Beschreibung:
5-HT3B ist eine Untereinheit des Serotoninrezeptors Typ 3 (5-HT3), einem Ionenkanal aus der Cys-loop-Rezeptorfamilie. Das Gen HTR3B kodiert für 5-HT3B. Der -100_-102delAAG-Polymorphismus im HTR3B-Promotor kann die HTR3B-Promotoraktivität beeinflussen und wurde mit Häufigkeit und Schweregrad von Chemotherapie-induzierter Übelkeit und Erbrechen unter der Antiemetik-Therapie mit 5-HT3-Rezeptorantagonisten assoziiert. Es ist wenig über die transkriptionelle Regulation des HTR3B-Gens und über den Mechanismus, wie der -100_-102delAAG-Polymorphismus die HTR3B-Expression beeinflusst, bekannt. Der Promotor des Ratten-Htr3B-Gens wurde in der Ratten-Phäochromozytom-Zelllinie PC-12 und in der menschlichen Zelllinie HEK-293 charakterisiert. Dafür wurden RACE-basierte Transkriptionsstartseitenanalysen, in vitro- und in vivo-DNA-Methylierungsanalysen, bioinformatische Analysen, DNase I Hypersensitivity Assays, Electrophoretic Mobility Shift Assays (EMSAs) sowie Luciferase-Reportergenversuche inkl. ortspezifischer Mutationen und Proteinüberexpressionen benutzt. Um im -100_-102delAAG-Bereich bindende Proteine zu identifizieren, wurden EMSAs sowie eine Affinitätsaufreinigung gekoppelt mit einer massenspektrometrischen Analyse benutzt. Das Ratten-Htr3B-Gen hat multiple Transkriptionsstartseiten (TSS), aber keine kanonisch angeordneten Kernpromotorelemente ...