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  1. Yirik, Mehmet Aziz [Verfasser:in] ; Steinbeck, Christoph [Akademische:r Betreuer:in]; Willighagen, Egon [Akademische:r Betreuer:in] Friedrich-Schiller-Universität Jena

    Development of efficient open-source chemical graph generators

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    Jena, [2023?]

  2. Rajan, Kohulan [Verfasser:in] ; Steinbeck, Christoph [Akademische:r Betreuer:in]; Zielesny, Achim [Akademische:r Betreuer:in]; Willighagen, Egon [Akademische:r Betreuer:in] Friedrich-Schiller-Universität Jena

    DARLING : Deep leARning for chemicaL Information processinG

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    Jena, [2021?]

  3. Winckers, Laurent A. [Verfasser:in]; Willighagen, Egon L. [Verfasser:in]

    Expanding the eNanoMapper Ontology (short paper)

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    2020

    Erschienen in: International Conference on Biomedical Ontologies (11. : 2020 : Online): ICBO/ODLS 2020 International Conference on Biomedical Ontologies ; (2020), Seite Z.1-2

  4. Ostaszewski, Marek [Verfasser:in]; Mazein, Alexander [Verfasser:in]; Gillespie, Marc E. [Verfasser:in]; Kuperstein, Inna [Verfasser:in]; Niarakis, Anna [Verfasser:in]; Hermjakob, Henning [Verfasser:in]; Pico, Alexander R. [Verfasser:in]; Willighagen, Egon L. [Verfasser:in]; Evelo, Chris T. [Verfasser:in]; Schreiber, Falk [Verfasser:in]

    COVID-19 Disease Map, building a computational repository of SARS-CoV-2 virus-host interaction mechanisms

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    Konstanz: KOPS Universität Konstanz, 2020

  5. Ostaszewski, Marek [Verfasser:in]; Mazein, Alexander [Verfasser:in]; Gillespie, Marc E. [Verfasser:in]; Kuperstein, Inna [Verfasser:in]; Niarakis, Anna [Verfasser:in]; Hermjakob, Henning [Verfasser:in]; Pico, Alexander R. [Verfasser:in]; Willighagen, Egon L. [Verfasser:in]; Evelo, Chris T. [Verfasser:in]; Schreiber, Falk [Verfasser:in]

    COVID-19 Disease Map, building a computational repository of SARS-CoV-2 virus-host interaction mechanisms

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    KOPS - The Institutional Repository of the University of Konstanz, 2020

    Erschienen in: Scientific data. Springer Nature. 2020, 7(1), 136. eISSN 2052-4463. Available under: doi:10.1038/s41597-020-0477-8

  6. Niarakis, Anna [Verfasser:in]; Ostaszewski, Marek [Verfasser:in]; Mazein, Alexander [Verfasser:in]; Kuperstein, Inna [Verfasser:in]; Kutmon, Martina [Verfasser:in]; Gillespie, Marc E. [Verfasser:in]; Funahashi, Akira [Verfasser:in]; Acencio, Marcio Luis [Verfasser:in]; Hemedan, Ahmed [Verfasser:in]; Aichem, Michael [Verfasser:in]; Klein, Karsten [Verfasser:in]; Czauderna, Tobias [Verfasser:in]; Burtscher, Felicia [Verfasser:in]; Yamada, Takahiro G. [Verfasser:in]; Hiki, Yusuke [Verfasser:in]; Hiroi, Noriko F. [Verfasser:in]; Hu, Finterly [Verfasser:in]; Pham, Nhung [Verfasser:in]; Ehrhart, Friederike [Verfasser:in]; Willighagen, Egon L. [Verfasser:in]; Valdeolivas, Alberto [Verfasser:in]; Dugourd, Aurélien [Verfasser:in]; Messina, Francesco [Verfasser:in]; Esteban-Medina, Marina [Verfasser:in]; [...]

    Drug-target identification in COVID-19 disease mechanisms using computational systems biology approaches

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    13 February 2024

    Erschienen in: Frontiers in immunology ; 14(2024), Artikel-ID 1282859, Seite 1-24

  15. Miller, Ryan A.; Kutmon, Martina; Bohler, Anwesha; Waagmeester, Andra; Evelo, Chris T.; Willighagen, Egon L.

    Understanding signaling and metabolic paths using semantified and harmonized information about biological interactions

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    Public Library of Science (PLoS), 2022

    Erschienen in: PLOS ONE, 17 (2022) 4, Seite e0263057