendorff, Mareike [Verfasser:in]; Tietz, Anja K. [Verfasser:in]; Degenhardt, Frauke [Verfasser:in]; Witten, Anika [Verfasser:in]; Menskes, Christina Barbara [Verfasser:in]; Nelke, Christopher [Verfasser:in]; Golombeck, Kristin S. [Verfasser:in]; Madlener, Marie Elisabeth [Verfasser:in]; Rüber, Theodor [Verfasser:in]; Ernst, Leon [Verfasser:in]; Racz, Attila [Verfasser:in]; Baumgartner, Tobias [Verfasser:in]; Widman, Guido [Verfasser:in]; Doppler, Kathrin Janina [Verfasser:in]; Thaler, Franziska [Verfasser:in]; Siebenbrodt, Kai [Verfasser:in]; Dik, André [Verfasser:in]; Kerin, Constanze [Verfasser:in]; Räuber, Saskia Janina [Verfasser:in]; Gallus, Marco [Verfasser:in]; Kovać, Stjepana [Verfasser:in]; Grauer, Oliver Martin [Verfasser:in]; [...]

    A genome-wide association study in autoimmune neurological syndromes with anti-GAD65 autoantibodies

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    2023

    Erschienen in: Brain ; 146(2023), 3, Seite 977-990

  6. ElAbd, Hesham; Degenhardt, Frauke; Koudelka, Tomas; Kamps, Ann-Kristin; Tholey, Andreas; Bacher, Petra; Lenz, Tobias L.; Franke, Andre; Wendorff, Mareike

    Immunopeptidomics toolkit library (IPTK): a python-based modular toolbox for analyzing immunopeptidomics data

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    Springer Science and Business Media LLC, 2021

    Erschienen in: BMC Bioinformatics, 22 (2021) 1

  7. Wendorff, Mareike; Garcia Alvarez, Heli M.; Østerbye, Thomas; ElAbd, Hesham; Rosati, Elisa; Degenhardt, Frauke; Buus, Søren; Franke, Andre; Nielsen, Morten

    Unbiased Characterization of Peptide-HLA Class II Interactions Based on Large-Scale Peptide Microarrays; Assessment of the Impact on HLA Class II Ligand and Epitope Prediction

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    Frontiers Media SA, 2020

    Erschienen in: Frontiers in Immunology, 11 (2020)

  8. Bejaoui, Yosra; Witte, Mareike; Abdelhady, Mohamed; Eldarouti, Mohammad; Abdallah, Nermeen M. A.; Elghzaly, Ashraf Antar; Tawhid, Ziyad; Gaballah, Mohammad Ali; Busch, Hauke; Munz, Matthias; Wendorff, Mareike; Ellinghaus, Eva; Franke, Andre; Ibrahim, Saleh M.

    Genome‐wide association study of psoriasis in an Egyptian population

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    Wiley, 2019

    Erschienen in: Experimental Dermatology, 28 (2019) 5, Seite 623-627

  9. Kratz, Christian P; Smirnov, Dmitrii; Autry, Robert; Jäger, Natalie; Waszak, Sebastian M; Großhennig, Anika; Berutti, Riccardo; Wendorff, Mareike; Hainaut, Pierre; Pfister, Stefan M; Prokisch, Holger; Ripperger, Tim; Malkin, David

    Reply to Evans and Woodward

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    Oxford University Press (OUP), 2023

    Erschienen in: JNCI: Journal of the National Cancer Institute, 115 (2023) 2, Seite 231-232

  10. Kratz, Christian P; Smirnov, Dmitrii; Autry, Robert; Jäger, Natalie; Waszak, Sebastian M; Großhennig, Anika; Berutti, Riccardo; Wendorff, Mareike; Hainaut, Pierre; Pfister, Stefan M; Prokisch, Holger; Ripperger, Tim; Malkin, David

    Reply to Li and Colleagues

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    Oxford University Press (OUP), 2023

    Erschienen in: JNCI: Journal of the National Cancer Institute, 115 (2023) 6, Seite 760-761

  11. Kratz, Christian P; Smirnov, Dmitrii; Autry, Robert; Jäger, Natalie; Waszak, Sebastian M; Großhennig, Anika; Berutti, Riccardo; Wendorff, Mareike; Hainaut, Pierre; Pfister, Stefan M; Prokisch, Holger; Ripperger, Tim; Malkin, David

    Heterozygous BRCA1 and BRCA2 and Mismatch Repair Gene Pathogenic Variants in Children and Adolescents With Cancer

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    Oxford University Press (OUP), 2022

    Erschienen in: JNCI: Journal of the National Cancer Institute, 114 (2022) 11, Seite 1523-1532

  12. Hammer, Quirin; Dunst, Josefine; Christ, Wanda; Picarazzi, Francesca; Wendorff, Mareike; Momayyezi, Pouria; Huhn, Oisín; Netskar, Herman K.; Maleki, Kimia T.; García, Marina; Sekine, Takuya; Sohlberg, Ebba; Azzimato, Valerio; Aouadi, Myriam; Degenhardt, Frauke; Franke, Andre; Spallotta, Francesco; Mori, Mattia; Michaëlsson, Jakob; Björkström, Niklas K.; Rückert, Timo; Romagnani, Chiara; Horowitz, Amir; Klingström, Jonas; [...]

    SARS-CoV-2 Nsp13 encodes for an HLA-E-stabilizing peptide that abrogates inhibition of NKG2A-expressing NK cells

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    Elsevier BV, 2022

    Erschienen in: Cell Reports, 38 (2022) 10, Seite 110503

  13. Rosati, Elisa; Rios Martini, Gabriela; Pogorelyy, Mikhail V; Minervina, Anastasia A; Degenhardt, Frauke; Wendorff, Mareike; Sari, Soner; Mayr, Gabriele; Fazio, Antonella; Dowds, Christel Marie; Hauser, Charlotte; Tran, Florian; von Schönfels, Witigo; Pochhammer, Julius; Salnikova, Maria A; Jaeckel, Charlot; Gigla, Johannes Boy; Sabet, Sanaz Sedghpour; Hübenthal, Matthias; Schiminsky, Esther; Schreiber, Stefan; Rosenstiel, Philip C; Scheffold, Alexander; Thomas, Paul G; [...]

    A novel unconventional T cell population enriched in Crohn’s disease

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    BMJ, 2022

    Erschienen in: Gut, 71 (2022) 11, Seite 2194-2204

  14. Degenhardt, Frauke; Wendorff, Mareike; Wittig, Michael; Ellinghaus, Eva; Datta, Lisa W; Schembri, John; Ng, Siew C; Rosati, Elisa; Hübenthal, Matthias; Ellinghaus, David; Jung, Eun Suk; Lieb, Wolfgang; Abedian, Shifteh; Malekzadeh, Reza; Cheon, Jae Hee; Ellul, Pierre; Sood, Ajit; Midha, Vandana; Thelma, B K; Wong, Sunny H; Schreiber, Stefan; Yamazaki, Keiko; Kubo, Michiaki; Boucher, Gabrielle; [...]

    Construction and benchmarking of a multi-ethnic reference panel for the imputation of HLA class I and II alleles

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    Oxford University Press (OUP), 2019

    Erschienen in: Human Molecular Genetics, 28 (2019) 12, Seite 2078-2092

  15. Degenhardt, Frauke; Mayr, Gabriele; Wendorff, Mareike; Boucher, Gabrielle; Ellinghaus, Eva; Ellinghaus, David; ElAbd, Hesham; Rosati, Elisa; Hübenthal, Matthias; Juzenas, Simonas; Abedian, Shifteh; Vahedi, Homayon; Thelma, B K; Yang, Suk-Kyun; Ye, Byong Duk; Cheon, Jae Hee; Datta, Lisa Wu; Daryani, Naser Ebrahim; Ellul, Pierre; Esaki, Motohiro; Fuyuno, Yuta; McGovern, Dermot P B; Haritunians, Talin; Hong, Myhunghee; [...]

    Transethnic analysis of the human leukocyte antigen region for ulcerative colitis reveals not only shared but also ethnicity-specific disease associations

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    Oxford University Press (OUP), 2021

    Erschienen in: Human Molecular Genetics, 30 (2021) 5, Seite 356-369

  16. Strippel, Christine; Herrera-Rivero, Marisol; Wendorff, Mareike; Tietz, Anja K; Degenhardt, Frauke; Witten, Anika; Schroeter, Christina; Nelke, Christopher; Golombeck, Kristin S; Madlener, Marie; Rüber, Theodor; Ernst, Leon; Racz, Attila; Baumgartner, Tobias; Widman, Guido; Doppler, Kathrin; Thaler, Franziska; Siebenbrodt, Kai; Dik, Andre; Kerin, Constanze; Räuber, Saskia; Gallus, Marco; Kovac, Stjepana; Grauer, Oliver M; [...]

    A genome-wide association study in autoimmune neurological syndromes with anti-GAD65 autoantibodies

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    Oxford University Press (OUP), 2023

    Erschienen in: Brain, 146 (2023) 3, Seite 977-990

  17. Degenhardt, Frauke; Ellinghaus, David; Juzenas, Simonas; Lerga-Jaso, Jon; Wendorff, Mareike; Maya-Miles, Douglas; Uellendahl-Werth, Florian; ElAbd, Hesham; Rühlemann, Malte C; Arora, Jatin; Özer, Onur; Lenning, Ole Bernt; Myhre, Ronny; Vadla, May Sissel; Wacker, Eike M; Wienbrandt, Lars; Blandino Ortiz, Aaron; de Salazar, Adolfo; Garrido Chercoles, Adolfo; Palom, Adriana; Ruiz, Agustín; Garcia-Fernandez, Alba-Estela; Blanco-Grau, Albert; Mantovani, Alberto; [...]

    Detailed stratified GWAS analysis for severe COVID-19 in four European populations

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    Oxford University Press (OUP), 2022

    Erschienen in: Human Molecular Genetics, 31 (2022) 23, Seite 3945-3966

  18. Kanai, Masahiro; Andrews, Shea J.; Cordioli, Mattia; Stevens, Christine; Neale, Benjamin M.; Daly, Mark; Ganna, Andrea; Pathak, Gita A.; Iwasaki, Akiko; Karjalainen, Juha; Mehtonen, Juha; Pirinen, Matti; Chwialkowska, Karolina; Trankiem, Amy; Balaconis, Mary K.; Veerapen, Kumar; Wolford, Brooke N.; Ahmad, Hajar Fauzan; Andrews, Shea; von Hohenstaufen Puoti, Kathrin Aprile; Boer, Cindy; Boua, Palwende R.; Butler-Laporte, Guillaume; Cadilla, Carmen L.; [...]

    A second update on mapping the human genetic architecture of COVID-19

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Nature, 621 (2023) 7977, Seite E7-E26

  19. Niemi, Mari E. K.; Karjalainen, Juha; Liao, Rachel G.; Neale, Benjamin M.; Daly, Mark; Ganna, Andrea; Pathak, Gita A.; Andrews, Shea J.; Kanai, Masahiro; Veerapen, Kumar; Fernandez-Cadenas, Israel; Schulte, Eva C.; Striano, Pasquale; Marttila, Minttu; Minica, Camelia; Marouli, Eirini; Karim, Mohd Anisul; Wendt, Frank R.; Savage, Jeanne; Sloofman, Laura; Butler-Laporte, Guillaume; Kim, Han-Na; Kanoni, Stavroula; Okada, Yukinori; [...]

    Mapping the human genetic architecture of COVID-19

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    Springer Science and Business Media LLC, 2021

    Erschienen in: Nature, 600 (2021) 7889, Seite 472-477