• Medientyp: unbewegtes Bild; E-Book; Elektronische Hochschulschrift; Sonstige Veröffentlichung
  • Titel: Geometric deep learning for structural bioinformatics ; Apprentissage profond géométrique pour la bioinformatique structurale
  • Beteiligte: Mallet, Vincent [VerfasserIn]
  • Erschienen: theses.fr, 2022-11-16
  • Sprache: Englisch
  • Schlagwörter: Structural bioinformatics ; Drug design ; Apprentissage profond géométrique ; Geometric deep learning
  • Entstehung:
  • Anmerkungen: Diese Datenquelle enthält auch Bestandsnachweise, die nicht zu einem Volltext führen.
  • Beschreibung: L'apprentissage automatique a permis plusieurs percées dans la gestion des données tabulaires, d'images ou de texte. Il a également commencé à aider la science, par exemple avec Alphafold, mais son application aux questions scientifiques n'est pas immédiate. Le premier défi consiste à modéliser des objets naturels avec des objets mathématiques représentés dans un ordinateur - comme des images - tout en respectant leurs propriétés physiques. Le deuxième défi est d'étendre les méthodes d'apprentissage à de nouveaux objets mathématiques et numériques avec plus de structure, un domaine de recherche connu sous le nom d'apprentissage profond géométrique. Avoir un éventail plus large d'objets mathématiques nous donne plus de liberté pour modéliser efficacement nos objets naturels pour l'apprentissage automatique. La biologie structurale est un domaine scientifique visant à comprendre le vivant en utilisant les structures tridimensionnelles de molécules importantes, disponibles grâce à des outils expérimentaux et informatiques. Ce domaine s'appuie donc sur des données structurées qui pourraient se prêter à l'apprentissage automatique si les deux défis ci-dessus étaient relevés. Parmi les principales applications de la biologie structurale figure la découverte de médicaments, qui vise à trouver de potentiels médicaments dans un vaste espace de composés chimiques. Dans l'approche centrée sur les cibles thérapeutiques, les structures tridimensionnelles de celles-ci sont utilisées pour sélectionner ces potentiels médicaments. Cette approche pourrait être révolutionnée par l'utilisation de l'apprentissage profond géométrique. Nous commençons par un apport méthodologique qui permet de respecter la structure des molécules d'ADN représentées sous forme de chaînes de caractères. En effet, une telle représentation néglige la symétrie du brin complémentaire qui découle de l'appariement des deux brins de l'ADN. En utilisant la théorie de l'équivariance, nous caractérisons la classe de modèles d'apprentissage automatique qui ...
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