DrosophilaMuller F Elements Maintain a Distinct Set of Genomic Properties Over 40 Million Years of E… - SLUB Dresden

Media type: E-Article

Title: DrosophilaMuller F Elements Maintain a Distinct Set of Genomic Properties Over 40 Million Years of Evolution

Contributor: Leung, Wilson ; Shaffer, Christopher D ; Reed, Laura K ; Smith, Sheryl T ; Barshop, William ; Dirkes, William ; Dothager, Matthew ; Lee, Paul ; Wong, Jeannette ; Xiong, David ; Yuan, Han ; Bedard, James E J ; Machone, Joshua F ; Patterson, Seantay D ; Price, Amber L ; Turner, Bryce A ; Robic, Srebrenka ; Luippold, Erin K ; McCartha, Shannon R ; Walji, Tezin A ; Walker, Chelsea A ; Saville, Kenneth ; Abrams, Marita K ; Armstrong, Andrew R ; Armstrong, William ; Bailey, Robert J ; Barberi, Chelsea R ; Beck, Lauren R ; Blaker, Amanda L ; Blunden, Christopher E ; Brand, Jordan P ; Brock, Ethan J ; Brooks, Dana W ; Brown, Marie ; Butzler, Sarah C ; Clark, Eric M ; Clark, Nicole B ; Collins, Ashley A ; Cotteleer, Rebecca J ; Cullimore, Peterson R ; Dawson, Seth G ; Docking, Carter T ; Dorsett, Sasha L ; Dougherty, Grace A ; Downey, Kaitlyn A ; Drake, Andrew P ; Earl, Erica K ; Floyd, Trevor G ; Forsyth, Joshua D ; Foust, Jonathan D ; Franchi, Spencer L ; Geary, James F ; Hanson, Cynthia K ; Harding, Taylor S ; Harris, Cameron B ; Heckman, Jonathan M ; Holderness, Heather L ; Howey, Nicole A ; Jacobs, Dontae A ; Jewell, Elizabeth S ; Kaisler, Maria ; Karaska, Elizabeth A ; Kehoe, James L ; Koaches, Hannah C ; Koehler, Jessica ; Koenig, Dana ; Kujawski, Alexander J ; Kus, Jordan E ; Lammers, Jennifer A ; Leads, Rachel R ; Leatherman, Emily C ; Lippert, Rachel N ; Messenger, Gregory S ; Morrow, Adam T ; Newcomb, Victoria ; Plasman, Haley J ; Potocny, Stephanie J ; Powers, Michelle K ; Reem, Rachel M ; Rennhack, Jonathan P ; Reynolds, Katherine R ; Reynolds, Lyndsey A ; Rhee, Dong K ; Rivard, Allyson B ; Ronk, Adam J ; Rooney, Meghan B ; Rubin, Lainey S ; Salbert, Luke R ; Saluja, Rasleen K ; Schauder, Taylor ; Schneiter, Allison R ; Schulz, Robert W ; Smith, Karl E ; Spencer, Sarah ; Swanson, Bryant R ; Tache, Melissa A ; Tewilliager, Ashley A ; Tilot, Amanda K ; VanEck, Eve ; Villerot, Matthew M ; Vylonis, Megan B ; Watson, David T ; Wurzler, Juliana A ; Wysocki, Lauren M ; Yalamanchili, Monica ; Zaborowicz, Matthew A ; Emerson, Julia A ; Ortiz, Carlos ; Deuschle, Frederic J ; DiLorenzo, Lauren A ; Goeller, Katie L ; Macchi, Christopher R ; Muller, Sarah E ; Pasierb, Brittany D ; Sable, Joseph E ; Tucci, Jessica M ; Tynon, Marykathryn ; Dunbar, David A ; Beken, Levent H ; Conturso, Alaina C ; Danner, Benjamin L ; DeMichele, Gabriella A ; Gonzales, Justin A ; Hammond, Maureen S ; Kelley, Colleen V ; Kelly, Elisabeth A ; Kulich, Danielle ; Mageeney, Catherine M ; McCabe, Nikie L ; Newman, Alyssa M ; Spaeder, Lindsay A ; Tumminello, Richard A ; Revie, Dennis ; Benson, Jonathon M ; Cristostomo, Michael C ; DaSilva, Paolo A ; Harker, Katherine S ; Jarrell, Jenifer N ; Jimenez, Luis A ; Katz, Brandon M ; Kennedy, William R ; Kolibas, Kimberly S ; LeBlanc, Mark T ; Nguyen, Trung T ; Nicolas, Daniel S ; Patao, Melissa D ; Patao, Shane M ; Rupley, Bryan J ; Sessions, Bridget J ; Weaver, Jennifer A ; Goodman, Anya L ; Alvendia, Erica L ; Baldassari, Shana M ; Brown, Ashley S ; Chase, Ian O ; Chen, Maida ; Chiang, Scott ; Cromwell, Avery B ; Custer, Ashley F ; DiTommaso, Tia M ; El-Adaimi, Jad ; Goscinski, Nora C ; Grove, Ryan A ; Gutierrez, Nestor ; Harnoto, Raechel S ; Hedeen, Heather ; Hong, Emily L ; Hopkins, Barbara L ; Huerta, Vilma F ; Khoshabian, Colin ; LaForge, Kristin M ; Lee, Cassidy T ; Lewis, Benjamin M ; Lydon, Anniken M ; Maniaci, Brian J ; Mitchell, Ryan D ; Morlock, Elaine V ; Morris, William M ; Naik, Priyanka ; Olson, Nicole C ; Osterloh, Jeannette M ; Perez, Marcos A ; Presley, Jonathan D ; Randazzo, Matt J ; Regan, Melanie K ; Rossi, Franca G ; Smith, Melanie A ; Soliterman, Eugenia A ; Sparks, Ciani J ; Tran, Danny L ; Wan, Tiffany ; Welker, Anne A ; Wong, Jeremy N ; Sreenivasan, Aparna ; Youngblom, Jim ; Adams, Andrew ; Alldredge, Justin ; Bryant, Ashley ; Carranza, David ; Cifelli, Alyssa ; Coulson, Kevin ; Debow, Calise ; Delacruz, Noelle ; Emerson, Charlene ; Farrar, Cassandra ; Foret, Don ; Garibay, Edgar ; Gooch, John ; Heslop, Michelle ; Kaur, Sukhjit ; Khan, Ambreen ; Kim, Van ; Lamb, Travis ; Lindbeck, Peter ; Lucas, Gabi ; Macias, Elizabeth ; Martiniuc, Daniela ; Mayorga, Lissett ; Medina, Joseph ; Membreno, Nelson ; Messiah, Shady ; Neufeld, Lacey ; Nguyen, San Francisco ; Nichols, Zachary ; Odisho, George ; Peterson, Daymon ; Rodela, Laura ; Rodriguez, Priscilla ; Rodriguez, Vanessa ; Ruiz, Jorge ; Sherrill, Will ; Silva, Valeria ; Sparks, Jeri ; Statton, Geeta ; Townsend, Ashley ; Valdez, Isabel ; Waters, Mary ; Westphal, Kyle ; Winkler, Stacey ; Zumkehr, Joannee ; DeJong, Randall J ; Hoogewerf, Arlene J ; Ackerman, Cheri M ; Armistead, Isaac O ; Baatenburg, Lara ; Borr, Matthew J ; Brouwer, Lindsay K ; Burkhart, Brandon J ; Bushhouse, Kelsey T ; Cesko, Lejla ; Choi, Tiffany Y Y ; Cohen, Heather ; Damsteegt, Amanda M ; Darusz, Jess M ; Dauphin, Cory M ; Davis, Yelena P ; Diekema, Emily J ; Drewry, Melissa ; Eisen, Michelle E M ; Faber, Hayley M ; Faber, Katherine J ; Feenstra, Elizabeth ; Felzer-Kim, Isabella T ; Hammond, Brandy L ; Hendriksma, Jesse ; Herrold, Milton R ; Hilbrands, Julia A ; Howell, Emily J ; Jelgerhuis, Sarah A ; Jelsema, Timothy R ; Johnson, Benjamin K ; Jones, Kelly K ; Kim, Anna ; Kooienga, Ross D ; Menyes, Erika E ; Nollet, Eric A ; Plescher, Brittany E ; Rios, Lindsay ; Rose, Jenny L ; Schepers, Allison J ; Scott, Geoff ; Smith, Joshua R ; Sterling, Allison M ; Tenney, Jenna C ; Uitvlugt, Chris ; VanDyken, Rachel E ; VanderVennen, Marielle ; Vue, Samantha ; Kokan, Nighat P ; Agbley, Kwabea ; Boham, Sampson K ; Broomfield, Daniel ; Chapman, Kayla ; Dobbe, Ali ; Dobbe, Ian ; Harrington, William ; Ibrahem, Marwan ; Kennedy, Andre ; Koplinsky, Chad A ; Kubricky, Cassandra ; Ladzekpo, Danielle ; Pattison, Claire ; Ramirez, Roman E ; Wande, Lucia ; Woehlke, Sarah ; Wawersik, Matthew ; Kiernan, Elizabeth ; Thompson, Jeffrey S ; Banker, Roxanne ; Bartling, Justina R ; Bhatiya, Chinmoy I ; Boudoures, Anna L ; Christiansen, Lena ; Fosselman, Daniel S ; French, Kristin M ; Gill, Ishwar S ; Havill, Jessen T ; Johnson, Jaelyn L ; Keny, Lauren J ; Kerber, John M ; Klett, Bethany M ; Kufel, Christina N ; May, Francis J ; Mecoli, Jonathan P ; Merry, Callie R ; Meyer, Lauren R ; Miller, Emily G ; Mullen, Gregory J ; Palozola, Katherine C ; Pfeil, Jacob J ; Thomas, Jessica G ; Verbofsky, Evan M ; Spana, Eric P ; Agarwalla, Anant ; Chapman, Julia ; Chlebina, Ben ; Chong, Insun ; Falk, I N ; Fitzgibbons, John D ; Friedman, Harrison ; Ighile, Osagie ; Kim, Andrew J ; Knouse, Kristin A ; Kung, Faith ; Mammo, Danny ; Ng, Chun Leung ; Nikam, Vinayak S ; Norton, Diana ; Pham, Philip ; Polk, Jessica W ; Prasad, Shreya ; Rankin, Helen ; Ratliff, Camille D ; Scala, Victoria ; Schwartz, Nicholas U ; Shuen, Jessica A ; Xu, Amy ; Xu, Thomas Q ; Zhang, Yi ; Rosenwald, Anne G ; Burg, Martin G ; Adams, Stephanie J ; Baker, Morgan ; Botsford, Bobbi ; Brinkley, Briana ; Brown, Carter ; Emiah, Shadie ; Enoch, Erica ; Gier, Chad ; Greenwell, Alyson ; Hoogenboom, Lindsay ; Matthews, Jordan E ; McDonald, Mitchell ; Mercer, Amanda ; Monsma, Nicholaus ; Ostby, Kristine ; Ramic, Alen ; Shallman, Devon ; Simon, Matthew ; Spencer, Eric ; Tomkins, Trisha ; Wendland, Pete ; Wylie, Anna ; Wolyniak, Michael J ; Robertson, Gregory M ; Smith, Samuel I ; DiAngelo, Justin R ; Sassu, Eric D ; Bhalla, Satish C ; Sharif, Karim A ; Choeying, Tenzin ; Macias, Jason S ; Sanusi, Fareed ; Torchon, Karvyn ; Bednarski, April E ; Alvarez, Consuelo J ; Davis, Kristen C ; Dunham, Carrie A ; Grantham, Alaina J ; Hare, Amber N ; Schottler, Jennifer ; Scott, Zackary W ; Kuleck, Gary A ; Yu, Nicole S ; Kaehler, Marian M ; Jipp, Jacob ; Overvoorde, Paul J ; Shoop, Elizabeth ; Cyrankowski, Olivia ; Hoover, Betsy ; Kusner, Matt ; Lin, Devry ; Martinov, Tijana ; Misch, Jonathan ; Salzman, Garrett ; Schiedermayer, Holly ; Snavely, Michael ; Zarrasola, Stephanie ; Parrish, Susan ; Baker, Atlee ; Beckett, Alissa ; Belella, Carissa ; Bryant, Julie ; Conrad, Turner ; Fearnow, Adam ; Gomez, Carolina ; Herbstsomer, Robert A ; Hirsch, Sarah ; Johnson, Christen ; Jones, Melissa ; Kabaso, Rita ; Lemmon, Eric ; Vieira, Carolina Marques dos Santos ; McFarland, Darryl ; McLaughlin, Christopher ; Morgan, Abbie ; Musokotwane, Sepo ; Neutzling, William ; Nietmann, Jana ; Paluskievicz, Christina ; Penn, Jessica ; Peoples, Emily ; Pozmanter, Caitlin ; Reed, Emily ; Rigby, Nichole ; Schmidt, Lasse ; Shelton, Micah ; Shuford, Rebecca ; Tirasawasdichai, Tiara ; Undem, Blair ; Urick, Damian ; Vondy, Kayla ; Yarrington, Bryan ; Eckdahl, Todd T ; Poet, Jeffrey L ; Allen, Alica B ; Anderson, John E ; Barnett, Jason M ; Baumgardner, Jordan S ; Brown, Adam D ; Carney, Jordan E ; Chavez, Ramiro A ; Christgen, Shelbi L ; Christie, Jordan S ; Clary, Andrea N ; Conn, Michel A ; Cooper, Kristen M ; Crowley, Matt J ; Crowley, Samuel T ; Doty, Jennifer S ; Dow, Brian A ; Edwards, Curtis R ; Elder, Darcie D ; Fanning, John P ; Janssen, Bridget M ; Lambright, Anthony K ; Lane, Curtiss E ; Limle, Austin B ; Mazur, Tammy ; McCracken, Marly R ; McDonough, Alexa M ; Melton, Amy D ; Minnick, Phillip J ; Musick, Adam E ; Newhart, William H ; Noynaert, Joseph W ; Ogden, Bradley J ; Sandusky, Michael W ; Schmuecker, Samantha M ; Shipman, Anna L ; Smith, Anna L ; Thomsen, Kristen M ; Unzicker, Matthew R ; Vernon, William B ; Winn, Wesley W ; Woyski, Dustin S ; Zhu, Xiao ; Du, Chunguang ; Ament, Caitlin ; Aso, Soham ; Bisogno, Laura Simone ; Caronna, Jason ; Fefelova, Nadezhda ; Lopez, Lenin ; Malkowitz, Lorraine ; Marra, Jonathan ; Menillo, Daniella ; Obiorah, Ifeanyi ; Onsarigo, Eric Nyabeta ; Primus, Shekerah ; Soos, Mahdi ; Tare, Archana ; Zidan, Ameer ; Jones, Christopher J ; Aronhalt, Todd ; Bellush, James M ; Burke, Christa ; DeFazio, Steve ; Does, Benjamin R ; Johnson, Todd D ; Keysock, Nicholas ; Knudsen, Nelson H ; Messler, James ; Myirski, Kevin ; Rekai, Jade Lea ; Rempe, Ryan Michael ; Salgado, Michael S ; Stagaard, Erica ; Starcher, Justin R ; Waggoner, Andrew W ; Yemelyanova, Anastasia K ; Hark, Amy T ; Bertolet, Anne ; Kuschner, Cyrus E ; Parry, Kesley ; Quach, Michael ; Shantzer, Lindsey ; Shaw, Mary E ; Smith, Mary A ; Glenn, Omolara ; Mason, Portia ; Williams, Charlotte ; Key, S Catherine Silver ; Henry, Tyneshia C P ; Johnson, Ashlee G ; White, Jackie X ; Haberman, Adam ; Asinof, Sam ; Drumm, Kelly ; Freeburg, Trip ; Safa, Nadia ; Schultz, Darrin ; Shevin, Yakov ; Svoronos, Petros ; Vuong, Tam ; Wellinghoff, Jules ; Hoopes, Laura L M ; Chau, Kim M ; Ward, Alyssa ; Regisford, E Gloria C ; Augustine, LaJerald ; Davis-Reyes, Brionna ; Echendu, Vivienne ; Hales, Jasmine ; Ibarra, Sharon ; Johnson, Lauriaun ; Ovu, Steven ; Braverman, John M ; Bahr, Thomas J ; Caesar, Nicole M ; Campana, Christopher ; Cassidy, Daniel W ; Cognetti, Peter A ; English, Johnathan D ; Fadus, Matthew C ; Fick, Cameron N ; Freda, Philip J ; Hennessy, Bryan M ; Hockenberger, Kelsey ; Jones, Jennifer K ; King, Jessica E ; Knob, Christopher R ; Kraftmann, Karen J ; Li, Linghui ; Lupey, Lena N ; Minniti, Carl J ; Minton, Thomas F ; Moran, Joseph V ; Mudumbi, Krishna ; Nordman, Elizabeth C ; Puetz, William J ; Robinson, Lauren M ; Rose, Thomas J ; Sweeney, Edward P ; Timko, Ashley S ; Paetkau, Don W ; Eisler, Heather L ; Aldrup, Megan E ; Bodenberg, Jessica M ; Cole, Mara G ; Deranek, Kelly M ; DeShetler, Megan ; Dowd, Rose M ; Eckardt, Alexandra K ; Ehret, Sharon C ; Fese, Jessica ; Garrett, Amanda D ; Kammrath, Anna ; Kappes, Michelle L ; Light, Morgan R ; Meier, Anne C ; O’Rouke, Allison ; Perella, Mallory ; Ramsey, Kimberley ; Ramthun, Jennifer R ; Reilly, Mary T ; Robinett, Deirdre ; Rossi, Nadine L ; Schueler, Mary Grace ; Shoemaker, Emma ; Starkey, Kristin M ; Vetor, Ashley ; Vrable, Abby ; Chandrasekaran, Vidya ; Beck, Christopher ; Hatfield, Kristen R ; Herrick, Douglas A ; Khoury, Christopher B ; Lea, Charlotte ; Louie, Christopher A ; Lowell, Shannon M ; Reynolds, Thomas J ; Schibler, Jeanine ; Scoma, Alexandra H ; Smith-Gee, Maxwell T ; Tuberty, Sarah ; Smith, Christopher D ; Lopilato, Jane E ; Hauke, Jeanette ; Roecklein-Canfield, Jennifer A ; Corrielus, Maureen ; Gilman, Hannah ; Intriago, Stephanie ; Maffa, Amanda ; Rauf, Sabya A ; Thistle, Katrina ; Trieu, Melissa ; Winters, Jenifer ; Yang, Bib ; Hauser, Charles R ; Abusheikh, Tariq ; Ashrawi, Yara ; Benitez, Pedro ; Boudreaux, Lauren R ; Bourland, Megan ; Chavez, Miranda ; Cruz, Samantha ; Elliott, GiNell ; Farek, Jesse R ; Flohr, Sarah ; Flores, Amanda H ; Friedrichs, Chelsey ; Fusco, Zach ; Goodwin, Zane ; Helmreich, Eric ; Kiley, John ; Knepper, John Mark ; Langner, Christine ; Martinez, Megan ; Mendoza, Carlos ; Naik, Monal ; Ochoa, Andrea ; Ragland, Nicolas ; Raimey, England ; Rathore, Sunil ; Reza, Evangelina ; Sadovsky, Griffin ; Seydoux, Marie-Isabelle B ; Smith, Jonathan E ; Unruh, Anna K ; Velasquez, Vicente ; Wolski, Matthew W ; Gosser, Yuying ; Govind, Shubha ; Clarke-Medley, Nicole ; Guadron, Leslie ; Lau, Dawn ; Lu, Alvin ; Mazzeo, Cheryl ; Meghdari, Mariam ; Ng, Simon ; Pamnani, Brad ; Plante, Olivia ; Shum, Yuki Kwan Wa ; Song, Roy ; Johnson, Diana E ; Abdelnabi, Mai ; Archambault, Alexi ; Chamma, Norma ; Gaur, Shailly ; Hammett, Deborah ; Kandahari, Adrese ; Khayrullina, Guzal ; Kumar, Sonali ; Lawrence, Samantha ; Madden, Nigel ; Mandelbaum, Max ; Milnthorp, Heather ; Mohini, Shiv ; Patel, Roshni ; Peacock, Sarah J ; Perling, Emily ; Quintana, Amber ; Rahimi, Michael ; Ramirez, Kristen ; Singhal, Rishi ; Weeks, Corinne ; Wong, Tiffany ; Gillis, Aubree T ; Moore, Zachary D ; Savell, Christopher D ; Watson, Reece ; Mel, Stephanie F ; Anilkumar, Arjun A ; Bilinski, Paul ; Castillo, Rostislav ; Closser, Michael ; Cruz, Nathalia M ; Dai, Tiffany ; Garbagnati, Giancarlo F ; Horton, Lanor S ; Kim, Dongyeon ; Lau, Joyce H ; Liu, James Z ; Mach, Sandy D ; Phan, Thu A ; Ren, Yi ; Stapleton, Kenneth E ; Strelitz, Jean M ; Sunjed, Ray ; Stamm, Joyce ; Anderson, Morgan C ; Bonifield, Bethany Grace ; Coomes, Daniel ; Dillman, Adam ; Durchholz, Elaine J ; Fafara-Thompson, Antoinette E ; Gross, Meleah J ; Gygi, Amber M ; Jackson, Lesley E ; Johnson, Amy ; Kocsisova, Zuzana ; Manghelli, Joshua L ; McNeil, Kylie ; Murillo, Michael ; Naylor, Kierstin L ; Neely, Jessica ; Ogawa, Emmy E ; Rich, Ashley ; Rogers, Anna ; Spencer, J Devin ; Stemler, Kristina M ; Throm, Allison A ; Van Camp, Matt ; Weihbrecht, Katie ; Wiles, T Aaron ; Williams, Mallory A ; Williams, Matthew ; Zoll, Kyle ; Bailey, Cheryl ; Zhou, Leming ; Balthaser, Darla M ; Bashiri, Azita ; Bower, Mindy E ; Florian, Kayla A ; Ghavam, Nazanin ; Greiner-Sosanko, Elizabeth S ; Karim, Helmet ; Mullen, Victor W ; Pelchen, Carly E ; Yenerall, Paul M ; Zhang, Jiayu ; Rubin, Michael R ; Arias-Mejias, Suzette M ; Bermudez-Capo, Armando G ; Bernal-Vega, Gabriela V ; Colon-Vazquez, Mariela ; Flores-Vazquez, Arelys ; Gines-Rosario, Mariela ; Llavona-Cartagena, Ivan G ; Martinez-Rodriguez, Javier O ; Ortiz-Fuentes, Lionel ; Perez-Colomba, Eliezer O ; Perez-Otero, Joseph ; Rivera, Elisandra ; Rodriguez-Giron, Luke J ; Santiago-Sanabria, Arnaldo J ; Senquiz-Gonzalez, Andrea M ; delValle, Frank R Soto ; Vargas-Franco, Dorianmarie ; Velázquez-Soto, Karla I ; Zambrana-Burgos, Joan D ; Martinez-Cruzado, Juan Carlos ; Asencio-Zayas, Lillyann ; Babilonia-Figueroa, Kevin ; Beauchamp-Pérez, Francis D ; Belén-Rodríguez, Juliana ; Bracero-Quiñones, Luciann ; Burgos-Bula, Andrea P ; Collado-Méndez, Xavier A ; Colón-Cruz, Luis R ; Correa-Muller, Ana I ; Crooke-Rosado, Jonathan L ; Cruz-García, José M ; Defendini-Ávila, Marianna ; Delgado-Peraza, Francheska M ; Feliciano-Cancela, Alex J ; Gónzalez-Pérez, Valerie M ; Guiblet, Wilfried ; Heredia-Negrón, Aldo ; Hernández-Muñiz, Jennifer ; Irizarry-González, Lourdes N ; Laboy-Corales, Ángel L ; Llaurador-Caraballo, Gabriela A ; Marín-Maldonado, Frances ; Marrero-Llerena, Ulises ; Martell-Martínez, Héctor A ; Martínez-Traverso, Idaliz M ; Medina-Ortega, Kiara N ; Méndez-Castellanos, Sonya G ; Menéndez-Serrano, Krizia C ; Morales-Caraballo, Carol I ; Ortiz-DeChoudens, Saryleine ; Ortiz-Ortiz, Patricia ; Pagán-Torres, Hendrick ; Pérez-Afanador, Diana ; Quintana-Torres, Enid M ; Ramírez-Aponte, Edwin G ; Riascos-Cuero, Carolina ; Rivera-Llovet, Michelle S ; Rivera-Pagán, Ingrid T ; Rivera-Vicéns, Ramón E ; Robles-Juarbe, Fabiola ; Rodríguez-Bonilla, Lorraine ; Rodríguez-Echevarría, Brian O ; Rodríguez-García, Priscila M ; Rodríguez-Laboy, Abneris E ; Rodríguez-Santiago, Susana ; Rojas-Vargas, Michael L ; Rubio-Marrero, Eva N ; Santiago-Colón, Albeliz ; Santiago-Ortiz, Jorge L ; Santos-Ramos, Carlos E ; Serrano-González, Joseline ; Tamayo-Figueroa, Alina M ; Tascón-Peñaranda, Edna P ; Torres-Castillo, José L ; Valentín-Feliciano, Nelson A ; Valentín-Feliciano, Yashira M ; Vargas-Barreto, Nadyan M ; Vélez-Vázquez, Miguel ; Vilanova-Vélez, Luis R ; Zambrana-Echevarría, Cristina ; MacKinnon, Christy ; Chung, Hui-Min ; Kay, Chris ; Pinto, Anthony ; Kopp, Olga R ; Burkhardt, Joshua ; Harward, Chris ; Allen, Robert ; Bhat, Pavan ; Chang, Jimmy Hsiang-Chun ; Chen, York ; Chesley, Christopher ; Cohn, Dara ; DuPuis, David ; Fasano, Michael ; Fazzio, Nicholas ; Gavinski, Katherine ; Gebreyesus, Heran ; Giarla, Thomas ; Gostelow, Marcus ; Greenstein, Rachel ; Gunasinghe, Hashini ; Hanson, Casey ; Hay, Amanda ; He, Tao Jian ; Homa, Katie ; Howe, Ruth ; Howenstein, Jeff ; Huang, Henry ; Khatri, Aaditya ; Kim, Young Lu ; Knowles, Olivia ; Kong, Sarah ; Krock, Rebecca ; Kroll, Matt ; Kuhn, Julia ; Kwong, Matthew ; Lee, Brandon ; Lee, Ryan ; Levine, Kevin ; Li, Yedda ; Liu, Bo ; Liu, Lucy ; Liu, Max ; Lousararian, Adam ; Ma, Jimmy ; Mallya, Allyson ; Manchee, Charlie ; Marcus, Joseph ; McDaniel, Stephen ; Miller, Michelle L ; Molleston, Jerome M ; Diez, Cristina Montero ; Ng, Patrick ; Ngai, Natalie ; Nguyen, Hien ; Nylander, Andrew ; Pollack, Jason ; Rastogi, Suchita ; Reddy, Himabindu ; Regenold, Nathaniel ; Sarezky, Jon ; Schultz, Michael ; Shim, Jien ; Skorupa, Tara ; Smith, Kenneth ; Spencer, Sarah J ; Srikanth, Priya ; Stancu, Gabriel ; Stein, Andrew P ; Strother, Marshall ; Sudmeier, Lisa ; Sun, Mengyang ; Sundaram, Varun ; Tazudeen, Noor ; Tseng, Alan ; Tzeng, Albert ; Venkat, Rohit ; Venkataram, Sandeep ; Waldman, Leah ; Wang, Tracy ; Yang, Hao ; Yu, Jack Y ; Zheng, Yin ; Preuss, Mary L ; Garcia, Angelica ; Juergens, Matt ; Morris, Robert W ; Nagengast, Alexis A ; Azarewicz, Julie ; Carr, Thomas J ; Chichearo, Nicole ; Colgan, Mike ; Donegan, Megan ; Gardner, Bob ; Kolba, Nik ; Krumm, Janice L ; Lytle, Stacey ; MacMillian, Laurell ; Miller, Mary ; Montgomery, Andrew ; Moretti, Alysha ; Offenbacker, Brittney ; Polen, Mike ; Toth, John ; Woytanowski, John ; Kadlec, Lisa ; Crawford, Justin ; Spratt, Mary L ; Adams, Ashley L ; Barnard, Brianna K ; Cheramie, Martin N ; Eime, Anne M ; Golden, Kathryn L ; Hawkins, Allyson P ; Hill, Jessica E ; Kampmeier, Jessica A ; Kern, Cody D ; Magnuson, Emily E ; Miller, Ashley R ; Morrow, Cody M ; Peairs, Julia C ; Pickett, Gentry L ; Popelka, Sarah A ; Scott, Alexis J ; Teepe, Emily J ; TerMeer, Katie A ; Watchinski, Carmen A ; Watson, Lucas A ; Weber, Rachel E ; Woodard, Kate A ; Barnard, Daron C ; Appiah, Isaac ; Giddens, Michelle M ; McNeil, Gerard P ; Adebayo, Adeola ; Bagaeva, Kate ; Chinwong, Justina ; Dol, Chrystel ; George, Eunice ; Haltaufderhyde, Kirk ; Haye, Joanna ; Kaur, Manpreet ; Semon, Max ; Serjanov, Dmitri ; Toorie, Anika ; Wilson, Christopher ; Riddle, Nicole C ; Buhler, Jeremy ; Mardis, Elaine R ; Elgin, Sarah C R

Published: Oxford University Press (OUP), 2015

Language: English

DOI: 10.1534/g3.114.015966

ISSN: 2160-1836

Origination:

Footnote:

Description: AbstractThe Muller F element (4.2 Mb, ~80 protein-coding genes) is an unusual autosome of Drosophila melanogaster; it is mostly heterochromatic with a low recombination rate. To investigate how these properties impact the evolution of repeats and genes, we manually improved the sequence and annotated the genes on the D. erecta, D. mojavensis, and D. grimshawi F elements and euchromatic domains from the Muller D element. We find that F elements have greater transposon density (25–50%) than euchromatic reference regions (3–11%). Among the F elements, D. grimshawi has the lowest transposon density (particularly DINE-1: 2% vs. 11–27%). F element genes have larger coding spans, more coding exons, larger introns, and lower codon bias. Comparison of the Effective Number of Codons with the Codon Adaptation Index shows that, in contrast to the other species, codon bias in D. grimshawi F element genes can be attributed primarily to selection instead of mutational biases, suggesting that density and types of transposons affect the degree of local heterochromatin formation. F element genes have lower estimated DNA melting temperatures than D element genes, potentially facilitating transcription through heterochromatin. Most F element genes (~90%) have remained on that element, but the F element has smaller syntenic blocks than genome averages (3.4–3.6 vs. 8.4–8.8 genes per block), indicating greater rates of inversion despite lower rates of recombination. Overall, the F element has maintained characteristics that are distinct from other autosomes in the Drosophila lineage, illuminating the constraints imposed by a heterochromatic milieu.

Access State: Open Access