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Dans un passage du Contra Christianos (fr . 39 Harnack), Porphyre présentait Origène le Chrétien comme un apostat de l'Hellénisme et comme un ancien disciple d'Ammonius, le maître de Plotin. Eusèbe cite ce passage comme preuve de l'excellente formation philosophique reçue par Origène et de sa célébrité chez les auteurs profanes. Mais l'analyse du Livre IV de l'Histoire ecclésiastique montre que la documentation dont disposait Eusèbe ne lui permettait pas de confirmer personnellement le témoignage de Porphyre. Lorsqu'on se rappelle que Porphyre a connu un autre Origène qui fut, lui, vraiment paien et vraiment disciple d'Ammonius, il devient légitime de se demander s'il n'a pas confondu les deux personnages. Or l'hypothèse de cette confusion est historiquement admissible, principalement pour l'époque de la composition du Contra Christianos. La remise en question du témoignage de Porphyre invite à se représenter différemment la carrière intellectuelle d'Origène et interdit de retrouver trop facilement dans la pensée d'Origène un reflet de l'enseignement d'Ammonius.