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  1. Gianfrotta, Coline [Verfasser:in]; Reinharz, Vladimir [Verfasser:in]; Barth, Dominique [Verfasser:in]; Denise, Alain [Verfasser:in] ; Coline Gianfrotta and Vladimir Reinharz and Dominique Barth and Alain Denise [Mitwirkende:r]

    A Graph-Based Similarity Approach to Classify Recurrent Complex Motifs from Their Context in RNA Structures

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    Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik, 2021

  2. Gianfrotta, Coline [Verfasser:in] ; université Paris-Saclay [Mitwirkende:r]; Barth, Dominique [Mitwirkende:r]; Denise, Alain [Mitwirkende:r]

    Modélisation, analyse et classification de motifs structuraux d'ARN à partir de leur contexte, par des méthodes d'algorithmique de graphes ; Modeling, analysis and classification of RNA structural motifs from their context, using graph algorithmic methods

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    theses.fr, 2022-10-10

  4. Saaidi, Afaf [Verfasser:in] ; Université Paris-Saclay (ComUE) [Mitwirkende:r]; Régnier, Mireille [Mitwirkende:r]; Ponty, Yann [Mitwirkende:r]

    Multi-dimensional probing for RNA secondary structure(s) prediction ; Analyse différentielle de données de sondage pour la prédiction des structures d'acides ribonucléiques

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    theses.fr, 2018-10-01

  7. Gallopin, Mélina [Verfasser:in] ; Université Paris-Saclay (ComUE) [Mitwirkende:r]; Celeux, Gilles [Mitwirkende:r]; Jaffrézic, Florence [Mitwirkende:r]

    Classification et inférence de réseaux pour les données RNA-seq ; Clustering and network inference for RNA-seq data

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    theses.fr, 2015-12-09

  8. Hoinka, Jan [Verfasser:in]

    Aptamers in the age of big data : development and application of algorithmic solutions in the field of high-throughput systematic evolution of ligands by exponental enrichment

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    Freiburg im Breisgau, 3. August 2016

  13. Kaczkowski, Bogumił [Verfasser:in]; Torarinsson, Elfar [Verfasser:in]; Reiche, Kristin [Verfasser:in]; Havgaard, Jakob Hull [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]; Gorodkin, Jan [Verfasser:in]

    Structural profiles of human miRNA families from pairwise clustering

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    2009

    Erschienen in: Bioinformatics ; 25 (2009), 3, Seite 291-294

  14. Li, Mingyao [Verfasser:in] ; Ionita-Laza, Iuliana (Organisation) [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]; Lee, Hongzhe (Organisation) [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]; Quintana-Murci, Lluis (Organisation) [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]; Sun, Lei (Organisation) [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]

    Deep learning enables accurate clustering and batch effect removal in single-cell RNA-seq analysis

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    [Erscheinungsort nicht ermittelbar]: Banff International Research Station (BIRS) for Mathematical Innovation and Discovery, 2019

    Erschienen in: The Role of Genomics and Metagenomics in Human Health: Recent Developments in Statistical and Computational Methods (19w5128) ; (Jan. 2019)

  15. Will, Sebastian [Verfasser:in]; Reiche, Kristin [Verfasser:in]; Hofacker, Ivo L. [Verfasser:in]; Stadler, Peter F. [Verfasser:in]; Backofen, Rolf [Verfasser:in]

    Inferring Non-Coding RNA Families and Classes by Means of Genome-Scale Structure-Based Clustering

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    2007

    Erschienen in: PLOS Computational Biology

  16. Haar, Janina [Verfasser:in]; Contrant, Maud [Verfasser:in]; Bernhardt, Katharina [Verfasser:in]; Feederle, Regina [Verfasser:in]; Diederichs, Sven [Verfasser:in]; Pfeffer, Sébastien [Verfasser:in]; Delecluse, Henri-Jacques [Verfasser:in]

    The expression of a viral microRNA is regulated by clustering to allow optimal B cell transformation

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    Oxford: Oxford University Press, 2016

    Erschienen in: Nucleic acids research ; 44, 3 (2016) 1326-1341

  20. Le Faucheur, X.; Hershkovits, E.; Tannenbaum, R.; Tannenbaum, A.

    Nonparametric Clustering for Studying RNA Conformations

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    Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2011

    Erschienen in: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 8 (2011) 6, Seite 1604-1619