Pfaffe, Philip
[Verfasser:in];
Tillmann, Martin
[Verfasser:in];
Lutteropp, Sarah
[Verfasser:in];
Scheirle, Bernhard
[Verfasser:in];
Zerr, Kevin
[Verfasser:in]
Beteiligte:
Pfaffe, Philip
[Verfasser:in];
Tillmann, Martin
[Verfasser:in];
Lutteropp, Sarah
[Verfasser:in];
Scheirle, Bernhard
[Verfasser:in];
Zerr, Kevin
[Verfasser:in]
Erschienen:
KITopen (Karlsruhe Institute of Technologie), 2016-09-06
Anmerkungen:
Diese Datenquelle enthält auch Bestandsnachweise, die nicht zu einem Volltext führen.
Beschreibung:
We explore the benefits of parallelizing 7 state-of-the-art string matching algorithms. Using SIMD and multi-threading techniques we achieve a significant performance improvement of up to 43.3x over reference implementations and a speedup of up to 16.7x over the string matching program grep. We evaluate our implementations on the smart-corpora and the full human genome data set. We show scalability over number of threads and impact of pattern length.