> Detailanzeige

Clawson, Hiram; Lee, Brian T.; Raney, Brian J.; Barber, Galt P.; Casper, Jonathan; Diekhans, Mark; Fischer, Clay; Gonzalez, Jairo Navarro; Hinrichs, Angie S.; Lee, Christopher M.; Nassar, Luis R.; Perez, Gerardo; Wick, Brittney; Schmelter, Daniel; Speir, Matthew L.; Armstrong, Joel; Zweig, Ann S.; Kuhn, Robert M.; Kirilenko, Bogdan M.; Hiller, Michael; Haussler, David; Kent, W. James; Haeussler, Maximilian

GenArk: towards a million UCSC genome browsers

Literatur-
verwaltung

Zur
Merkliste

Lösche von
Merkliste

Per Whatsapp teilen

Schließen

Merkliste



Sie können Bookmarks mittels Listen verwalten, loggen Sie sich dafür bitte in Ihr SLUB Benutzerkonto ein.
  • Medientyp: E-Artikel
  • Titel: GenArk: towards a million UCSC genome browsers
  • Beteiligte: Clawson, Hiram; Lee, Brian T.; Raney, Brian J.; Barber, Galt P.; Casper, Jonathan; Diekhans, Mark; Fischer, Clay; Gonzalez, Jairo Navarro; Hinrichs, Angie S.; Lee, Christopher M.; Nassar, Luis R.; Perez, Gerardo; Wick, Brittney; Schmelter, Daniel; Speir, Matthew L.; Armstrong, Joel; Zweig, Ann S.; Kuhn, Robert M.; Kirilenko, Bogdan M.; Hiller, Michael; Haussler, David; Kent, W. James; Haeussler, Maximilian
  • Erschienen: Springer Science and Business Media LLC, 2023
  • Erschienen in: Genome Biology, 24 (2023) 1
  • Sprache: Englisch
  • DOI: 10.1186/s13059-023-03057-x
  • ISSN: 1474-760X
  • Entstehung:
  • Anmerkungen:
  • Beschreibung: AbstractInteractive graphical genome browsers are essential tools in genomics, but they do not contain all the recent genome assemblies. We create Genome Archive (GenArk) collection of UCSC Genome Browsers from NCBI assemblies. Built on our established track hub system, this enables fast visualization of annotations. Assemblies come with gene models, repeat masks, BLAT, and in silico PCR. Users can add annotations via track hubs and custom tracks. We can bulk-import third-party resources, demonstrated with TOGA and Ensembl gene models for hundreds of assemblies.Three thousand two hundred sixty-nine GenArk assemblies are listed at https://hgdownload.soe.ucsc.edu/hubs/ and can be searched for on the Genome Browser gateway page.
  • Zugangsstatus: Freier Zugang