• Media type: Electronic Thesis; E-Book; Doctoral Thesis
  • Title: Scalable Simulation and Optimization Methods for Differential Equation Models describing Biochemical Reaction Networks ; Skalierbare Methoden zu Simulation und Optimierung von Differentialgleichungsmodellen von Biochemischen Reaktionsnetzwerken
  • Contributor: Fröhlich, Fabian [Author]
  • imprint: Technical University of Munich; Technische Universität München, 2018-04-25
  • Language: English
  • Keywords: Mathematik ; Optimierung ; Differentialgleichung ; Biologie ; Parameterschätzung ; differential equations ; constrained optimization ; biochemische Reaktionsnetzwerke ; biochemical reaction networks ; parameter estimation ; Biowissenschaften
  • Origination:
  • Footnote: Diese Datenquelle enthält auch Bestandsnachweise, die nicht zu einem Volltext führen.
  • Description: In this thesis, I developed scalable methods for simulation and parameter estimation for differential equation models of biochemical reaction networks. I formulated the parameter estimation problem for stochastic models and models with discrete events. Moreover, I developed efficient methods that scale well with respect to the number of parameters and state variables and applied them to models with hundreds of state variables and thousands of parameters. ; In dieser Dissertation habe ich skalierbare Methoden zur Simulation und Parameterschätzung für Differentialgleichungsmodelle von biochemischen Reaktionsnetzwerken entwickelt. Ich habe das Parameterschätzungsproblem für stochastischer Modelle und Modelle mit diskreten Ereignissen formuliert. Außerdem habe ich effiziente Methoden für die Parameterschätzung die gut mit der Anzahl an Parametern und Zustandsvariablen skalieren entwickelt und auf Modelle mit hunderten Parametern und tausenden Zustandsvariablen angewendet.
  • Access State: Open Access